RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.91□□□□□ -0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 P3H3Q8IVL6 736 aa14.89□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.87□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.86□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID3CA6NKF2 412 aa14.85□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 TONSLQ96HA7 1378 aa14.84□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.84□□□□□ -0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.83□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.82□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.81□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF21BO75037 1637 aa14.79□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR97A6NE52 1622 aa14.78□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 NBR1Q14596 966 aa14.76□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC1Q8TDI8 760 aa14.76□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 EEA1Q15075 1411 aa14.76□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.75□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 TOPBP1Q92547 1522 aa14.72□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.72□□□□□ -0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 ARXQ96QS3 562 aa14.7□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PRXQ9BXM0 1461 aa14.7□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 MRS2Q9HD23 443 aa14.68□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.67□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.67□□□□□ -0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.64□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.62□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.62□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.62□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.62□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.61□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA3Q08378 1498 aa14.61□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
EFTUD2-202ENST00000426333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 MIER1Q8N108 512 aa14.58□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.57□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP162Q5TB80 1403 aa14.57□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 IGF1RP08069 1367 aa14.57□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.56□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 CUX2O14529 1486 aa14.55□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR62O43379 1518 aa14.55□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.55□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF27Q86VH2 1401 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.086e-7■■■□□ 16
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 BECN1Q14457 450 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY4P0CV99 314 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY10P0CW01 314 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.49□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.48□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 PBRM1Q86U86 1689 aa14.47□□□□□ -0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.45□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL7Q14999 1698 aa14.45□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 ARAP1Q96P48 1450 aa14.44□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.43□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.42□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.39□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.38□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.37□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.36□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 CLIP1P30622 1438 aa14.36□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTS12P58397 1594 aa14.34□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.33□□□□□ -0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0G2JS52 829 aa14.33□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP53Q96M91 514 aa14.33□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 24.7
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.31□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.3□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT140Q96RY7 1462 aa14.3□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.3□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD9Q5K651 1589 aa14.29□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 RGL3Q3MIN7 710 aa14.29□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 CDCA8Q53HL2 280 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms