RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TRPC1-203ENST00000476941 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.29■■□□□ 1.96
TRPC1-203ENST00000476941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.28■■□□□ 1.96
TRPC1-203ENST00000476941 FKBP8Q14318 412 aa27.27■■□□□ 1.96
TRPC1-203ENST00000476941 KCNH8Q96L42 1107 aa27.25■■□□□ 1.95
TRPC1-203ENST00000476941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.24■■□□□ 1.95
TRPC1-203ENST00000476941 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.23■■□□□ 1.95
TRPC1-203ENST00000476941 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TRPC1-203ENST00000476941 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.22■■□□□ 1.95
TRPC1-203ENST00000476941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.22■■□□□ 1.95
TRPC1-203ENST00000476941 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.2■■□□□ 1.94
TRPC1-203ENST00000476941 NESP48681 1621 aa27.2■■□□□ 1.94
TRPC1-203ENST00000476941 TIAM1Q13009 1591 aa27.14■■□□□ 1.94
TRPC1-203ENST00000476941 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.14■■□□□ 1.93
TRPC1-203ENST00000476941 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TRPC1-203ENST00000476941 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.09■■□□□ 1.93
TRPC1-203ENST00000476941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.08■■□□□ 1.93
TRPC1-203ENST00000476941 PRDM2Q13029 1718 aa27.08■■□□□ 1.93
TRPC1-203ENST00000476941 NEFLP07196 543 aa27.07■■□□□ 1.92
TRPC1-203ENST00000476941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TRPC1-203ENST00000476941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.04■■□□□ 1.92
TRPC1-203ENST00000476941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TRPC1-203ENST00000476941 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TRPC1-203ENST00000476941 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TRPC1-203ENST00000476941 TOPBP1Q92547 1522 aa27■■□□□ 1.91
TRPC1-203ENST00000476941 MAPKBP1O60336 1514 aa26.97■■□□□ 1.91
TRPC1-203ENST00000476941 MSH5O43196 834 aa26.96■■□□□ 1.91
TRPC1-203ENST00000476941 ARID3CA6NKF2 412 aa26.95■■□□□ 1.9
TRPC1-203ENST00000476941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.92■■□□□ 1.9
TRPC1-203ENST00000476941 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.91■■□□□ 1.9
TRPC1-203ENST00000476941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.91■■□□□ 1.9
TRPC1-203ENST00000476941 MAP3K1Q13233 1512 aa26.9■■□□□ 1.9
TRPC1-203ENST00000476941 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.85■■□□□ 1.89
TRPC1-203ENST00000476941 WDR97A6NE52 1622 aa26.84■■□□□ 1.89
TRPC1-203ENST00000476941 TRIM52Q96A61 297 aa26.84■■□□□ 1.89
TRPC1-203ENST00000476941 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.83■■□□□ 1.88
TRPC1-203ENST00000476941 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.82■■□□□ 1.88
TRPC1-203ENST00000476941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TRPC1-203ENST00000476941 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
TRPC1-203ENST00000476941 FMN1Q68DA7 1419 aa26.77■■□□□ 1.88
TRPC1-203ENST00000476941 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.75■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.75■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.74■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 TONSLQ96HA7 1378 aa26.73■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.72■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.71■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.71■■□□□ 1.87
TRPC1-203ENST00000476941 PTPRKQ15262 1439 aa26.68■■□□□ 1.86
TRPC1-203ENST00000476941 CUL7Q14999 1698 aa26.66■■□□□ 1.86
TRPC1-203ENST00000476941 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TRPC1-203ENST00000476941 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.63■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.63■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.63■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.63■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 ANP32CO43423 234 aa26.61■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 NCOA2Q15596 1464 aa26.61■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 CCER2I3L3R5 266 aa26.58■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.58■■□□□ 1.85
TRPC1-203ENST00000476941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.56■■□□□ 1.84
TRPC1-203ENST00000476941 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TRPC1-203ENST00000476941 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TRPC1-203ENST00000476941 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.54■■□□□ 1.84
TRPC1-203ENST00000476941 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.847e-6■■■□□ 16.5
TRPC1-203ENST00000476941 FOXD1Q16676 465 aa26.53■■□□□ 1.84
TRPC1-203ENST00000476941 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.52■■□□□ 1.84
TRPC1-203ENST00000476941 HFM1A2PYH4 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
TRPC1-203ENST00000476941 NAIPQ13075 1403 aa26.5■■□□□ 1.83
TRPC1-203ENST00000476941 UACAQ9BZF9 1416 aa26.48■■□□□ 1.83
TRPC1-203ENST00000476941 GRIN2BQ13224 1484 aa26.48■■□□□ 1.83
TRPC1-203ENST00000476941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.47■■□□□ 1.83
TRPC1-203ENST00000476941 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.43■■□□□ 1.82
TRPC1-203ENST00000476941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.43■■□□□ 1.82
TRPC1-203ENST00000476941 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.43■■□□□ 1.82
TRPC1-203ENST00000476941 SAMD9Q5K651 1589 aa26.42■■□□□ 1.82
TRPC1-203ENST00000476941 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.41■■□□□ 1.82
TRPC1-203ENST00000476941 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.35■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 FBLN2P98095 1184 aa26.35■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.34■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TRPC1-203ENST00000476941 NBR1Q14596 966 aa26.3■■□□□ 1.8
TRPC1-203ENST00000476941 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.3■■□□□ 1.8
TRPC1-203ENST00000476941 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TRPC1-203ENST00000476941 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.29■■□□□ 1.8
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TRPC1-203ENST00000476941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
TRPC1-203ENST00000476941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TRPC1-203ENST00000476941 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TRPC1-203ENST00000476941 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.25■■□□□ 1.79
TRPC1-203ENST00000476941 IQGAP2Q13576 1575 aa26.24■■□□□ 1.79
TRPC1-203ENST00000476941 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
TRPC1-203ENST00000476941 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.23■■□□□ 1.79
TRPC1-203ENST00000476941 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
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