RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 MAPKBP1O60336 1514 aa34.15■■■■□ 3.06
NPAS3-211ENST00000551634 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.13■■■■□ 3.05
NPAS3-211ENST00000551634 ITGAEP38570 1179 aa34.12■■■■□ 3.05
NPAS3-211ENST00000551634 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.08■■■■□ 3.05
NPAS3-211ENST00000551634 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.03■■■■□ 3.04
NPAS3-211ENST00000551634 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
NPAS3-211ENST00000551634 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.94■■■■□ 3.02
NPAS3-211ENST00000551634 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
NPAS3-211ENST00000551634 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.92■■■■□ 3.02
NPAS3-211ENST00000551634 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.91■■■■□ 3.02
NPAS3-211ENST00000551634 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.9■■■■□ 3.02
NPAS3-211ENST00000551634 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.89■■■■□ 3.02
NPAS3-211ENST00000551634 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.88■■■■□ 3.01
NPAS3-211ENST00000551634 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.87■■■■□ 3.01
NPAS3-211ENST00000551634 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.86■■■■□ 3.01
NPAS3-211ENST00000551634 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
NPAS3-211ENST00000551634 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.83■■■■□ 3.01
NPAS3-211ENST00000551634 WDR97A6NE52 1622 aa33.81■■■■□ 3
NPAS3-211ENST00000551634 CUL7Q14999 1698 aa33.8■■■■□ 3
NPAS3-211ENST00000551634 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.77■■■■□ 3
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NPAS3-211ENST00000551634 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
NPAS3-211ENST00000551634 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.73■■■□□ 2.99
NPAS3-211ENST00000551634 TOPBP1Q92547 1522 aa33.73■■■□□ 2.99
NPAS3-211ENST00000551634 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.73■■■□□ 2.99
NPAS3-211ENST00000551634 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.71■■■□□ 2.99
NPAS3-211ENST00000551634 FMN1Q68DA7 1419 aa33.69■■■□□ 2.98
NPAS3-211ENST00000551634 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
NPAS3-211ENST00000551634 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
NPAS3-211ENST00000551634 NESP48681 1621 aa33.63■■■□□ 2.97
NPAS3-211ENST00000551634 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.62■■■□□ 2.97
NPAS3-211ENST00000551634 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
NPAS3-211ENST00000551634 KCNH8Q96L42 1107 aa33.61■■■□□ 2.97
NPAS3-211ENST00000551634 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.58■■■□□ 2.97
NPAS3-211ENST00000551634 CCER2I3L3R5 266 aa33.52■■■□□ 2.96
NPAS3-211ENST00000551634 HFM1A2PYH4 1435 aa33.5■■■□□ 2.95
NPAS3-211ENST00000551634 SAMD9Q5K651 1589 aa33.49■■■□□ 2.95
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.48■■■□□ 2.95
NPAS3-211ENST00000551634 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.48■■■□□ 2.95
NPAS3-211ENST00000551634 UACAQ9BZF9 1416 aa33.48■■■□□ 2.95
NPAS3-211ENST00000551634 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
NPAS3-211ENST00000551634 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.43■■■□□ 2.94
NPAS3-211ENST00000551634 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.43■■■□□ 2.94
NPAS3-211ENST00000551634 TONSLQ96HA7 1378 aa33.43■■■□□ 2.94
NPAS3-211ENST00000551634 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.4■■■□□ 2.94
NPAS3-211ENST00000551634 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.4■■■□□ 2.94
NPAS3-211ENST00000551634 ANP32CO43423 234 aa33.39■■■□□ 2.94
NPAS3-211ENST00000551634 GRIN2BQ13224 1484 aa33.38■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.38■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 PTPRKQ15262 1439 aa33.38■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 NCOA2Q15596 1464 aa33.36■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.35■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 NAIPQ13075 1403 aa33.34■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.34■■■□□ 2.93
NPAS3-211ENST00000551634 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.31■■■□□ 2.92
NPAS3-211ENST00000551634 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.3■■■□□ 2.92
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NPAS3-211ENST00000551634 ARHGEF11O15085 1522 aa33.25■■■□□ 2.91
NPAS3-211ENST00000551634 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
NPAS3-211ENST00000551634 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.24■■■□□ 2.91
NPAS3-211ENST00000551634 NEFLP07196 543 aa33.2■■■□□ 2.9
NPAS3-211ENST00000551634 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.18■■■□□ 2.9
NPAS3-211ENST00000551634 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
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NPAS3-211ENST00000551634 AKNAQ7Z591 1439 aa33.14■■■□□ 2.89
NPAS3-211ENST00000551634 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.12■■■□□ 2.89
NPAS3-211ENST00000551634 BCANQ96GW7 911 aa33.11■■■□□ 2.89
NPAS3-211ENST00000551634 TRIM52Q96A61 297 aa33.1■■■□□ 2.89
NPAS3-211ENST00000551634 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.09■■■□□ 2.89
NPAS3-211ENST00000551634 HECW1Q76N89 1606 aa33.08■■■□□ 2.89
NPAS3-211ENST00000551634 ERCC6Q03468 1493 aa33.03■■■□□ 2.88
NPAS3-211ENST00000551634 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
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NPAS3-211ENST00000551634 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
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NPAS3-211ENST00000551634 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.95■■■□□ 2.87
NPAS3-211ENST00000551634 IQGAP2Q13576 1575 aa32.95■■■□□ 2.86
NPAS3-211ENST00000551634 PBRM1Q86U86 1689 aa32.91■■■□□ 2.86
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NPAS3-211ENST00000551634 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.89■■■□□ 2.85
NPAS3-211ENST00000551634 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.88■■■□□ 2.85
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NPAS3-211ENST00000551634 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.84■■■□□ 2.85
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NPAS3-211ENST00000551634 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
NPAS3-211ENST00000551634 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
NPAS3-211ENST00000551634 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.8■■■□□ 2.84
NPAS3-211ENST00000551634 ROCK1Q13464 1354 aa32.8■■■□□ 2.84
NPAS3-211ENST00000551634 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
NPAS3-211ENST00000551634 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.74■■■□□ 2.83
NPAS3-211ENST00000551634 NCOA1Q15788 1441 aa32.73■■■□□ 2.83
NPAS3-211ENST00000551634 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
NPAS3-211ENST00000551634 ERICH6BQ5W0A0 696 aa32.7■■■□□ 2.83
NPAS3-211ENST00000551634 DAPK1P53355 1430 aa32.7■■■□□ 2.83
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