RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404284.6

TOM1-203, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,622 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-203ENST00000404284 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.98■■□□□ 1.27
TOM1-203ENST00000404284 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TOM1-203ENST00000404284 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.96■■□□□ 1.27
TOM1-203ENST00000404284 TOPBP1Q92547 1522 aa22.96■■□□□ 1.27
TOM1-203ENST00000404284 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
TOM1-203ENST00000404284 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.95■■□□□ 1.27
TOM1-203ENST00000404284 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.92■■□□□ 1.26
TOM1-203ENST00000404284 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.92■■□□□ 1.26
TOM1-203ENST00000404284 ITGAEP38570 1179 aa22.91■■□□□ 1.26
TOM1-203ENST00000404284 NESP48681 1621 aa22.9■■□□□ 1.26
TOM1-203ENST00000404284 MAPKBP1O60336 1514 aa22.89■■□□□ 1.26
TOM1-203ENST00000404284 CUL7Q14999 1698 aa22.89■■□□□ 1.25
TOM1-203ENST00000404284 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.87■■□□□ 1.25
TOM1-203ENST00000404284 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.85■■□□□ 1.25
TOM1-203ENST00000404284 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.85■■□□□ 1.25
TOM1-203ENST00000404284 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.84■■□□□ 1.25
TOM1-203ENST00000404284 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.83■■□□□ 1.25
TOM1-203ENST00000404284 WDR97A6NE52 1622 aa22.83■■□□□ 1.24
TOM1-203ENST00000404284 P3H3Q8IVL6 736 aa22.82■■□□□ 1.24
TOM1-203ENST00000404284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.243e-6■■■□□ 15.4
TOM1-203ENST00000404284 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.79■■□□□ 1.24
TOM1-203ENST00000404284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.78■■□□□ 1.24
TOM1-203ENST00000404284 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TOM1-203ENST00000404284 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TOM1-203ENST00000404284 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.73■■□□□ 1.23
TOM1-203ENST00000404284 BCL11AQ9H165 835 aa22.71■■□□□ 1.23
TOM1-203ENST00000404284 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.71■■□□□ 1.23
TOM1-203ENST00000404284 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TOM1-203ENST00000404284 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
TOM1-203ENST00000404284 FMN1Q68DA7 1419 aa22.69■■□□□ 1.22
TOM1-203ENST00000404284 SAMD9Q5K651 1589 aa22.67■■□□□ 1.22
TOM1-203ENST00000404284 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TOM1-203ENST00000404284 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.62■■□□□ 1.21
TOM1-203ENST00000404284 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.62■■□□□ 1.21
TOM1-203ENST00000404284 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.62■■□□□ 1.21
TOM1-203ENST00000404284 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.59■■□□□ 1.21
TOM1-203ENST00000404284 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 GRIN2BQ13224 1484 aa22.56■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.56■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.54■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.53■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TOM1-203ENST00000404284 PTPRKQ15262 1439 aa22.5■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 NCOA2Q15596 1464 aa22.5■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 HFM1A2PYH4 1435 aa22.49■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.48■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.48■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.47■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.47■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TOM1-203ENST00000404284 ARHGEF11O15085 1522 aa22.43■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 UACAQ9BZF9 1416 aa22.42■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 PBRM1Q86U86 1689 aa22.42■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.42■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.42■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 NAIPQ13075 1403 aa22.4■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 KCNH8Q96L42 1107 aa22.39■■□□□ 1.18
TOM1-203ENST00000404284 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.38■■□□□ 1.17
TOM1-203ENST00000404284 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TOM1-203ENST00000404284 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TOM1-203ENST00000404284 ADAMTS12P58397 1594 aa22.36■■□□□ 1.17
TOM1-203ENST00000404284 HECW1Q76N89 1606 aa22.35■■□□□ 1.17
TOM1-203ENST00000404284 IQGAP2Q13576 1575 aa22.35■■□□□ 1.17
TOM1-203ENST00000404284 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TOM1-203ENST00000404284 TONSLQ96HA7 1378 aa22.32■■□□□ 1.16
TOM1-203ENST00000404284 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.29■■□□□ 1.16
TOM1-203ENST00000404284 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TOM1-203ENST00000404284 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
TOM1-203ENST00000404284 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TOM1-203ENST00000404284 WDR62O43379 1518 aa22.26■■□□□ 1.15
TOM1-203ENST00000404284 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.26■■□□□ 1.15
TOM1-203ENST00000404284 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TOM1-203ENST00000404284 AKNAQ7Z591 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
TOM1-203ENST00000404284 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TOM1-203ENST00000404284 MIA2Q96PC5 1412 aa22.19■■□□□ 1.14
TOM1-203ENST00000404284 KDM6BO15054 1643 aa22.19■■□□□ 1.14
TOM1-203ENST00000404284 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.18■■□□□ 1.14
TOM1-203ENST00000404284 CCER2I3L3R5 266 aa22.17■■□□□ 1.14
TOM1-203ENST00000404284 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.15■■□□□ 1.14
TOM1-203ENST00000404284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TOM1-203ENST00000404284 IFT140Q96RY7 1462 aa22.13■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 ANP32CO43423 234 aa22.13■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 KIAA0556O60303 1618 aa22.12■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 DISP1Q96F81 1524 aa22.11■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.1■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.1■■□□□ 1.13
TOM1-203ENST00000404284 ARID3CA6NKF2 412 aa22.07■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 TRIM52Q96A61 297 aa22.05■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 DAPK1P53355 1430 aa22.04■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.04■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.03■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 GRIN2AQ12879 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 ROCK1Q13464 1354 aa22.02■■□□□ 1.12
TOM1-203ENST00000404284 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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