RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639000.1

SPIN3-217, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,055 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-217ENST00000639000 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.69■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 NESP48681 1621 aa23.69■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.69■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.68■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.67■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.66■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 MAPKBP1O60336 1514 aa23.65■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 ITGAEP38570 1179 aa23.65■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.65■■□□□ 1.38
SPIN3-217ENST00000639000 TOPBP1Q92547 1522 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIN3-217ENST00000639000 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIN3-217ENST00000639000 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIN3-217ENST00000639000 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIN3-217ENST00000639000 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.58■■□□□ 1.37
SPIN3-217ENST00000639000 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.57■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.55■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.55■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 P3H3Q8IVL6 736 aa23.55■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 CUL7Q14999 1698 aa23.55■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.54■■□□□ 1.36
SPIN3-217ENST00000639000 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
SPIN3-217ENST00000639000 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SPIN3-217ENST00000639000 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.47■■□□□ 1.35
SPIN3-217ENST00000639000 WDR97A6NE52 1622 aa23.46■■□□□ 1.35
SPIN3-217ENST00000639000 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPIN3-217ENST00000639000 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.41■■□□□ 1.34
SPIN3-217ENST00000639000 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPIN3-217ENST00000639000 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.41■■□□□ 1.34
SPIN3-217ENST00000639000 FMN1Q68DA7 1419 aa23.4■■□□□ 1.34
SPIN3-217ENST00000639000 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.38■■□□□ 1.33
SPIN3-217ENST00000639000 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.38■■□□□ 1.33
SPIN3-217ENST00000639000 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.36■■□□□ 1.33
SPIN3-217ENST00000639000 SAMD9Q5K651 1589 aa23.36■■□□□ 1.33
SPIN3-217ENST00000639000 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.34■■□□□ 1.33
SPIN3-217ENST00000639000 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SPIN3-217ENST00000639000 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.3■■□□□ 1.32
SPIN3-217ENST00000639000 GRIN2BQ13224 1484 aa23.28■■□□□ 1.32
SPIN3-217ENST00000639000 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.26■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 PTPRKQ15262 1439 aa23.26■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.25■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.24■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 HFM1A2PYH4 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 ERCC6Q03468 1493 aa23.22■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 NCOA2Q15596 1464 aa23.21■■□□□ 1.31
SPIN3-217ENST00000639000 KCNH8Q96L42 1107 aa23.2■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.2■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.19■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.18■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 UACAQ9BZF9 1416 aa23.17■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.16■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 ARHGEF11O15085 1522 aa23.15■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 NAIPQ13075 1403 aa23.15■■□□□ 1.3
SPIN3-217ENST00000639000 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SPIN3-217ENST00000639000 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.13■■□□□ 1.29
SPIN3-217ENST00000639000 WDR62O43379 1518 aa23.12■■□□□ 1.29
SPIN3-217ENST00000639000 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.1■■□□□ 1.29
SPIN3-217ENST00000639000 TONSLQ96HA7 1378 aa23.06■■□□□ 1.28
SPIN3-217ENST00000639000 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SPIN3-217ENST00000639000 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.03■■□□□ 1.28
SPIN3-217ENST00000639000 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPIN3-217ENST00000639000 CCER2I3L3R5 266 aa23.02■■□□□ 1.28
SPIN3-217ENST00000639000 PBRM1Q86U86 1689 aa23.02■■□□□ 1.28
SPIN3-217ENST00000639000 HECW1Q76N89 1606 aa23.01■■□□□ 1.27
SPIN3-217ENST00000639000 ADAMTS12P58397 1594 aa22.99■■□□□ 1.27
SPIN3-217ENST00000639000 IQGAP2Q13576 1575 aa22.99■■□□□ 1.27
SPIN3-217ENST00000639000 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPIN3-217ENST00000639000 AKNAQ7Z591 1439 aa22.96■■□□□ 1.27
SPIN3-217ENST00000639000 IFT140Q96RY7 1462 aa22.96■■□□□ 1.27
SPIN3-217ENST00000639000 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.95■■□□□ 1.26
SPIN3-217ENST00000639000 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPIN3-217ENST00000639000 MIA2Q96PC5 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
SPIN3-217ENST00000639000 ANP32CO43423 234 aa22.93■■□□□ 1.26
SPIN3-217ENST00000639000 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.91■■□□□ 1.26
SPIN3-217ENST00000639000 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPIN3-217ENST00000639000 MYT1Q01538 1121 aa22.89■■□□□ 1.25
SPIN3-217ENST00000639000 KDM6BO15054 1643 aa22.88■■□□□ 1.25
SPIN3-217ENST00000639000 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.86■■□□□ 1.25
SPIN3-217ENST00000639000 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.82■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.79■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 DISP1Q96F81 1524 aa22.78■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.78■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 TRIM52Q96A61 297 aa22.78■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 ROCK1Q13464 1354 aa22.77■■□□□ 1.24
SPIN3-217ENST00000639000 FKBP8Q14318 412 aa22.77■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 KIAA0556O60303 1618 aa22.76■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 DAPK1P53355 1430 aa22.74■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.74■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 ABCC5O15440 1437 aa22.73■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 ARID3CA6NKF2 412 aa22.72■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SPIN3-217ENST00000639000 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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