RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613358.4

PGRMC2-208, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 3,783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-208ENST00000613358 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.56■■□□□ 1.52
PGRMC2-208ENST00000613358 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.55■■□□□ 1.52
PGRMC2-208ENST00000613358 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PGRMC2-208ENST00000613358 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.54■■□□□ 1.52
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PGRMC2-208ENST00000613358 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PGRMC2-208ENST00000613358 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.48■■□□□ 1.51
PGRMC2-208ENST00000613358 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.47■■□□□ 1.51
PGRMC2-208ENST00000613358 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PGRMC2-208ENST00000613358 WDR97A6NE52 1622 aa24.44■■□□□ 1.5
PGRMC2-208ENST00000613358 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PGRMC2-208ENST00000613358 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PGRMC2-208ENST00000613358 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PGRMC2-208ENST00000613358 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PGRMC2-208ENST00000613358 SYNJ1O43426 1573 aa24.34■■□□□ 1.49
PGRMC2-208ENST00000613358 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.33■■□□□ 1.49
PGRMC2-208ENST00000613358 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.31■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 MAPKBP1O60336 1514 aa24.31■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 IL27Q8NEV9 243 aa24.31■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 ARAP1Q96P48 1450 aa24.29■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 TONSLQ96HA7 1378 aa24.28■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PGRMC2-208ENST00000613358 NCAPD3P42695 1498 aa24.26■■□□□ 1.47
PGRMC2-208ENST00000613358 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.24■■□□□ 1.47
PGRMC2-208ENST00000613358 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.22■■□□□ 1.47
PGRMC2-208ENST00000613358 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PGRMC2-208ENST00000613358 CUX2O14529 1486 aa24.22■■□□□ 1.47
PGRMC2-208ENST00000613358 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.18■■□□□ 1.46
PGRMC2-208ENST00000613358 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PGRMC2-208ENST00000613358 MRS2Q9HD23 443 aa24.15■■□□□ 1.46
PGRMC2-208ENST00000613358 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.14■■□□□ 1.45
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC184Q52MB2 194 aa24.13■■□□□ 1.45
PGRMC2-208ENST00000613358 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PGRMC2-208ENST00000613358 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PGRMC2-208ENST00000613358 P3H3Q8IVL6 736 aa24.09■■□□□ 1.45
PGRMC2-208ENST00000613358 NEFMP07197 916 aa24.04■■□□□ 1.44
PGRMC2-208ENST00000613358 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.04■■□□□ 1.44
PGRMC2-208ENST00000613358 HMGXB3Q12766 1538 aa24.01■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.96■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 PRXQ9BXM0 1461 aa23.96■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.96■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.96■■□□□ 1.43
PGRMC2-208ENST00000613358 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
PGRMC2-208ENST00000613358 KIF27Q86VH2 1401 aa23.92■■□□□ 1.42
PGRMC2-208ENST00000613358 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.91■■□□□ 1.42
PGRMC2-208ENST00000613358 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
PGRMC2-208ENST00000613358 CFTRP13569 1480 aa23.9■■□□□ 1.42
PGRMC2-208ENST00000613358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.9■■□□□ 1.42
PGRMC2-208ENST00000613358 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.88■■□□□ 1.41
PGRMC2-208ENST00000613358 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PGRMC2-208ENST00000613358 AKNAQ7Z591 1439 aa23.86■■□□□ 1.41
PGRMC2-208ENST00000613358 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.84■■□□□ 1.41
PGRMC2-208ENST00000613358 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.8■■□□□ 1.4
PGRMC2-208ENST00000613358 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.78■■□□□ 1.4
PGRMC2-208ENST00000613358 TIAM1Q13009 1591 aa23.75■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 NUDCQ9Y266 331 aa23.75■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.75■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.75■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 NESP48681 1621 aa23.74■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 TOP2BQ02880 1626 aa23.74■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 CUX1P39880 1505 aa23.74■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.73■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.71■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 USP35Q9P2H5 1018 aa23.71■■□□□ 1.39
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.7■■□□□ 1.38
PGRMC2-208ENST00000613358 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.7■■□□□ 1.38
PGRMC2-208ENST00000613358 PDE4AP27815 886 aa23.68■■□□□ 1.38
PGRMC2-208ENST00000613358 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.66■■□□□ 1.38
PGRMC2-208ENST00000613358 GSE1Q14687 1217 aa23.64■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 FOXD1Q16676 465 aa23.63■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC7Q96M83 1385 aa23.63■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 SLC4A3P48751 1232 aa23.62■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.62■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 UACAQ9BZF9 1416 aa23.61■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.61■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 TMC1Q8TDI8 760 aa23.59■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PGRMC2-208ENST00000613358 IGF1RP08069 1367 aa23.56■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.56■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.56■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.55■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.53■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 NFKBIBQ15653 356 aa23.53■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 SKAP1Q86WV1 359 aa23.52■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 BACH2Q9BYV9 841 aa23.52■■□□□ 1.36
PGRMC2-208ENST00000613358 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.52■■□□□ 1.36
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