RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394294.7

FBXL20-202, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXL20, Length 2,309 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL20-202ENST00000394294 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
FBXL20-202ENST00000394294 P3H3Q8IVL6 736 aa27.25■■□□□ 1.95
FBXL20-202ENST00000394294 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.25■■□□□ 1.95
FBXL20-202ENST00000394294 MYT1Q01538 1121 aa27.25■■□□□ 1.95
FBXL20-202ENST00000394294 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
FBXL20-202ENST00000394294 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
FBXL20-202ENST00000394294 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.18■■□□□ 1.94
FBXL20-202ENST00000394294 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
FBXL20-202ENST00000394294 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXL20-202ENST00000394294 KCNH8Q96L42 1107 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXL20-202ENST00000394294 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXL20-202ENST00000394294 WDR97A6NE52 1622 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXL20-202ENST00000394294 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.1■■□□□ 1.93
FBXL20-202ENST00000394294 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.08■■□□□ 1.93
FBXL20-202ENST00000394294 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FBXL20-202ENST00000394294 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.04■■□□□ 1.92
FBXL20-202ENST00000394294 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.03■■□□□ 1.92
FBXL20-202ENST00000394294 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.03■■□□□ 1.92
FBXL20-202ENST00000394294 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.02■■□□□ 1.92
FBXL20-202ENST00000394294 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.02■■□□□ 1.92
FBXL20-202ENST00000394294 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.01■■□□□ 1.91
FBXL20-202ENST00000394294 EFCAB5A4FU69 1503 aa27■■□□□ 1.91
FBXL20-202ENST00000394294 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FBXL20-202ENST00000394294 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
FBXL20-202ENST00000394294 TOPBP1Q92547 1522 aa26.97■■□□□ 1.91
FBXL20-202ENST00000394294 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.914e-6■□□□□ 10.8
FBXL20-202ENST00000394294 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FBXL20-202ENST00000394294 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FBXL20-202ENST00000394294 CUL7Q14999 1698 aa26.91■■□□□ 1.9
FBXL20-202ENST00000394294 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.89■■□□□ 1.9
FBXL20-202ENST00000394294 FMN1Q68DA7 1419 aa26.89■■□□□ 1.9
FBXL20-202ENST00000394294 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.89■■□□□ 1.89
FBXL20-202ENST00000394294 NESP48681 1621 aa26.87■■□□□ 1.89
FBXL20-202ENST00000394294 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.84■■□□□ 1.89
FBXL20-202ENST00000394294 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.83■■□□□ 1.89
FBXL20-202ENST00000394294 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.83■■□□□ 1.88
FBXL20-202ENST00000394294 TONSLQ96HA7 1378 aa26.8■■□□□ 1.88
FBXL20-202ENST00000394294 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.8■■□□□ 1.88
FBXL20-202ENST00000394294 PTPRKQ15262 1439 aa26.79■■□□□ 1.88
FBXL20-202ENST00000394294 ANP32CO43423 234 aa26.78■■□□□ 1.88
FBXL20-202ENST00000394294 CCER2I3L3R5 266 aa26.77■■□□□ 1.88
FBXL20-202ENST00000394294 HFM1A2PYH4 1435 aa26.76■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 BCANQ96GW7 911 aa26.76■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 FKBP8Q14318 412 aa26.75■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 UACAQ9BZF9 1416 aa26.75■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.71■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 NCOA2Q15596 1464 aa26.7■■□□□ 1.87
FBXL20-202ENST00000394294 SAMD9Q5K651 1589 aa26.7■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.69■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 TRIM52Q96A61 297 aa26.69■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.69■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 NAIPQ13075 1403 aa26.68■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 GRIN2BQ13224 1484 aa26.66■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.65■■□□□ 1.86
FBXL20-202ENST00000394294 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.64■■□□□ 1.85
FBXL20-202ENST00000394294 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
FBXL20-202ENST00000394294 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.6■■□□□ 1.85
FBXL20-202ENST00000394294 NEFLP07196 543 aa26.6■■□□□ 1.85
FBXL20-202ENST00000394294 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FBXL20-202ENST00000394294 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.58■■□□□ 1.85
FBXL20-202ENST00000394294 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.55■■□□□ 1.84
FBXL20-202ENST00000394294 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.54■■□□□ 1.84
FBXL20-202ENST00000394294 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.53■■□□□ 1.84
FBXL20-202ENST00000394294 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.52■■□□□ 1.84
FBXL20-202ENST00000394294 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.51■■□□□ 1.83
FBXL20-202ENST00000394294 ARHGEF11O15085 1522 aa26.5■■□□□ 1.83
FBXL20-202ENST00000394294 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.48■■□□□ 1.83
FBXL20-202ENST00000394294 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
FBXL20-202ENST00000394294 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.43■■□□□ 1.82
FBXL20-202ENST00000394294 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FBXL20-202ENST00000394294 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
FBXL20-202ENST00000394294 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.4■■□□□ 1.82
FBXL20-202ENST00000394294 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.4■■□□□ 1.82
FBXL20-202ENST00000394294 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.39■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 HECW1Q76N89 1606 aa26.38■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.36■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.36■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 KDM6BO15054 1643 aa26.35■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 AKNAQ7Z591 1439 aa26.34■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 ARID3CA6NKF2 412 aa26.33■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
FBXL20-202ENST00000394294 MIA2Q96PC5 1412 aa26.32■■□□□ 1.8
FBXL20-202ENST00000394294 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FBXL20-202ENST00000394294 IQGAP2Q13576 1575 aa26.31■■□□□ 1.8
FBXL20-202ENST00000394294 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.3■■□□□ 1.8
FBXL20-202ENST00000394294 FOXD1Q16676 465 aa26.3■■□□□ 1.8
FBXL20-202ENST00000394294 PBRM1Q86U86 1689 aa26.27■■□□□ 1.8
FBXL20-202ENST00000394294 WDR62O43379 1518 aa26.23■■□□□ 1.79
FBXL20-202ENST00000394294 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.22■■□□□ 1.79
FBXL20-202ENST00000394294 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
FBXL20-202ENST00000394294 ADAMTS12P58397 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
FBXL20-202ENST00000394294 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
FBXL20-202ENST00000394294 CCDC184Q52MB2 194 aa26.2■■□□□ 1.78
FBXL20-202ENST00000394294 CCDC7Q96M83 1385 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms