RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 ITGAEP38570 1179 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD54-210ENST00000498417 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD54-210ENST00000498417 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD54-210ENST00000498417 CUL7Q14999 1698 aa22.83■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 WDR97A6NE52 1622 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 MAPKBP1O60336 1514 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-210ENST00000498417 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54-210ENST00000498417 FMN1Q68DA7 1419 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-210ENST00000498417 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54-210ENST00000498417 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SAMD9Q5K651 1589 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54-210ENST00000498417 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-210ENST00000498417 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-210ENST00000498417 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54-210ENST00000498417 GRIN2BQ13224 1484 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54-210ENST00000498417 PTPRKQ15262 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-210ENST00000498417 NCOA2Q15596 1464 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD54-210ENST00000498417 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54-210ENST00000498417 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD54-210ENST00000498417 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKRD54-210ENST00000498417 PBRM1Q86U86 1689 aa22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54-210ENST00000498417 HFM1A2PYH4 1435 aa22.39■■□□□ 1.18
ANKRD54-210ENST00000498417 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGEF11O15085 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 ADAMTS12P58397 1594 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 IQGAP2Q13576 1575 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 NAIPQ13075 1403 aa22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54-210ENST00000498417 UACAQ9BZF9 1416 aa22.33■■□□□ 1.16
ANKRD54-210ENST00000498417 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54-210ENST00000498417 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54-210ENST00000498417 KCNH8Q96L42 1107 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54-210ENST00000498417 HECW1Q76N89 1606 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54-210ENST00000498417 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 IFT140Q96RY7 1462 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 TONSLQ96HA7 1378 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 WDR62O43379 1518 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 ARID3CA6NKF2 412 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-210ENST00000498417 MIA2Q96PC5 1412 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-210ENST00000498417 DISP1Q96F81 1524 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-210ENST00000498417 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 AKNAQ7Z591 1439 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 KDM6BO15054 1643 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA0556O60303 1618 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 GRIN2AQ12879 1464 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 TRIM52Q96A61 297 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-210ENST00000498417 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-210ENST00000498417 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.03■■□□□ 1.12
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 DAPK1P53355 1430 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 CCER2I3L3R5 266 aa22■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 ANP32CO43423 234 aa22■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCC5O15440 1437 aa21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 ROCK1Q13464 1354 aa21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 ERCC6Q03468 1493 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 FOXD1Q16676 465 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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