RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439695.1

RPSAP41-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP41, Length 860 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP41-201ENST00000439695 GABBR2O75899 941 aa16.77■□□□□ 0.28
RPSAP41-201ENST00000439695 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
RPSAP41-201ENST00000439695 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
RPSAP41-201ENST00000439695 BCANQ96GW7 911 aa16.75■□□□□ 0.27
RPSAP41-201ENST00000439695 TRIM41Q8WV44 630 aa16.74■□□□□ 0.27
RPSAP41-201ENST00000439695 CFAP44Q96MT7 982 aa16.7■□□□□ 0.26
RPSAP41-201ENST00000439695 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.65■□□□□ 0.26
RPSAP41-201ENST00000439695 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RPSAP41-201ENST00000439695 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.6■□□□□ 0.25
RPSAP41-201ENST00000439695 GSE1Q14687 1217 aa16.59■□□□□ 0.25
RPSAP41-201ENST00000439695 NUBP1P53384 320 aa16.51■□□□□ 0.23
RPSAP41-201ENST00000439695 CHADLQ6NUI6 762 aa16.51■□□□□ 0.23
RPSAP41-201ENST00000439695 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.51■□□□□ 0.23
RPSAP41-201ENST00000439695 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.51■□□□□ 0.23
RPSAP41-201ENST00000439695 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.47■□□□□ 0.23
RPSAP41-201ENST00000439695 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.46■□□□□ 0.23
RPSAP41-201ENST00000439695 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.45■□□□□ 0.22
RPSAP41-201ENST00000439695 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RPSAP41-201ENST00000439695 PRR29P0C7W0 189 aa16.41■□□□□ 0.22
RPSAP41-201ENST00000439695 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.41■□□□□ 0.22
RPSAP41-201ENST00000439695 CREBZFQ9NS37 354 aa16.38■□□□□ 0.21
RPSAP41-201ENST00000439695 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM212AQ96EL1 285 aa16.37■□□□□ 0.21
RPSAP41-201ENST00000439695 POTEIP0CG38 1075 aa16.34■□□□□ 0.21
RPSAP41-201ENST00000439695 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RPSAP41-201ENST00000439695 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RPSAP41-201ENST00000439695 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
RPSAP41-201ENST00000439695 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RPSAP41-201ENST00000439695 CLCN6P51797 869 aa16.28■□□□□ 0.2
RPSAP41-201ENST00000439695 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
RPSAP41-201ENST00000439695 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RPSAP41-201ENST00000439695 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.23■□□□□ 0.19
RPSAP41-201ENST00000439695 RASEFQ8IZ41 740 aa16.21■□□□□ 0.19
RPSAP41-201ENST00000439695 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.21■□□□□ 0.19
RPSAP41-201ENST00000439695 STK25O00506 426 aa16.2■□□□□ 0.18
RPSAP41-201ENST00000439695 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.19■□□□□ 0.18
RPSAP41-201ENST00000439695 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RPSAP41-201ENST00000439695 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RPSAP41-201ENST00000439695 NBR1Q14596 966 aa16.11■□□□□ 0.17
RPSAP41-201ENST00000439695 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RPSAP41-201ENST00000439695 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RPSAP41-201ENST00000439695 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RPSAP41-201ENST00000439695 PYGBP11216 843 aa16.07■□□□□ 0.16
RPSAP41-201ENST00000439695 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RPSAP41-201ENST00000439695 STK24Q9Y6E0 443 aa16.07■□□□□ 0.16
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPSAP41-201ENST00000439695 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.98■□□□□ 0.15
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RPSAP41-201ENST00000439695 OTUD5Q96G74 571 aa15.93■□□□□ 0.14
RPSAP41-201ENST00000439695 POTEMA6NI47 508 aa15.92■□□□□ 0.14
RPSAP41-201ENST00000439695 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RPSAP41-201ENST00000439695 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RPSAP41-201ENST00000439695 POTEGQ6S5H5 508 aa15.84■□□□□ 0.13
RPSAP41-201ENST00000439695 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
RPSAP41-201ENST00000439695 POTEB2H3BUK9 544 aa15.79■□□□□ 0.12
RPSAP41-201ENST00000439695 P3H3Q8IVL6 736 aa15.77■□□□□ 0.12
RPSAP41-201ENST00000439695 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.76■□□□□ 0.11
RPSAP41-201ENST00000439695 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RPSAP41-201ENST00000439695 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.73■□□□□ 0.11
RPSAP41-201ENST00000439695 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.73■□□□□ 0.11
RPSAP41-201ENST00000439695 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.71■□□□□ 0.11
RPSAP41-201ENST00000439695 PSEN1P49768 467 aa15.7■□□□□ 0.1
RPSAP41-201ENST00000439695 WDR70Q9NW82 654 aa15.67■□□□□ 0.1
RPSAP41-201ENST00000439695 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.65■□□□□ 0.1
RPSAP41-201ENST00000439695 PHF12Q96QT6 1004 aa15.65■□□□□ 0.1
RPSAP41-201ENST00000439695 MFRPQ9BY79 579 aa15.65■□□□□ 0.1
RPSAP41-201ENST00000439695 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.58■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 IFNL1Q8IU54 200 aa15.57■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 METRNQ9UJH8 293 aa15.56■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 KIF12Q96FN5 646 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 SOX12O15370 315 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 NLRP6P59044 892 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 MAP3K13O43283 966 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP41-201ENST00000439695 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 SLC39A7Q92504 469 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 CABP2Q9NPB3 220 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 C7P10643 843 aa15.48■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 PPP1R37O75864 691 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPSAP41-201ENST00000439695 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.45■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.42■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.42■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 POTEJP0CG39 1038 aa15.41■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.41■□□□□ 0.06
RPSAP41-201ENST00000439695 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
RPSAP41-201ENST00000439695 E2F4Q16254 413 aa15.39■□□□□ 0.05
RPSAP41-201ENST00000439695 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RPSAP41-201ENST00000439695 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.28■□□□□ 0.04
RPSAP41-201ENST00000439695 PDE4AP27815 886 aa15.28■□□□□ 0.04
RPSAP41-201ENST00000439695 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.28■□□□□ 0.04
RPSAP41-201ENST00000439695 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.27■□□□□ 0.04
RPSAP41-201ENST00000439695 GOLGA2Q08379 1002 aa15.26■□□□□ 0.03
RPSAP41-201ENST00000439695 MFSD10Q14728 455 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms