RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591517.5

MAP4K1-210, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MAP4K1, Length 2,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K1-210ENST00000591517 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.07■■□□□ 1.12
MAP4K1-210ENST00000591517 MAPKBP1O60336 1514 aa22.05■■□□□ 1.12
MAP4K1-210ENST00000591517 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.03■■□□□ 1.12
MAP4K1-210ENST00000591517 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.03■■□□□ 1.12
MAP4K1-210ENST00000591517 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.99■■□□□ 1.11
MAP4K1-210ENST00000591517 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
MAP4K1-210ENST00000591517 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
MAP4K1-210ENST00000591517 WDR97A6NE52 1622 aa21.96■■□□□ 1.11
MAP4K1-210ENST00000591517 NEFLP07196 543 aa21.95■■□□□ 1.1
MAP4K1-210ENST00000591517 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MAP4K1-210ENST00000591517 TRIM52Q96A61 297 aa21.93■■□□□ 1.1
MAP4K1-210ENST00000591517 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
MAP4K1-210ENST00000591517 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.88■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 TIAM1Q13009 1591 aa21.88■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.88■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 ANP32CO43423 234 aa21.87■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.85■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 CCER2I3L3R5 266 aa21.84■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 IGF1RP08069 1367 aa21.83■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.83■■□□□ 1.09
MAP4K1-210ENST00000591517 MAP3K1Q13233 1512 aa21.82■■□□□ 1.08
MAP4K1-210ENST00000591517 P3H3Q8IVL6 736 aa21.8■■□□□ 1.08
MAP4K1-210ENST00000591517 PRDM2Q13029 1718 aa21.8■■□□□ 1.08
MAP4K1-210ENST00000591517 BCL11AQ9H165 835 aa21.79■■□□□ 1.08
MAP4K1-210ENST00000591517 TOPBP1Q92547 1522 aa21.77■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.76■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.74■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.73■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.71■■□□□ 1.07
MAP4K1-210ENST00000591517 TONSLQ96HA7 1378 aa21.68■■□□□ 1.06
MAP4K1-210ENST00000591517 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.66■■□□□ 1.06
MAP4K1-210ENST00000591517 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.65■■□□□ 1.06
MAP4K1-210ENST00000591517 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
MAP4K1-210ENST00000591517 MSH5O43196 834 aa21.61■■□□□ 1.05
MAP4K1-210ENST00000591517 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
MAP4K1-210ENST00000591517 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
MAP4K1-210ENST00000591517 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.59■■□□□ 1.05
MAP4K1-210ENST00000591517 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.59■■□□□ 1.05
MAP4K1-210ENST00000591517 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
MAP4K1-210ENST00000591517 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
MAP4K1-210ENST00000591517 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.52■■□□□ 1.04
MAP4K1-210ENST00000591517 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.52■■□□□ 1.04
MAP4K1-210ENST00000591517 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.5■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.5■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.49■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 UACAQ9BZF9 1416 aa21.48■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 ERCC6Q03468 1493 aa21.48■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.48■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.47■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 PTPRKQ15262 1439 aa21.46■■□□□ 1.03
MAP4K1-210ENST00000591517 HFM1A2PYH4 1435 aa21.45■■□□□ 1.02
MAP4K1-210ENST00000591517 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.44■■□□□ 1.02
MAP4K1-210ENST00000591517 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
MAP4K1-210ENST00000591517 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.42■■□□□ 1.02
MAP4K1-210ENST00000591517 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
MAP4K1-210ENST00000591517 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.4■■□□□ 1.02
MAP4K1-210ENST00000591517 NAIPQ13075 1403 aa21.39■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.39■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.38■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 FMN1Q68DA7 1419 aa21.37■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.37■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 CCDC184Q52MB2 194 aa21.36■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.35■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.34■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 FBLN2P98095 1184 aa21.34■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.34■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.33■■□□□ 1.01
MAP4K1-210ENST00000591517 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.32■■□□□ 1
MAP4K1-210ENST00000591517 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
MAP4K1-210ENST00000591517 NCOA2Q15596 1464 aa21.3■■□□□ 1
MAP4K1-210ENST00000591517 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.3■■□□□ 1
MAP4K1-210ENST00000591517 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.3■■□□□ 1
MAP4K1-210ENST00000591517 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.29■■□□□ 1
MAP4K1-210ENST00000591517 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 MRS2Q9HD23 443 aa21.26■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 ARID3CA6NKF2 412 aa21.26■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.26■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.25■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.22■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.21■□□□□ 0.99
MAP4K1-210ENST00000591517 FOXD1Q16676 465 aa21.2■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.19■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.19■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 CCDC7Q96M83 1385 aa21.18■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 CUL7Q14999 1698 aa21.18■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 WDR62O43379 1518 aa21.18■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 GRIN2BQ13224 1484 aa21.15■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 IFT140Q96RY7 1462 aa21.15■□□□□ 0.98
MAP4K1-210ENST00000591517 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms