RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
VGF-202ENST00000445482 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
VGF-202ENST00000445482 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.37■■■□□ 2.61
VGF-202ENST00000445482 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.36■■■□□ 2.61
VGF-202ENST00000445482 TIAM1Q13009 1591 aa31.33■■■□□ 2.61
VGF-202ENST00000445482 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.26■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.23■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.22■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.22■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.22■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
VGF-202ENST00000445482 MAP3K1Q13233 1512 aa31.19■■■□□ 2.58
VGF-202ENST00000445482 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.17■■■□□ 2.58
VGF-202ENST00000445482 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
VGF-202ENST00000445482 CUL7Q14999 1698 aa31.15■■■□□ 2.58
VGF-202ENST00000445482 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.1■■■□□ 2.57
VGF-202ENST00000445482 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.09■■■□□ 2.57
VGF-202ENST00000445482 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.08■■■□□ 2.57
VGF-202ENST00000445482 WDR97A6NE52 1622 aa31.08■■■□□ 2.57
VGF-202ENST00000445482 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.08■■■□□ 2.57
VGF-202ENST00000445482 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.04■■■□□ 2.56
VGF-202ENST00000445482 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.03■■■□□ 2.56
VGF-202ENST00000445482 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.03■■■□□ 2.56
VGF-202ENST00000445482 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.01■■■□□ 2.55
VGF-202ENST00000445482 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.99■■■□□ 2.55
VGF-202ENST00000445482 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.99■■■□□ 2.55
VGF-202ENST00000445482 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.96■■■□□ 2.55
VGF-202ENST00000445482 FMN1Q68DA7 1419 aa30.91■■■□□ 2.54
VGF-202ENST00000445482 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
VGF-202ENST00000445482 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.54
VGF-202ENST00000445482 MAPKBP1O60336 1514 aa30.88■■■□□ 2.53
VGF-202ENST00000445482 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.85■■■□□ 2.53
VGF-202ENST00000445482 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.83■■■□□ 2.53
VGF-202ENST00000445482 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
VGF-202ENST00000445482 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.8■■■□□ 2.52
VGF-202ENST00000445482 SAMD9Q5K651 1589 aa30.79■■■□□ 2.52
VGF-202ENST00000445482 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.75■■■□□ 2.51
VGF-202ENST00000445482 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.73■■■□□ 2.51
VGF-202ENST00000445482 BCL11AQ9H165 835 aa30.71■■■□□ 2.51
VGF-202ENST00000445482 GRIN2BQ13224 1484 aa30.67■■■□□ 2.5
VGF-202ENST00000445482 PBRM1Q86U86 1689 aa30.67■■■□□ 2.5
VGF-202ENST00000445482 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.5
VGF-202ENST00000445482 NCOA2Q15596 1464 aa30.63■■■□□ 2.49
VGF-202ENST00000445482 ARID3CA6NKF2 412 aa30.61■■■□□ 2.49
VGF-202ENST00000445482 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.61■■■□□ 2.49
VGF-202ENST00000445482 PTPRKQ15262 1439 aa30.6■■■□□ 2.49
VGF-202ENST00000445482 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.57■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.56■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.55■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 ADAMTS12P58397 1594 aa30.53■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 IQGAP2Q13576 1575 aa30.53■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.52■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.51■■■□□ 2.48
VGF-202ENST00000445482 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.51■■■□□ 2.47
VGF-202ENST00000445482 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
VGF-202ENST00000445482 HFM1A2PYH4 1435 aa30.45■■■□□ 2.47
VGF-202ENST00000445482 KCNH8Q96L42 1107 aa30.45■■■□□ 2.47
VGF-202ENST00000445482 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.45■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.44■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.43■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 HECW1Q76N89 1606 aa30.42■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.41■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 NAIPQ13075 1403 aa30.4■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
VGF-202ENST00000445482 IFT140Q96RY7 1462 aa30.38■■■□□ 2.45
VGF-202ENST00000445482 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.37■■■□□ 2.45
VGF-202ENST00000445482 UACAQ9BZF9 1416 aa30.37■■■□□ 2.45
VGF-202ENST00000445482 ARHGEF11O15085 1522 aa30.35■■■□□ 2.45
VGF-202ENST00000445482 TONSLQ96HA7 1378 aa30.34■■■□□ 2.45
VGF-202ENST00000445482 WDR62O43379 1518 aa30.32■■■□□ 2.44
VGF-202ENST00000445482 BCANQ96GW7 911 aa30.27■■■□□ 2.44
VGF-202ENST00000445482 ERCC6Q03468 1493 aa30.26■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 FKBP8Q14318 412 aa30.25■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 TRIM52Q96A61 297 aa30.24■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.23■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 DISP1Q96F81 1524 aa30.21■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 FBLN2P98095 1184 aa30.21■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 GRIN2AQ12879 1464 aa30.2■■■□□ 2.43
VGF-202ENST00000445482 KIAA0556O60303 1618 aa30.2■■■□□ 2.42
VGF-202ENST00000445482 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
VGF-202ENST00000445482 KDM6BO15054 1643 aa30.15■■■□□ 2.42
VGF-202ENST00000445482 NEFLP07196 543 aa30.14■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 MIA2Q96PC5 1412 aa30.14■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.11■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 CCER2I3L3R5 266 aa30.1■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 FOXD1Q16676 465 aa30.08■■■□□ 2.41
VGF-202ENST00000445482 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.07■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms