RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.73■■■□□ 2.83
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-210ENST00000498417 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD54-210ENST00000498417 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-210ENST00000498417 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-210ENST00000498417 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.09■■□□□ 1.93
ANKRD54-210ENST00000498417 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD54-210ENST00000498417 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD54-210ENST00000498417 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-210ENST00000498417 SCRIBQ14160 1630 aa26.06■■□□□ 1.76
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCC9O60706 1549 aa26.05■■□□□ 1.76
ANKRD54-210ENST00000498417 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-210ENST00000498417 NACADO15069 1562 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-210ENST00000498417 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54-210ENST00000498417 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54-210ENST00000498417 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54-210ENST00000498417 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-210ENST00000498417 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54-210ENST00000498417 HRCP23327 699 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54-210ENST00000498417 TRIM41Q8WV44 630 aa25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54-210ENST00000498417 WIZO95785 1651 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-210ENST00000498417 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-210ENST00000498417 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54-210ENST00000498417 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54-210ENST00000498417 SMARCA4P51532 1647 aa24.93■■□□□ 1.58
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54-210ENST00000498417 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54-210ENST00000498417 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54-210ENST00000498417 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54-210ENST00000498417 SMARCA2P51531 1590 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-210ENST00000498417 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-210ENST00000498417 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCC8Q09428 1581 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD54-210ENST00000498417 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-210ENST00000498417 SOGA1O94964 1423 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-210ENST00000498417 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54-210ENST00000498417 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54-210ENST00000498417 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.33■■□□□ 1.48
ANKRD54-210ENST00000498417 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD54-210ENST00000498417 EEA1Q15075 1411 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD54-210ENST00000498417 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54-210ENST00000498417 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP162Q5TB80 1403 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-210ENST00000498417 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-210ENST00000498417 SYNJ1O43426 1573 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-210ENST00000498417 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54-210ENST00000498417 GOLGA3Q08378 1498 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54-210ENST00000498417 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF21BO75037 1637 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD54-210ENST00000498417 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54-210ENST00000498417 NCAPD3P42695 1498 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD54-210ENST00000498417 TOP2BQ02880 1626 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-210ENST00000498417 HMGXB3Q12766 1538 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-210ENST00000498417 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54-210ENST00000498417 CLIP1P30622 1438 aa23.83■■□□□ 1.4
ANKRD54-210ENST00000498417 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54-210ENST00000498417 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54-210ENST00000498417 CUX1P39880 1505 aa23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54-210ENST00000498417 CFTRP13569 1480 aa23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54-210ENST00000498417 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54-210ENST00000498417 PRXQ9BXM0 1461 aa23.65■■□□□ 1.38
ANKRD54-210ENST00000498417 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-210ENST00000498417 APLP2Q06481 763 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF27Q86VH2 1401 aa23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54-210ENST00000498417 ARAP1Q96P48 1450 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-210ENST00000498417 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54-210ENST00000498417 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-210ENST00000498417 PRDM2Q13029 1718 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-210ENST00000498417 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54-210ENST00000498417 IGF1RP08069 1367 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CUX2O14529 1486 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-210ENST00000498417 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54-210ENST00000498417 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ANKRD54-210ENST00000498417 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-210ENST00000498417 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-210ENST00000498417 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-210ENST00000498417 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-210ENST00000498417 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
ANKRD54-210ENST00000498417 NEUROD1Q13562 356 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-210ENST00000498417 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-210ENST00000498417 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-210ENST00000498417 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-210ENST00000498417 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-210ENST00000498417 NESP48681 1621 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54-210ENST00000498417 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-210ENST00000498417 TOPBP1Q92547 1522 aa23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54-210ENST00000498417 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54-210ENST00000498417 MAP3K1Q13233 1512 aa23■■□□□ 1.27
ANKRD54-210ENST00000498417 TIAM1Q13009 1591 aa23■■□□□ 1.27
ANKRD54-210ENST00000498417 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54-210ENST00000498417 MIER1Q8N108 512 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54-210ENST00000498417 P3H3Q8IVL6 736 aa22.94■■□□□ 1.26
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