RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514886.1

PRMT9-204, Transcript of protein arginine methyltransferase 9, humanhuman

TSL 2

Gene PRMT9, Length 2,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT9-204ENST00000514886 IGF1RP08069 1367 aa26.86■■□□□ 1.89
PRMT9-204ENST00000514886 TOPBP1Q92547 1522 aa26.85■■□□□ 1.89
PRMT9-204ENST00000514886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
PRMT9-204ENST00000514886 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 MSH5O43196 834 aa26.81■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.81■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 ARAP1Q96P48 1450 aa26.8■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PRMT9-204ENST00000514886 ITGAEP38570 1179 aa26.75■■□□□ 1.87
PRMT9-204ENST00000514886 MAPKBP1O60336 1514 aa26.74■■□□□ 1.87
PRMT9-204ENST00000514886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.74■■□□□ 1.87
PRMT9-204ENST00000514886 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PRMT9-204ENST00000514886 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.73■■□□□ 1.87
PRMT9-204ENST00000514886 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.7■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.68■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.68■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 WDR97A6NE52 1622 aa26.66■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 CCER2I3L3R5 266 aa26.65■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.64■■□□□ 1.86
PRMT9-204ENST00000514886 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.63■■□□□ 1.85
PRMT9-204ENST00000514886 TRIM52Q96A61 297 aa26.63■■□□□ 1.85
PRMT9-204ENST00000514886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PRMT9-204ENST00000514886 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.54■■□□□ 1.84
PRMT9-204ENST00000514886 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.54■■□□□ 1.84
PRMT9-204ENST00000514886 ANP32CO43423 234 aa26.52■■□□□ 1.84
PRMT9-204ENST00000514886 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRMT9-204ENST00000514886 P3H3Q8IVL6 736 aa26.49■■□□□ 1.83
PRMT9-204ENST00000514886 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PRMT9-204ENST00000514886 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.47■■□□□ 1.83
PRMT9-204ENST00000514886 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.47■■□□□ 1.83
PRMT9-204ENST00000514886 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.44■■□□□ 1.82
PRMT9-204ENST00000514886 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.41■■□□□ 1.82
PRMT9-204ENST00000514886 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.41■■□□□ 1.82
PRMT9-204ENST00000514886 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRMT9-204ENST00000514886 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.36■■□□□ 1.81
PRMT9-204ENST00000514886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.36■■□□□ 1.81
PRMT9-204ENST00000514886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PRMT9-204ENST00000514886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
PRMT9-204ENST00000514886 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PRMT9-204ENST00000514886 CUL7Q14999 1698 aa26.31■■□□□ 1.8
PRMT9-204ENST00000514886 TIAM1Q13009 1591 aa26.31■■□□□ 1.8
PRMT9-204ENST00000514886 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PRMT9-204ENST00000514886 MAP3K1Q13233 1512 aa26.29■■□□□ 1.8
PRMT9-204ENST00000514886 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PRMT9-204ENST00000514886 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.26■■□□□ 1.79
PRMT9-204ENST00000514886 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.25■■□□□ 1.79
PRMT9-204ENST00000514886 ERCC6Q03468 1493 aa26.24■■□□□ 1.79
PRMT9-204ENST00000514886 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
PRMT9-204ENST00000514886 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PRMT9-204ENST00000514886 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.2■■□□□ 1.78
PRMT9-204ENST00000514886 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.18■■□□□ 1.78
PRMT9-204ENST00000514886 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.18■■□□□ 1.78
PRMT9-204ENST00000514886 WDR62O43379 1518 aa26.15■■□□□ 1.78
PRMT9-204ENST00000514886 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.15■■□□□ 1.78
PRMT9-204ENST00000514886 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PRMT9-204ENST00000514886 PBRM1Q86U86 1689 aa26.1■■□□□ 1.77
PRMT9-204ENST00000514886 IFT140Q96RY7 1462 aa26.08■■□□□ 1.77
PRMT9-204ENST00000514886 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PRMT9-204ENST00000514886 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.08■■□□□ 1.77
PRMT9-204ENST00000514886 TONSLQ96HA7 1378 aa26.08■■□□□ 1.76
PRMT9-204ENST00000514886 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.07■■□□□ 1.76
PRMT9-204ENST00000514886 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PRMT9-204ENST00000514886 GRIN2BQ13224 1484 aa26.05■■□□□ 1.76
PRMT9-204ENST00000514886 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.03■■□□□ 1.76
PRMT9-204ENST00000514886 ADAMTS12P58397 1594 aa26■■□□□ 1.75
PRMT9-204ENST00000514886 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PRMT9-204ENST00000514886 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.99■■□□□ 1.75
PRMT9-204ENST00000514886 NBR1Q14596 966 aa25.98■■□□□ 1.75
PRMT9-204ENST00000514886 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PRMT9-204ENST00000514886 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.95■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.94■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 SAMD9Q5K651 1589 aa25.93■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 FMN1Q68DA7 1419 aa25.92■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.92■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 FBLN2P98095 1184 aa25.91■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.9■■□□□ 1.74
PRMT9-204ENST00000514886 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.88■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.88■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 SLC24A1O60721 1099 aa25.86■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 UACAQ9BZF9 1416 aa25.86■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 ARID3CA6NKF2 412 aa25.86■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 IQGAP2Q13576 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 CCDC184Q52MB2 194 aa25.85■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 NCOA2Q15596 1464 aa25.85■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.84■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PRMT9-204ENST00000514886 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.81■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.79■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 GRIN2AQ12879 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.78■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 HFM1A2PYH4 1435 aa25.78■■□□□ 1.72
PRMT9-204ENST00000514886 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms