RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588657.5

ILF3-210, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 2,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-210ENST00000588657 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.17■■□□□ 1.3
ILF3-210ENST00000588657 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.15■■□□□ 1.3
ILF3-210ENST00000588657 CUL7Q14999 1698 aa23.15■■□□□ 1.3
ILF3-210ENST00000588657 TOPBP1Q92547 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
ILF3-210ENST00000588657 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.294e-9■■■■□ 23.4
ILF3-210ENST00000588657 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ILF3-210ENST00000588657 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.07■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.04■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.03■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.02■■□□□ 1.28
ILF3-210ENST00000588657 WDR97A6NE52 1622 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-210ENST00000588657 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.01■■□□□ 1.27
ILF3-210ENST00000588657 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-210ENST00000588657 MAPKBP1O60336 1514 aa23■■□□□ 1.27
ILF3-210ENST00000588657 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ILF3-210ENST00000588657 FMN1Q68DA7 1419 aa22.94■■□□□ 1.26
ILF3-210ENST00000588657 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.93■■□□□ 1.26
ILF3-210ENST00000588657 NESP48681 1621 aa22.91■■□□□ 1.26
ILF3-210ENST00000588657 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.91■■□□□ 1.26
ILF3-210ENST00000588657 ITGAEP38570 1179 aa22.9■■□□□ 1.26
ILF3-210ENST00000588657 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.89■■□□□ 1.25
ILF3-210ENST00000588657 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ILF3-210ENST00000588657 SAMD9Q5K651 1589 aa22.87■■□□□ 1.25
ILF3-210ENST00000588657 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.85■■□□□ 1.25
ILF3-210ENST00000588657 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ILF3-210ENST00000588657 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ILF3-210ENST00000588657 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.81■■□□□ 1.24
ILF3-210ENST00000588657 P3H3Q8IVL6 736 aa22.81■■□□□ 1.24
ILF3-210ENST00000588657 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.8■■□□□ 1.24
ILF3-210ENST00000588657 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.79■■□□□ 1.24
ILF3-210ENST00000588657 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.79■■□□□ 1.24
ILF3-210ENST00000588657 GRIN2BQ13224 1484 aa22.74■■□□□ 1.23
ILF3-210ENST00000588657 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ILF3-210ENST00000588657 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.7■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 HFM1A2PYH4 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.68■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.66■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.65■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 NCOA2Q15596 1464 aa22.64■■□□□ 1.22
ILF3-210ENST00000588657 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.64■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 UACAQ9BZF9 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 ARHGEF11O15085 1522 aa22.63■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.62■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.6■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 PBRM1Q86U86 1689 aa22.59■■□□□ 1.21
ILF3-210ENST00000588657 HECW1Q76N89 1606 aa22.57■■□□□ 1.2
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ILF3-210ENST00000588657 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ILF3-210ENST00000588657 NAIPQ13075 1403 aa22.55■■□□□ 1.2
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ILF3-210ENST00000588657 AKNAQ7Z591 1439 aa22.53■■□□□ 1.2
ILF3-210ENST00000588657 TONSLQ96HA7 1378 aa22.5■■□□□ 1.19
ILF3-210ENST00000588657 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.49■■□□□ 1.19
ILF3-210ENST00000588657 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.48■■□□□ 1.19
ILF3-210ENST00000588657 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.46■■□□□ 1.19
ILF3-210ENST00000588657 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ILF3-210ENST00000588657 MIA2Q96PC5 1412 aa22.46■■□□□ 1.19
ILF3-210ENST00000588657 CCER2I3L3R5 266 aa22.44■■□□□ 1.18
ILF3-210ENST00000588657 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ILF3-210ENST00000588657 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ILF3-210ENST00000588657 WDR62O43379 1518 aa22.43■■□□□ 1.18
ILF3-210ENST00000588657 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
ILF3-210ENST00000588657 IFT140Q96RY7 1462 aa22.37■■□□□ 1.17
ILF3-210ENST00000588657 ANP32CO43423 234 aa22.34■■□□□ 1.17
ILF3-210ENST00000588657 KCNH8Q96L42 1107 aa22.33■■□□□ 1.17
ILF3-210ENST00000588657 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.31■■□□□ 1.16
ILF3-210ENST00000588657 BCL11AQ9H165 835 aa22.3■■□□□ 1.16
ILF3-210ENST00000588657 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ILF3-210ENST00000588657 KIAA0556O60303 1618 aa22.29■■□□□ 1.16
ILF3-210ENST00000588657 ROCK1Q13464 1354 aa22.29■■□□□ 1.16
ILF3-210ENST00000588657 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ILF3-210ENST00000588657 DISP1Q96F81 1524 aa22.24■■□□□ 1.15
ILF3-210ENST00000588657 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ILF3-210ENST00000588657 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.23■■□□□ 1.15
ILF3-210ENST00000588657 KDM6BO15054 1643 aa22.22■■□□□ 1.15
ILF3-210ENST00000588657 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.21■■□□□ 1.15
ILF3-210ENST00000588657 DAPK1P53355 1430 aa22.2■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 GRIN2AQ12879 1464 aa22.19■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 TRIM52Q96A61 297 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 ABCC5O15440 1437 aa22.14■■□□□ 1.14
ILF3-210ENST00000588657 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ILF3-210ENST00000588657 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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