RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559781.6

TMC3-AS1-203, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TMC3-AS1, Length 2,195 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.25■■□□□ 1.47
TMC3-AS1-203ENST00000559781 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.25■■□□□ 1.47
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TOPBP1Q92547 1522 aa24.25■■□□□ 1.47
TMC3-AS1-203ENST00000559781 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TMC3-AS1-203ENST00000559781 NESP48681 1621 aa24.22■■□□□ 1.47
TMC3-AS1-203ENST00000559781 P3H3Q8IVL6 736 aa24.21■■□□□ 1.47
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TMC3-AS1-203ENST00000559781 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.17■■□□□ 1.46
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.17■■□□□ 1.46
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.15■■□□□ 1.46
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.14■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CUL7Q14999 1698 aa24.13■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.11■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.09■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-203ENST00000559781 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.06■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.06■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MAPKBP1O60336 1514 aa24.05■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-203ENST00000559781 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.05■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-203ENST00000559781 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-203ENST00000559781 WDR97A6NE52 1622 aa24.01■■□□□ 1.43
TMC3-AS1-203ENST00000559781 FMN1Q68DA7 1419 aa23.97■■□□□ 1.43
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.94■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.92■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-203ENST00000559781 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.92■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-203ENST00000559781 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.91■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-203ENST00000559781 SAMD9Q5K651 1589 aa23.87■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-203ENST00000559781 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.86■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.85■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-203ENST00000559781 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.85■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.83■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-203ENST00000559781 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.8■■□□□ 1.4
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.78■■□□□ 1.4
TMC3-AS1-203ENST00000559781 GRIN2BQ13224 1484 aa23.78■■□□□ 1.4
TMC3-AS1-203ENST00000559781 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.77■■□□□ 1.4
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-203ENST00000559781 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-203ENST00000559781 NCOA2Q15596 1464 aa23.73■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.71■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.7■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PTPRKQ15262 1439 aa23.7■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-203ENST00000559781 HFM1A2PYH4 1435 aa23.7■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-203ENST00000559781 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-203ENST00000559781 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.69■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.66■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-203ENST00000559781 UACAQ9BZF9 1416 aa23.64■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 PBRM1Q86U86 1689 aa23.64■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 NAIPQ13075 1403 aa23.62■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.61■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TONSLQ96HA7 1378 aa23.6■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.6■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 KCNH8Q96L42 1107 aa23.59■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ARHGEF11O15085 1522 aa23.59■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 IQGAP2Q13576 1575 aa23.59■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-203ENST00000559781 HECW1Q76N89 1606 aa23.57■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ADAMTS12P58397 1594 aa23.57■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-203ENST00000559781 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.55■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-203ENST00000559781 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-203ENST00000559781 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-203ENST00000559781 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.48■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.47■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-203ENST00000559781 WDR62O43379 1518 aa23.46■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ARID3CA6NKF2 412 aa23.44■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MIA2Q96PC5 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 IFT140Q96RY7 1462 aa23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ANP32CO43423 234 aa23.41■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 AKNAQ7Z591 1439 aa23.41■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-203ENST00000559781 TRIM52Q96A61 297 aa23.39■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CCER2I3L3R5 266 aa23.38■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.37■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.35■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 KDM6BO15054 1643 aa23.34■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 KIAA0556O60303 1618 aa23.33■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DISP1Q96F81 1524 aa23.32■■□□□ 1.32
TMC3-AS1-203ENST00000559781 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.3■■□□□ 1.32
TMC3-AS1-203ENST00000559781 GRIN2AQ12879 1464 aa23.27■■□□□ 1.32
TMC3-AS1-203ENST00000559781 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DAPK1P53355 1430 aa23.26■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.25■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ROCK1Q13464 1354 aa23.24■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ABCC5O15440 1437 aa23.21■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 FOXD1Q16676 465 aa23.21■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-203ENST00000559781 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
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