RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 GSE1Q14687 1217 aa5.26□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.26□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.26□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 PITPNM1O00562 1244 aa5.25□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 RASEFQ8IZ41 740 aa5.25□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 CHADLQ6NUI6 762 aa5.24□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 PYGBP11216 843 aa5.22□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM41Q8WV44 630 aa5.22□□□□□ -1.57
SPTAN1-232ENST00000636483 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM212AQ96EL1 285 aa5.2□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.19□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 STK25O00506 426 aa5.17□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 BCANQ96GW7 911 aa5.17□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SPTAN1-232ENST00000636483 VGFO15240 615 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 STK24Q9Y6E0 443 aa5.15□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.13□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.13□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.12□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.12□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.11□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.09□□□□□ -1.59
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.08□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.07□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP3K13O43283 966 aa5.05□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 PSEN1P49768 467 aa5.05□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.05□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 CADPS2Q86UW7 1296 aa5.04□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 IFNL1Q8IU54 200 aa5.04□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF12Q96FN5 646 aa5.03□□□□□ -1.6
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R37O75864 691 aa5.02□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.02□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 MFRPQ9BY79 579 aa5.02□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 NBR1Q14596 966 aa5.01□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.01□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 CABP2Q9NPB3 220 aa5□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 PHF12Q96QT6 1004 aa4.99□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.99□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 CD44P16070 742 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 WDR70Q9NW82 654 aa4.97□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 TRPC6Q9Y210 931 aa4.97□□□□□ -1.61
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXO22Q8NEZ5 403 aa4.96□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX12O15370 315 aa4.94□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 NLRP6P59044 892 aa4.94□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.94□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.93□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.93□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.92□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 C19orf67A6NJJ6 358 aa4.91□□□□□ -1.62
SPTAN1-232ENST00000636483 EVX2Q03828 476 aa4.9□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA2Q08379 1002 aa4.89□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.89□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 E2F4Q16254 413 aa4.88□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.88□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 P3H3Q8IVL6 736 aa4.88□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.87□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 SEMA3EO15041 775 aa4.87□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE4AP27815 886 aa4.87□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 HAX1O00165 279 aa4.86□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.85□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.84□□□□□ -1.63
SPTAN1-232ENST00000636483 TIE1P35590 1138 aa4.83□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.83□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 MFSD10Q14728 455 aa4.81□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 CAMK2BQ13554 666 aa4.78□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 DSG2Q14126 1118 aa4.78□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.78□□□□□ -1.64
SPTAN1-232ENST00000636483 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
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