RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437212.7

TMPRSS4-201, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMPRSS4, Length 2,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-201ENST00000437212 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS4-201ENST00000437212 ITGAEP38570 1179 aa22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS4-201ENST00000437212 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS4-201ENST00000437212 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 CUL7Q14999 1698 aa22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS4-201ENST00000437212 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS4-201ENST00000437212 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS4-201ENST00000437212 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4-201ENST00000437212 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS4-201ENST00000437212 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS4-201ENST00000437212 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.77■■□□□ 1.23
TMPRSS4-201ENST00000437212 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4-201ENST00000437212 TOPBP1Q92547 1522 aa22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS4-201ENST00000437212 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4-201ENST00000437212 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS4-201ENST00000437212 WDR97A6NE52 1622 aa22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS4-201ENST00000437212 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4-201ENST00000437212 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS4-201ENST00000437212 FMN1Q68DA7 1419 aa22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS4-201ENST00000437212 P3H3Q8IVL6 736 aa22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS4-201ENST00000437212 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS4-201ENST00000437212 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4-201ENST00000437212 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS4-201ENST00000437212 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS4-201ENST00000437212 SAMD9Q5K651 1589 aa22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 HFM1A2PYH4 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 NESP48681 1621 aa22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4-201ENST00000437212 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 UACAQ9BZF9 1416 aa22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 GRIN2BQ13224 1484 aa22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 KCNH8Q96L42 1107 aa22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 TONSLQ96HA7 1378 aa22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 CCER2I3L3R5 266 aa22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS4-201ENST00000437212 NCOA2Q15596 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS4-201ENST00000437212 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS4-201ENST00000437212 PTPRKQ15262 1439 aa22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4-201ENST00000437212 ANP32CO43423 234 aa22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4-201ENST00000437212 NAIPQ13075 1403 aa22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS4-201ENST00000437212 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS4-201ENST00000437212 ARHGEF11O15085 1522 aa22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS4-201ENST00000437212 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS4-201ENST00000437212 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4-201ENST00000437212 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS4-201ENST00000437212 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS4-201ENST00000437212 HECW1Q76N89 1606 aa22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 AKNAQ7Z591 1439 aa22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 NEFLP07196 543 aa22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4-201ENST00000437212 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4-201ENST00000437212 FKBP8Q14318 412 aa22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4-201ENST00000437212 PBRM1Q86U86 1689 aa22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4-201ENST00000437212 IQGAP2Q13576 1575 aa22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4-201ENST00000437212 MIA2Q96PC5 1412 aa22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4-201ENST00000437212 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4-201ENST00000437212 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4-201ENST00000437212 BCANQ96GW7 911 aa22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4-201ENST00000437212 ADAMTS12P58397 1594 aa22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4-201ENST00000437212 TRIM52Q96A61 297 aa22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4-201ENST00000437212 WDR62O43379 1518 aa22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4-201ENST00000437212 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4-201ENST00000437212 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4-201ENST00000437212 KDM6BO15054 1643 aa22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4-201ENST00000437212 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4-201ENST00000437212 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 ROCK1Q13464 1354 aa22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS4-201ENST00000437212 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS4-201ENST00000437212 DAPK1P53355 1430 aa22■■□□□ 1.11
TMPRSS4-201ENST00000437212 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS4-201ENST00000437212 KIAA0556O60303 1618 aa21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4-201ENST00000437212 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS4-201ENST00000437212 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS4-201ENST00000437212 NCOA1Q15788 1441 aa21.97■■□□□ 1.11
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