RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa11.61□□□□□ -0.55
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa11.6□□□□□ -0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.57□□□□□ -0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TENM4Q6N022 2769 aa11.52□□□□□ -0.57
CCSAP-201ENST00000284617 FRYLO94915 3013 aa11.52□□□□□ -0.57
CCSAP-201ENST00000284617 SZT2Q5T011 3432 aa11.51□□□□□ -0.57
CCSAP-201ENST00000284617 LRBAP50851 2863 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-201ENST00000284617 REV3LO60673 3130 aa11.48□□□□□ -0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.46□□□□□ -0.57
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF8A1L188 74 aa11.42□□□□□ -0.58
CCSAP-201ENST00000284617 LAMA1P25391 3075 aa11.41□□□□□ -0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TNP1P09430 55 aa11.4□□□□□ -0.58
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.39□□□□□ -0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ZZEF1O43149 2961 aa11.38□□□□□ -0.59
CCSAP-201ENST00000284617 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.38□□□□□ -0.59
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.37□□□□□ -0.59
CCSAP-201ENST00000284617 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.31□□□□□ -0.6
CCSAP-201ENST00000284617 VCANP13611 3396 aa11.31□□□□□ -0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZANQ9Y493 2812 aa11.26□□□□□ -0.61
CCSAP-201ENST00000284617 XP32Q5T750 250 aa11.23□□□□□ -0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PP632Q6XCG6 107 aa11.22□□□□□ -0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.21□□□□□ -0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.2□□□□□ -0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TENM3Q9P273 2699 aa11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-201ENST00000284617 H0YAA0 97 aa11.16□□□□□ -0.62
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf95Q9H7T3 257 aa11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-201ENST00000284617 COL6A3P12111 3177 aa11.13□□□□□ -0.63
CCSAP-201ENST00000284617 EYSQ5T1H1 3165 aa11.12□□□□□ -0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.07□□□□□ -0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TPRXLQ17RH7 258 aa11.02□□□□□ -0.64
CCSAP-201ENST00000284617 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCSAP-201ENST00000284617 P0C880 135 aa10.96□□□□□ -0.65
CCSAP-201ENST00000284617 NF1P21359 2839 aa10.96□□□□□ -0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FBN2P35556 2912 aa10.96□□□□□ -0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-8P60410 259 aa10.95□□□□□ -0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.95□□□□□ -0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.87□□□□□ -0.67
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVY2 172 aa10.83□□□□□ -0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TGP01266 2768 aa10.81□□□□□ -0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SPEGQ15772 3267 aa10.77□□□□□ -0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DMXL1Q9Y485 3027 aa10.76□□□□□ -0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TENM2Q9NT68 2774 aa10.71□□□□□ -0.69
CCSAP-201ENST00000284617 USP34Q70CQ2 3546 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-10P60014 251 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.62□□□□□ -0.71
CCSAP-201ENST00000284617 PRO2289Q9P1D8 64 aa10.6□□□□□ -0.71
CCSAP-201ENST00000284617 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.56□□□□□ -0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD2O15018 2839 aa10.44□□□□□ -0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.43□□□□□ -0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP12-2P59991 146 aa10.43□□□□□ -0.74
CCSAP-201ENST00000284617 VWFP04275 2813 aa10.33□□□□□ -0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.31□□□□□ -0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP12-1P59990 96 aa10.3□□□□□ -0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.27□□□□□ -0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.15□□□□□ -0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RELNP78509 3460 aa10.07□□□□□ -0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CCSAP-201ENST00000284617 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.05□□□□□ -0.8
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-201ENST00000284617 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MUC3AQ02505 3323 aa10□□□□□ -0.81
CCSAP-201ENST00000284617 LAMA5O15230 3695 aa9.96□□□□□ -0.82
CCSAP-201ENST00000284617 DMDP11532 3685 aa9.93□□□□□ -0.82
CCSAP-201ENST00000284617 FBN3Q75N90 2809 aa9.91□□□□□ -0.82
CCSAP-201ENST00000284617 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.86□□□□□ -0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.84□□□□□ -0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.8□□□□□ -0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.8□□□□□ -0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.77□□□□□ -0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.66□□□□□ -0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MT1HL1P0DM35 61 aa9.66□□□□□ -0.86
CCSAP-201ENST00000284617 COL7A1Q02388 2944 aa9.64□□□□□ -0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.62□□□□□ -0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.59□□□□□ -0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.51□□□□□ -0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZFHX3Q15911 3703 aa9.47□□□□□ -0.89
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CCSAP-201ENST00000284617 INE1O15225 51 aa9.41□□□□□ -0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-12P60413 245 aa9.36□□□□□ -0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.27□□□□□ -0.93
CCSAP-201ENST00000284617 BSNQ9UPA5 3926 aa9.27□□□□□ -0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.26□□□□□ -0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.22□□□□□ -0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.17□□□□□ -0.94
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP12-3P60328 96 aa9.15□□□□□ -0.94
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.12□□□□□ -0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CUBNO60494 3623 aa9.05□□□□□ -0.96
CCSAP-201ENST00000284617 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CCSAP-201ENST00000284617 LCE3AQ5TA76 89 aa9□□□□□ -0.97
CCSAP-201ENST00000284617 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.96□□□□□ -0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms