RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.32□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 MIER1Q8N108 512 aa9.32□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.31□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 CUL7Q14999 1698 aa9.31□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.3□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.3□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 MAPKBP1O60336 1514 aa9.3□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.29□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.28□□□□□ -0.92
SOS1-201ENST00000395038 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.28□□□□□ -0.92
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SOS1-201ENST00000395038 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.26□□□□□ -0.93
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SOS1-201ENST00000395038 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.26□□□□□ -0.93
SOS1-201ENST00000395038 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.26□□□□□ -0.93
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SOS1-201ENST00000395038 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.25□□□□□ -0.93
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SOS1-201ENST00000395038 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.23□□□□□ -0.93
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SOS1-201ENST00000395038 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.23□□□□□ -0.93
SOS1-201ENST00000395038 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.93
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SOS1-201ENST00000395038 P3H3Q8IVL6 736 aa9.19□□□□□ -0.94
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SOS1-201ENST00000395038 FMN1Q68DA7 1419 aa9.18□□□□□ -0.94
SOS1-201ENST00000395038 GRIN2BQ13224 1484 aa9.17□□□□□ -0.94
SOS1-201ENST00000395038 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.17□□□□□ -0.94
SOS1-201ENST00000395038 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
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SOS1-201ENST00000395038 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SOS1-201ENST00000395038 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.15□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 ARHGEF11O15085 1522 aa9.14□□□□□ -0.95
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SOS1-201ENST00000395038 PBRM1Q86U86 1689 aa9.14□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 PTPRKQ15262 1439 aa9.13□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.12□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.12□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.11□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 NCOA2Q15596 1464 aa9.11□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.11□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 HFM1A2PYH4 1435 aa9.11□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.11□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.1□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.1□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 ADAMTS12P58397 1594 aa9.1□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.09□□□□□ -0.95
SOS1-201ENST00000395038 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.08□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 NAIPQ13075 1403 aa9.08□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.08□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 UACAQ9BZF9 1416 aa9.07□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 IQGAP2Q13576 1575 aa9.07□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 HECW1Q76N89 1606 aa9.07□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.07□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 WDR62O43379 1518 aa9.05□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.04□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 KCNH8Q96L42 1107 aa9.04□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.04□□□□□ -0.96
SOS1-201ENST00000395038 KDM6BO15054 1643 aa9.02□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 AKNAQ7Z591 1439 aa9.02□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 MIA2Q96PC5 1412 aa9□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 KIAA0556O60303 1618 aa8.99□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 DISP1Q96F81 1524 aa8.99□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 IFT140Q96RY7 1462 aa8.99□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 TONSLQ96HA7 1378 aa8.98□□□□□ -0.97
SOS1-201ENST00000395038 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.97□□□□□ -0.97
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SOS1-201ENST00000395038 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOS1-201ENST00000395038 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOS1-201ENST00000395038 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.95□□□□□ -0.98
SOS1-201ENST00000395038 CCER2I3L3R5 266 aa8.95□□□□□ -0.98
SOS1-201ENST00000395038 GRIN2AQ12879 1464 aa8.94□□□□□ -0.98
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SOS1-201ENST00000395038 DAPK1P53355 1430 aa8.93□□□□□ -0.98
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SOS1-201ENST00000395038 CEP170Q5SW79 1584 aa8.92□□□□□ -0.98
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SOS1-201ENST00000395038 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.9□□□□□ -0.99
SOS1-201ENST00000395038 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.89□□□□□ -0.99
SOS1-201ENST00000395038 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SOS1-201ENST00000395038 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.89□□□□□ -0.99
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.89□□□□□ -0.99
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