RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	RBA50	Q04418	439 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	GAD1	Q04792	585 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MCM21	Q06675	368 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	APC5	Q08683	685 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ACF2	Q12168	779 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ULS1	Q08562	1619 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ADH4	P10127	382 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	NIP100	P33420	868 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PTH2	P34222	208 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PPS1	P38148	807 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YBR242W	P38331	238 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YHR112C	P38716	378 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YHL017W	P38745	532 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MGS1	P40151	587 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	STB1	P42845	420 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	TRS85	P46944	698 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YKR005C	Q02203	525 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PLP1	Q04004	230 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ECM11	Q04110	302 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YKU80	Q04437	629 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YRM1	Q12340	786 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	KRE5	P22023	1365 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PDR11	P40550	1411 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SNF2	P22082	1703 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SAS3	P34218	831 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	PEX5	P35056	612 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	UBP13	P38187	747 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	BCD1	P38772	366 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	RTS1	P38903	757 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	PHB1	P40961	287 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	YJR079W	P47126	109 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	UBC11	P52492	156 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	AIM14	P53109	570 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	MET13	P53128	600 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	HOP2	P53187	214 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	ARP4	P80428	489 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SSL2	Q00578	843 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	BET4	Q00618	327 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	TIM44	Q01852	431 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	MUK1	Q02866	612 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	RRN11	Q04712	507 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	YLH47	Q06493	454 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	IRC13	Q08630	104 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	MCH5	Q08777	521 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	MSH5	Q12175	901 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SCM3	Q12334	223 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SIR3	P06701	978 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	NMT1	P14743	455 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	IME1	P21190	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SFP1	P32432	683 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	NPL6	P32832	435 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	UIP5	P36137	443 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	APT2	P36973	181 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	TAF5	P38129	798 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	LYS9	P38999	446 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	BUD16	P39988	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	FMP52	P40008	231 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	MRX1	P40050	688 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	FTR1	P40088	404 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	STB4	P50104	949 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	CIK1	Q01649	594 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	REC102	Q02721	264 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SWP1	Q02795	286 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	PNG1	Q02890	363 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	MGR3	Q04472	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	TMN2	Q04562	672 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	ATG23	Q06671	453 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECO1	YFR027W	SYO1	Q07395	620 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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