RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545202.1

AP000439.3-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AP000439.3, Length 2,376 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000439.3-201ENST00000545202 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.78■■□□□ 1.24
AP000439.3-201ENST00000545202 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.76■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 P3H3Q8IVL6 736 aa22.76■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.76■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 TOPBP1Q92547 1522 aa22.75■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.74■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.73■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 NESP48681 1621 aa22.73■■□□□ 1.23
AP000439.3-201ENST00000545202 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
AP000439.3-201ENST00000545202 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.68■■□□□ 1.22
AP000439.3-201ENST00000545202 MAPKBP1O60336 1514 aa22.68■■□□□ 1.22
AP000439.3-201ENST00000545202 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.68■■□□□ 1.22
AP000439.3-201ENST00000545202 CUL7Q14999 1698 aa22.67■■□□□ 1.22
AP000439.3-201ENST00000545202 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
AP000439.3-201ENST00000545202 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.65■■□□□ 1.22
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AP000439.3-201ENST00000545202 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.6■■□□□ 1.21
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AP000439.3-201ENST00000545202 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.56■■□□□ 1.2
AP000439.3-201ENST00000545202 FMN1Q68DA7 1419 aa22.51■■□□□ 1.19
AP000439.3-201ENST00000545202 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.5■■□□□ 1.19
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AP000439.3-201ENST00000545202 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
AP000439.3-201ENST00000545202 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000439.3-201ENST00000545202 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.48■■□□□ 1.19
AP000439.3-201ENST00000545202 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000439.3-201ENST00000545202 SAMD9Q5K651 1589 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000439.3-201ENST00000545202 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.43■■□□□ 1.18
AP000439.3-201ENST00000545202 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.42■■□□□ 1.18
AP000439.3-201ENST00000545202 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.41■■□□□ 1.18
AP000439.3-201ENST00000545202 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
AP000439.3-201ENST00000545202 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000439.3-201ENST00000545202 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.37■■□□□ 1.17
AP000439.3-201ENST00000545202 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.35■■□□□ 1.17
AP000439.3-201ENST00000545202 GRIN2BQ13224 1484 aa22.34■■□□□ 1.17
AP000439.3-201ENST00000545202 PTPRKQ15262 1439 aa22.32■■□□□ 1.16
AP000439.3-201ENST00000545202 NCOA2Q15596 1464 aa22.32■■□□□ 1.16
AP000439.3-201ENST00000545202 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
AP000439.3-201ENST00000545202 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
AP000439.3-201ENST00000545202 KCNH8Q96L42 1107 aa22.31■■□□□ 1.16
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AP000439.3-201ENST00000545202 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
AP000439.3-201ENST00000545202 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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AP000439.3-201ENST00000545202 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.26■■□□□ 1.15
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AP000439.3-201ENST00000545202 TONSLQ96HA7 1378 aa22.21■■□□□ 1.15
AP000439.3-201ENST00000545202 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.21■■□□□ 1.15
AP000439.3-201ENST00000545202 ARHGEF11O15085 1522 aa22.19■■□□□ 1.14
AP000439.3-201ENST00000545202 IQGAP2Q13576 1575 aa22.15■■□□□ 1.14
AP000439.3-201ENST00000545202 HECW1Q76N89 1606 aa22.15■■□□□ 1.14
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AP000439.3-201ENST00000545202 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AP000439.3-201ENST00000545202 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.1■■□□□ 1.13
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AP000439.3-201ENST00000545202 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.07■■□□□ 1.12
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AP000439.3-201ENST00000545202 ARID3CA6NKF2 412 aa22.03■■□□□ 1.12
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AP000439.3-201ENST00000545202 TRIM52Q96A61 297 aa21.99■■□□□ 1.11
AP000439.3-201ENST00000545202 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
AP000439.3-201ENST00000545202 IFT140Q96RY7 1462 aa21.94■■□□□ 1.1
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AP000439.3-201ENST00000545202 KIAA0556O60303 1618 aa21.91■■□□□ 1.1
AP000439.3-201ENST00000545202 DISP1Q96F81 1524 aa21.9■■□□□ 1.1
AP000439.3-201ENST00000545202 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.9■■□□□ 1.1
AP000439.3-201ENST00000545202 FKBP8Q14318 412 aa21.89■■□□□ 1.09
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AP000439.3-201ENST00000545202 BCANQ96GW7 911 aa21.87■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 DAPK1P53355 1430 aa21.86■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 SLC24A1O60721 1099 aa21.86■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 FOXD1Q16676 465 aa21.85■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.84■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.84■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
AP000439.3-201ENST00000545202 GRIN2AQ12879 1464 aa21.83■■□□□ 1.08
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