RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0297Q0297 YRF1-5P0CX21 1796 aa27.6■■■□□ 2.01
Q0297Q0297 YRF1-8P0CX22 1796 aa27.6■■■□□ 2.01
Q0297Q0297 RPO21P04050 1733 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
Q0297Q0297 GEA2P39993 1459 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Q0297Q0297 VPS15P22219 1454 aa27.46■■□□□ 1.99
Q0297Q0297 SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
Q0297Q0297 STH1P32597 1359 aa27.43■■□□□ 1.98
Q0297Q0297 BNI1P41832 1953 aa27.36■■□□□ 1.97
Q0297Q0297 ITT1Q04638 464 aa27.33■■□□□ 1.97
Q0297Q0297 SNT2P53127 1403 aa27.3■■□□□ 1.96
Q0297Q0297 SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
Q0297Q0297 RTT106P40161 455 aa27.24■■□□□ 1.95
Q0297Q0297 DRS2P39524 1355 aa27.21■■□□□ 1.95
Q0297Q0297 MLP2P40457 1679 aa27.19■■□□□ 1.94
Q0297Q0297 MET10P39692 1035 aa27.17■■□□□ 1.94
Q0297Q0297 ULS1Q08562 1619 aa27.08■■□□□ 1.93
Q0297Q0297 MMS1Q06211 1407 aa27.06■■□□□ 1.92
Q0297Q0297 PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Q0297Q0297 SPO14P36126 1683 aa27.05■■□□□ 1.92
Q0297Q0297 TAF7Q05021 590 aa27.01■■□□□ 1.91
Q0297Q0297 NUP170P38181 1502 aa27■■□□□ 1.91
Q0297Q0297 PDR12Q02785 1511 aa26.95■■□□□ 1.91
Q0297Q0297 IFH1P39520 1085 aa26.87■■□□□ 1.89
Q0297Q0297 GDB1Q06625 1536 aa26.84■■□□□ 1.89
Q0297Q0297 IRC20Q06554 1556 aa26.83■■□□□ 1.89
Q0297Q0297 ABP1P15891 592 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Q0297Q0297 NUP157P40064 1391 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Q0297Q0297 MIF2P35201 549 aa26.79■■□□□ 1.88
Q0297Q0297 IQG1Q12280 1495 aa26.73■■□□□ 1.87
Q0297Q0297 GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
Q0297Q0297 PDR10P51533 1564 aa26.62■■□□□ 1.85
Q0297Q0297 DNF2Q12675 1612 aa26.61■■□□□ 1.85
Q0297Q0297 DOP1Q03921 1698 aa26.6■■□□□ 1.85
Q0297Q0297 BUD3P25558 1636 aa26.58■■□□□ 1.85
Q0297Q0297 TRM3Q07527 1436 aa26.56■■□□□ 1.84
Q0297Q0297 CAT8P39113 1433 aa26.49■■□□□ 1.83
Q0297Q0297 TY3B-GQ99315 1547 aa26.44■■□□□ 1.82
Q0297Q0297 YBT1P32386 1661 aa26.44■■□□□ 1.82
Q0297Q0297 CKB1P43639 278 aa26.32■■□□□ 1.8
Q0297Q0297 ARO1P08566 1588 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Q0297Q0297 CHC1P22137 1653 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Q0297Q0297 SEC7P11075 2009 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Q0297Q0297 YSP2Q06681 1438 aa26.14■■□□□ 1.78
Q0297Q0297 BNR1P40450 1375 aa26.09■■□□□ 1.77
Q0297Q0297 YOR093CQ12275 1648 aa26■■□□□ 1.75
Q0297Q0297 YFR006WP43590 535 aa25.96■■□□□ 1.75
Q0297Q0297 SRB8P25648 1427 aa25.96■■□□□ 1.75
Q0297Q0297 YAP3P38749 330 aa25.8■■□□□ 1.72
Q0297Q0297 DNF3Q12674 1656 aa25.78■■□□□ 1.72
Q0297Q0297 BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
