RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 S4R3F8 94 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAC1Q96KF2 57 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 M0R2T5 61 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 DMAC1Q96GE9 116 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-202ENST00000392011 TENM3Q9P273 2699 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-202ENST00000392011 R4GN34 69 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP4-202ENST00000392011 M0QZ58 72 aa9.76□□□□□ -0.85
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SH3BP4-202ENST00000392011 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP4-202ENST00000392011 ROMO1P60602 79 aa9.69□□□□□ -0.86
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SH3BP4-202ENST00000392011 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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SH3BP4-202ENST00000392011 A6NN06 94 aa9.45□□□□□ -0.9
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SH3BP4-202ENST00000392011 H3BS24 57 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.4□□□□□ -0.91
SH3BP4-202ENST00000392011 PLAC4Q8WY50 150 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC3AQ02505 3323 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-202ENST00000392011 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.29□□□□□ -0.92
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SH3BP4-202ENST00000392011 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-202ENST00000392011 XP32Q5T750 250 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFHX3Q15911 3703 aa9.15□□□□□ -0.94
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SH3BP4-202ENST00000392011 CUBNO60494 3623 aa9.08□□□□□ -0.96
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SH3BP4-202ENST00000392011 FBN3Q75N90 2809 aa8.96□□□□□ -0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFAF8A1L188 74 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GVY2 172 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 TPRXLQ17RH7 258 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 P0C880 135 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 COL7A1Q02388 2944 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-8P60410 259 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP4-202ENST00000392011 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PP632Q6XCG6 107 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-10P60014 251 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP12-2P59991 146 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP12-1P59990 96 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 BSNQ9UPA5 3926 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 MT1HL1P0DM35 61 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS13CQ709C8 3753 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.95□□□□□ -1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.94□□□□□ -1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.93□□□□□ -1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.76□□□□□ -1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.65□□□□□ -1.18
SH3BP4-202ENST00000392011 DNHD1Q96M86 4753 aa7.64□□□□□ -1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-202ENST00000392011 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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