RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
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RABGEF1-208ENST00000510829 CUL7Q14999 1698 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 TIAM1Q13009 1591 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.2
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RABGEF1-208ENST00000510829 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.16■□□□□ 0.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP3K1Q13233 1512 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 FBLN2P98095 1184 aa16.15■□□□□ 0.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 WDR97A6NE52 1622 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 GRIN2BQ13224 1484 aa16.08■□□□□ 0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.07■□□□□ 0.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 IFT140Q96RY7 1462 aa16.06■□□□□ 0.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 PBRM1Q86U86 1689 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.98■□□□□ 0.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 SAMD9Q5K651 1589 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 MIER1Q8N108 512 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-208ENST00000510829 ADAMTS12P58397 1594 aa15.96■□□□□ 0.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 NCOA2Q15596 1464 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TRIM52Q96A61 297 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-208ENST00000510829 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.9■□□□□ 0.14
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RABGEF1-208ENST00000510829 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
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RABGEF1-208ENST00000510829 HECW1Q76N89 1606 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 JPH4Q96JJ6 628 aa15.86■□□□□ 0.13
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RABGEF1-208ENST00000510829 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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RABGEF1-208ENST00000510829 MAPKBP1O60336 1514 aa15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPRKQ15262 1439 aa15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TONSLQ96HA7 1378 aa15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 SYNJ2O15056 1496 aa15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 HFM1A2PYH4 1435 aa15.78■□□□□ 0.12
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RABGEF1-208ENST00000510829 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.77■□□□□ 0.12
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RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
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RABGEF1-208ENST00000510829 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 MIA2Q96PC5 1412 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP170Q5SW79 1584 aa15.7■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.69■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGEF11O15085 1522 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXD1Q16676 465 aa15.67■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.67■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 NUP160Q12769 1436 aa15.66■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
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