RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	ICL2	Q12031	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	MED1	Q12321	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TRM11	Q12463	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	UTR4	P32626	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	UBP13	P38187	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YEL076C	P39971	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	FIS1	P40515	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	NIT3	P49954	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TCO89	Q08921	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	HFI1	Q12060	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PHO8	P11491	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SNA3	P14359	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PHO13	P19881	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	MNN4	P36044	1178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	VPS75	P53853	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PGA2	P53903	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	WAR1	Q03631	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SUE1	Q06524	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CRD1	Q07560	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	HIF1	Q12373	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	ERP3	Q12403	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
CPR4	YCR069W	ALG7	P07286	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SWI6	P09959	803 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SPO11	P23179	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	COT1	P32798	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	REG2	P38232	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SDS3	P40505	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	HUL4	P40985	892 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YGR237C	P50089	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	ALF1	P53904	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	DON1	Q05610	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	OMS1	Q06668	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PSR2	Q07949	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	FLC1	Q08967	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	MET3	P08536	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	DAL7	P21826	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	MRC1	P25588	1096 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	DPH2	P32461	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YSC83	P32792	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	EMC3	P36039	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	GYP8	P43570	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	STU2	P46675	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	ADY4	Q05955	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TLG2	Q08144	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	UBP11	P36026	717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	BET3	P36149	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PPS1	P38148	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	RPP1	P38786	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	NNF1	P47149	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	STB4	P50104	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TAD1	P53065	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	ASI2	P53895	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SLD5	Q03406	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	DLT1	Q04216	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	OPY2	Q06810	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YAP7	Q08182	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	MCH5	Q08777	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	FRE5	Q08908	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	AFT2	Q08957	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PRC1	P00729	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	POX1	P13711	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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