RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.16■■■■□ 3.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 TONSLQ96HA7 1378 aa38.4■■■■□ 3.74
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SH3BP2-221ENST00000511747 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.38■■■■□ 3.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.3■■■■□ 3.72
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SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGEF11O15085 1522 aa38.11■■■■□ 3.69
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SH3BP2-221ENST00000511747 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.1■■■■□ 3.69
SH3BP2-221ENST00000511747 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.09■■■■□ 3.69
SH3BP2-221ENST00000511747 BCANQ96GW7 911 aa38.07■■■■□ 3.69
SH3BP2-221ENST00000511747 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.07■■■■□ 3.68
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SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP37.68■■■■□ 3.62
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SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.57■■■■□ 3.61
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
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