RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF11	O15085	1522 aa		20.27	■□□□□ 0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		20.26	■□□□□ 0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TOPBP1	Q92547	1522 aa		20.23	■□□□□ 0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		20.23	■□□□□ 0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM2	Q13029	1718 aa		20.22	■□□□□ 0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC8	Q09428	1581 aa		20.19	■□□□□ 0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	20.16	■□□□□ 0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	20.12	■□□□□ 0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		20.12	■□□□□ 0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ARAP1	Q96P48	1450 aa		20.05	■□□□□ 0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD1	O14646	1710 aa		20.05	■□□□□ 0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		19.98	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE6	P0CI01	402 aa		19.98	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		19.98	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		19.97	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SOGA1	O94964	1423 aa		19.96	■□□□□ 0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	19.95	■□□□□ 0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		19.91	■□□□□ 0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	AKT1S1	Q96B36	256 aa		19.86	■□□□□ 0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNJ1	O43426	1573 aa		19.85	■□□□□ 0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		19.85	■□□□□ 0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		19.81	■□□□□ 0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIN2B	Q13224	1484 aa		19.81	■□□□□ 0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR97	A6NE52	1622 aa		19.8	■□□□□ 0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNJ2	O15056	1496 aa		19.77	■□□□□ 0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CUX1	P39880	1505 aa		19.74	■□□□□ 0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		19.73	■□□□□ 0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		19.72	■□□□□ 0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		19.71	■□□□□ 0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PBRM1	Q86U86	1689 aa		19.62	■□□□□ 0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		19.57	■□□□□ 0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIN2A	Q12879	1464 aa		19.54	■□□□□ 0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		19.53	■□□□□ 0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	19.51	■□□□□ 0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		19.5	■□□□□ 0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP8	Q14318	412 aa		19.47	■□□□□ 0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP170	Q5SW79	1584 aa		19.46	■□□□□ 0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP160	Q12769	1436 aa		19.45	■□□□□ 0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	19.45	■□□□□ 0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS12	P58397	1594 aa		19.44	■□□□□ 0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		19.43	■□□□□ 0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	19.37	■□□□□ 0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PITPNM1	O00562	1244 aa		19.36	■□□□□ 0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	19.36	■□□□□ 0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		19.36	■□□□□ 0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SHROOM2	Q13796	1616 aa		19.34	■□□□□ 0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	JPH4	Q96JJ6	628 aa		19.34	■□□□□ 0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PROM2	Q8N271	834 aa		19.33	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		19.32	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		19.32	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	TOP2B	Q02880	1626 aa		19.32	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		19.3	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		19.29	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		19.29	■□□□□ 0.68
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		19.25	■□□□□ 0.67
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		19.22	■□□□□ 0.67
SKAP2-209	ENST00000497511	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		19.17	■□□□□ 0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPKBP1	O60336	1514 aa		19.15	■□□□□ 0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR29	P0C7W0	189 aa		19.14	■□□□□ 0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DIP2B	Q9P265	1576 aa		19.13	■□□□□ 0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM6B	O15054	1643 aa		19.11	■□□□□ 0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		19.11	■□□□□ 0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		19.09	■□□□□ 0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		19.08	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	19.08	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRG	P23470	1445 aa		19.04	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF27	Q86VH2	1401 aa		19.03	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		19.03	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF1R	P08069	1367 aa		19.03	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPOAP1	O95153	1857 aa		19.02	■□□□□ 0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEH	Q6S545	545 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL7	Q14999	1698 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		18.95	■□□□□ 0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC2	Q92887	1545 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ASXL2	Q76L83	1435 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRL1	O94910	1474 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	UACA	Q9BZF9	1416 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GLI2	P10070	1586 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	IQGAP2	Q13576	1575 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG5	O94827	1062 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.78	■□□□□ 0.6

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