RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-202ENST00000366197 OXTP01178 125 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-202ENST00000366197 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-202ENST00000366197 NF1P21359 2839 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF548-202ENST00000366197 Q5VV11 94 aa5.97□□□□□ -1.45
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ZNF548-202ENST00000366197 M0QZ58 72 aa5.96□□□□□ -1.46
ZNF548-202ENST00000366197 Q5XG85 94 aa5.95□□□□□ -1.46
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ZNF548-202ENST00000366197 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.94□□□□□ -1.46
ZNF548-202ENST00000366197 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.93□□□□□ -1.46
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ZNF548-202ENST00000366197 TENM2Q9NT68 2774 aa5.86□□□□□ -1.47
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ZNF548-202ENST00000366197 A8MU10 97 aa5.65□□□□□ -1.5
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ZNF548-202ENST00000366197 DNHD1Q96M86 4753 aa4.96□□□□□ -1.62
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ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.72□□□□□ -1.65
ZNF548-202ENST00000366197 AKAP9Q99996 3911 aa4.72□□□□□ -1.65
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.68□□□□□ -1.66
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.64□□□□□ -1.67
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.64□□□□□ -1.67
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.63□□□□□ -1.67
ZNF548-202ENST00000366197 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.62□□□□□ -1.67
ZNF548-202ENST00000366197 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.62□□□□□ -1.67
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