Q0297Q0297 IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Q0297Q0297 URN1Q06525 465 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Q0297Q0297 SSM4P40318 1319 aa25.47■■□□□ 1.67
Q0297Q0297 MAK10Q02197 733 aa25.47■■□□□ 1.67
Q0297Q0297 NUP188P52593 1655 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
Q0297Q0297 IPL1P38991 367 aa25.42■■□□□ 1.66
Q0297Q0297 VMR1P38735 1592 aa25.33■■□□□ 1.65
Q0297Q0297 TYS1P36421 394 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
Q0297Q0297 IML1P47170 1584 aa25.26■■□□□ 1.63
Q0297Q0297 USO1P25386 1790 aa25.21■■□□□ 1.63
Q0297Q0297 PDR5P33302 1511 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Q0297Q0297 HAP1P0CE41 1502 aa25.17■■□□□ 1.62
Q0297Q0297 GCN2P15442 1659 aa25.17■■□□□ 1.62
Q0297Q0297 PDR11P40550 1411 aa24.97■■□□□ 1.59
Q0297Q0297 TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
Q0297Q0297 YMR196WQ04336 1088 aa24.92■■□□□ 1.58
Q0297Q0297 PAF1P38351 445 aa24.88■■□□□ 1.57
Q0297Q0297 THI12P42883 340 aa24.85■■□□□ 1.57
Q0297Q0297 THI5P43534 340 aa24.85■■□□□ 1.57
Q0297Q0297 THI11P47183 340 aa24.85■■□□□ 1.57
Q0297Q0297 THI13Q07748 340 aa24.85■■□□□ 1.57
Q0297Q0297 RAV1P47104 1357 aa24.73■■□□□ 1.55
Q0297Q0297 MRX12P47084 519 aa24.71■■□□□ 1.55
Q0297Q0297 KRE5P22023 1365 aa24.69■■□□□ 1.54
Q0297Q0297 BFR2Q06631 534 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Q0297Q0297 NOP7P53261 605 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Q0297Q0297 RIA1P53893 1110 aa24.65■■□□□ 1.54
Q0297Q0297 RTC1Q08281 1341 aa24.59■■□□□ 1.53
Q0297Q0297 BCK1Q01389 1478 aa24.58■■□□□ 1.52
Q0297Q0297 CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Q0297Q0297 CAB1Q04430 367 aa24.5■■□□□ 1.51
Q0297Q0297 RAD9P14737 1309 aa24.48■■□□□ 1.51
Q0297Q0297 NUP192P47054 1683 aa24.47■■□□□ 1.51
Q0297Q0297 ALD4P46367 519 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Q0297Q0297 YNR029CP53729 429 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Q0297Q0297 TAF5P38129 798 aa24.27■■□□□ 1.48
Q0297Q0297 ESL2P36168 1195 aa24.26■■□□□ 1.47
Q0297Q0297 NAP1P25293 417 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Q0297Q0297 TAF8Q03750 510 aa24.19■■□□□ 1.46
Q0297Q0297 TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Q0297Q0297 PTP3P40048 928 aa24.17■■□□□ 1.46
Q0297Q0297 YAH1Q12184 172 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Q0297Q0297 APP1P53933 587 aa24.06■■□□□ 1.44
Q0297Q0297 RCM1P53972 490 aa24.01■■□□□ 1.43
Q0297Q0297 CPS1P27614 576 aa23.96■■□□□ 1.43
Q0297Q0297 KIP3P53086 805 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Q0297Q0297 SPE2P21182 396 aa23.91■■□□□ 1.42
Q0297Q0297 REB1P21538 810 aa23.91■■□□□ 1.42
Q0297Q0297 PPH3P32345 308 aa23.88■■□□□ 1.41
Q0297Q0297 ORC1P54784 914 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.8 ms