RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CUX2O14529 1486 aa22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEFMP07197 916 aa22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRS2Q9HD23 443 aa22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMC1Q8TDI8 760 aa22.54■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPY4P0CV99 314 aa22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPY10P0CW01 314 aa22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERCC6Q03468 1493 aa22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.41■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGL3Q3MIN7 710 aa22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCAPD3P42695 1498 aa22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNH8Q96L42 1107 aa22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBR1Q14596 966 aa22.27■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.26■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.17■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARXQ96QS3 562 aa22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FMN1Q68DA7 1419 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHG5O94827 1062 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGXB3Q12766 1538 aa22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFTRP13569 1480 aa21.99■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.98■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGF1RP08069 1367 aa21.95■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.95■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEUROD2Q15784 382 aa21.95■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.92■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNJ1O43426 1573 aa21.9■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXD1Q16676 465 aa21.9■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.88■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.88■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.87■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.86■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.85■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.84■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.82■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.81■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf37Q86TY3 774 aa21.81■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF21BO75037 1637 aa21.78■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOP2BQ02880 1626 aa21.77■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDCA8Q53HL2 280 aa21.77■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS3P49796 1198 aa21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JPH4Q96JJ6 628 aa21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NESP48681 1621 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP53Q96M91 514 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CUX1P39880 1505 aa21.72■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.72■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKD2Q13563 968 aa21.7■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.7■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0G2JS52 829 aa21.68■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.68■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.66■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRXQ9BXM0 1461 aa21.65■■□□□ 1.06
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