RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590508.5

ZSWIM4-202, Transcript of zinc finger SWIM-type containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene ZSWIM4, Length 2,921 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM4-202ENST00000590508 BCANQ96GW7 911 aa24.91■■□□□ 1.58
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ZSWIM4-202ENST00000590508 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM4-202ENST00000590508 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM4-202ENST00000590508 MAPKBP1O60336 1514 aa24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM4-202ENST00000590508 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM4-202ENST00000590508 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM4-202ENST00000590508 TIAM1Q13009 1591 aa24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM4-202ENST00000590508 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM4-202ENST00000590508 WDR97A6NE52 1622 aa24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM4-202ENST00000590508 TRIM52Q96A61 297 aa24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM4-202ENST00000590508 FKBP8Q14318 412 aa24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM4-202ENST00000590508 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.65■■□□□ 1.54
ZSWIM4-202ENST00000590508 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM4-202ENST00000590508 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM4-202ENST00000590508 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM4-202ENST00000590508 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM4-202ENST00000590508 NESP48681 1621 aa24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM4-202ENST00000590508 ARID3CA6NKF2 412 aa24.59■■□□□ 1.53
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ZSWIM4-202ENST00000590508 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM4-202ENST00000590508 MAP3K1Q13233 1512 aa24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM4-202ENST00000590508 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM4-202ENST00000590508 ANP32CO43423 234 aa24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM4-202ENST00000590508 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 TONSLQ96HA7 1378 aa24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 MYT1Q01538 1121 aa24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 PTPRKQ15262 1439 aa24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.48■■□□□ 1.51
ZSWIM4-202ENST00000590508 PRDM2Q13029 1718 aa24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM4-202ENST00000590508 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM4-202ENST00000590508 TOPBP1Q92547 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
ZSWIM4-202ENST00000590508 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.43■■□□□ 1.5
ZSWIM4-202ENST00000590508 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM4-202ENST00000590508 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM4-202ENST00000590508 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 NEFLP07196 543 aa24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 FOXD1Q16676 465 aa24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 FMN1Q68DA7 1419 aa24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM4-202ENST00000590508 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
ZSWIM4-202ENST00000590508 CCER2I3L3R5 266 aa24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM4-202ENST00000590508 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ZSWIM4-202ENST00000590508 NCOA2Q15596 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM4-202ENST00000590508 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM4-202ENST00000590508 NAIPQ13075 1403 aa24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM4-202ENST00000590508 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM4-202ENST00000590508 UACAQ9BZF9 1416 aa24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM4-202ENST00000590508 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM4-202ENST00000590508 HFM1A2PYH4 1435 aa24.25■■□□□ 1.47
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ZSWIM4-202ENST00000590508 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM4-202ENST00000590508 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM4-202ENST00000590508 CCDC184Q52MB2 194 aa24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM4-202ENST00000590508 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.2■■□□□ 1.46
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ZSWIM4-202ENST00000590508 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM4-202ENST00000590508 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM4-202ENST00000590508 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM4-202ENST00000590508 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM4-202ENST00000590508 CUL7Q14999 1698 aa24.14■■□□□ 1.46
ZSWIM4-202ENST00000590508 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.12■■□□□ 1.45
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ZSWIM4-202ENST00000590508 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 GRIN2BQ13224 1484 aa24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM4-202ENST00000590508 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM4-202ENST00000590508 KDM6BO15054 1643 aa24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM4-202ENST00000590508 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM4-202ENST00000590508 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.04■■□□□ 1.44
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ZSWIM4-202ENST00000590508 SAMD9Q5K651 1589 aa24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM4-202ENST00000590508 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM4-202ENST00000590508 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM4-202ENST00000590508 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
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ZSWIM4-202ENST00000590508 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM4-202ENST00000590508 MRS2Q9HD23 443 aa23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM4-202ENST00000590508 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM4-202ENST00000590508 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM4-202ENST00000590508 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ZSWIM4-202ENST00000590508 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ZSWIM4-202ENST00000590508 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM4-202ENST00000590508 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ZSWIM4-202ENST00000590508 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ZSWIM4-202ENST00000590508 MSH5O43196 834 aa23.9■■□□□ 1.42
ZSWIM4-202ENST00000590508 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.87■■□□□ 1.41
ZSWIM4-202ENST00000590508 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ZSWIM4-202ENST00000590508 CCDC7Q96M83 1385 aa23.86■■□□□ 1.41
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