RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	YIL077C	P40508	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	IRC6	P43615	237 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MNT2	P53059	558 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YGL242C	P53066	181 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MRPL50	P53724	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SMA1	Q02651	245 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PET122	P10355	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RAP1	P11938	827 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SFL1	P20134	766 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	COT1	P32798	439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GYP6	P32806	458 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	NPL6	P32832	435 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SPC29	P33419	253 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	OCT1	P35999	772 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SAW1	P39735	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YEL068C	P39977	110 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PGA2	P53903	129 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MGR3	Q04472	501 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	LDB19	Q12502	818 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GPT2	P36148	743 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ERT1	P38140	529 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YFL066C	P43538	392 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YGR012W	P53206	393 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	AIM32	Q04689	311 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GTO3	Q04806	366 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YLR455W	Q06188	304 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YEH2	Q07950	538 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TLG2	Q08144	397 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	OPI10	Q08202	246 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RAD61	Q99359	647 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SIR3	P06701	978 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KAR9	P32526	644 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KAP122	P32767	1081 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RMR1	P53060	241 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MRS2	Q01926	470 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RSF1	Q05043	376 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BSC2	Q05611	235 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VPS38	Q05919	439 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YLR456W	Q06199	204 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SRN2	Q99176	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ADH4	P10127	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	MRPS28	P21771	286 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	COQ8	P27697	501 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	MSP1	P28737	362 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YKU70	P32807	602 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SLC1	P33333	303 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PCH2	P38126	564 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	CHK1	P38147	527 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	MMS4	P38257	691 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	BSD2	P38356	321 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	VHR1	P40522	640 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	TED1	P40533	473 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	ERR3	P42222	437 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	STB2	P46679	850 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	HFM1	P51979	1187 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	GOR1	P53839	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YNL181W	P53878	407 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	GCR2	Q01722	534 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	ATC1	Q04005	294 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	DCS1	Q06151	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YFT2	Q06676	274 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PUN1	Q06991	263 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YOL036W	Q08206	761 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	OXR1	Q08952	273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	ATP16	Q12165	160 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	HER1	Q12276	1246 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PCD1	Q12524	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	CAN1	P04817	590 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	DSF1	P0CX08	502 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YNR073C	P0CX09	502 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	NMT1	P14743	455 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
PXA1	YPL147W	YKL069W	P36088	180 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PIG2	P40187	538 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SOK1	P40317	901 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SYG1	P40528	902 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	NPY1	P53164	384 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.3 ms