RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389176.3

CCDC154-201, Transcript of coiled-coil domain containing 154, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene CCDC154, Length 2,212 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154-201ENST00000389176 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
CCDC154-201ENST00000389176 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.83■■■□□ 2.85
CCDC154-201ENST00000389176 MAP3K1Q13233 1512 aa32.8■■■□□ 2.84
CCDC154-201ENST00000389176 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.75■■■□□ 2.83
CCDC154-201ENST00000389176 CUL7Q14999 1698 aa32.74■■■□□ 2.83
CCDC154-201ENST00000389176 TIAM1Q13009 1591 aa32.7■■■□□ 2.83
CCDC154-201ENST00000389176 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
CCDC154-201ENST00000389176 WDR97A6NE52 1622 aa32.68■■■□□ 2.82
CCDC154-201ENST00000389176 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.67■■■□□ 2.82
CCDC154-201ENST00000389176 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.64■■■□□ 2.82
CCDC154-201ENST00000389176 MAPKBP1O60336 1514 aa32.59■■■□□ 2.81
CCDC154-201ENST00000389176 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.59■■■□□ 2.81
CCDC154-201ENST00000389176 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.57■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.56■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.55■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.53■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.53■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 ITGAEP38570 1179 aa32.52■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa32.51■■■□□ 2.8
CCDC154-201ENST00000389176 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
CCDC154-201ENST00000389176 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.47■■■□□ 2.79
CCDC154-201ENST00000389176 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.46■■■□□ 2.79
CCDC154-201ENST00000389176 KCNH8Q96L42 1107 aa32.46■■■□□ 2.79
CCDC154-201ENST00000389176 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.45■■■□□ 2.79
CCDC154-201ENST00000389176 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.44■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.44■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.43■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 P3H3Q8IVL6 736 aa32.42■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.41■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.39■■■□□ 2.78
CCDC154-201ENST00000389176 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.35■■■□□ 2.77
CCDC154-201ENST00000389176 FMN1Q68DA7 1419 aa32.34■■■□□ 2.77
CCDC154-201ENST00000389176 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CCDC154-201ENST00000389176 SAMD9Q5K651 1589 aa32.3■■■□□ 2.76
CCDC154-201ENST00000389176 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CCDC154-201ENST00000389176 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.24■■■□□ 2.75
CCDC154-201ENST00000389176 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CCDC154-201ENST00000389176 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.21■■■□□ 2.75
CCDC154-201ENST00000389176 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.75
CCDC154-201ENST00000389176 ANP32EQ9BTT0 268 aa32.19■■■□□ 2.74
CCDC154-201ENST00000389176 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CCDC154-201ENST00000389176 PBRM1Q86U86 1689 aa32.15■■■□□ 2.74
CCDC154-201ENST00000389176 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.14■■■□□ 2.74
CCDC154-201ENST00000389176 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.14■■■□□ 2.74
CCDC154-201ENST00000389176 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.73
CCDC154-201ENST00000389176 BCANQ96GW7 911 aa32.14■■■□□ 2.73
CCDC154-201ENST00000389176 FKBP8Q14318 412 aa32.13■■■□□ 2.73
CCDC154-201ENST00000389176 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CCDC154-201ENST00000389176 GRIN2BQ13224 1484 aa32.09■■■□□ 2.73
CCDC154-201ENST00000389176 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.06■■■□□ 2.72
CCDC154-201ENST00000389176 CCER2I3L3R5 266 aa32.03■■■□□ 2.72
CCDC154-201ENST00000389176 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.03■■■□□ 2.72
CCDC154-201ENST00000389176 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.02■■■□□ 2.72
CCDC154-201ENST00000389176 ADAMTS12P58397 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
CCDC154-201ENST00000389176 IQGAP2Q13576 1575 aa31.96■■■□□ 2.71
CCDC154-201ENST00000389176 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 IFT140Q96RY7 1462 aa31.93■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 NEFLP07196 543 aa31.93■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.93■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 ANP32CO43423 234 aa31.92■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 WDR62O43379 1518 aa31.92■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.91■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 NCOA2Q15596 1464 aa31.9■■■□□ 2.7
CCDC154-201ENST00000389176 TRIM52Q96A61 297 aa31.88■■■□□ 2.69
CCDC154-201ENST00000389176 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.88■■■□□ 2.69
CCDC154-201ENST00000389176 HECW1Q76N89 1606 aa31.85■■■□□ 2.69
CCDC154-201ENST00000389176 ARHGEF11O15085 1522 aa31.83■■■□□ 2.69
CCDC154-201ENST00000389176 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.81■■■□□ 2.68
CCDC154-201ENST00000389176 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CCDC154-201ENST00000389176 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
CCDC154-201ENST00000389176 TONSLQ96HA7 1378 aa31.79■■■□□ 2.68
CCDC154-201ENST00000389176 HFM1A2PYH4 1435 aa31.78■■■□□ 2.68
CCDC154-201ENST00000389176 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.77■■■□□ 2.68
CCDC154-201ENST00000389176 PTPRKQ15262 1439 aa31.75■■■□□ 2.67
CCDC154-201ENST00000389176 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CCDC154-201ENST00000389176 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.73■■■□□ 2.67
CCDC154-201ENST00000389176 UACAQ9BZF9 1416 aa31.73■■■□□ 2.67
CCDC154-201ENST00000389176 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.71■■■□□ 2.67
CCDC154-201ENST00000389176 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CCDC154-201ENST00000389176 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CCDC154-201ENST00000389176 NAIPQ13075 1403 aa31.66■■■□□ 2.66
CCDC154-201ENST00000389176 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.64■■■□□ 2.66
CCDC154-201ENST00000389176 GRIN2AQ12879 1464 aa31.62■■■□□ 2.65
CCDC154-201ENST00000389176 KIAA0556O60303 1618 aa31.61■■■□□ 2.65
CCDC154-201ENST00000389176 DISP1Q96F81 1524 aa31.6■■■□□ 2.65
CCDC154-201ENST00000389176 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CCDC154-201ENST00000389176 ERCC6Q03468 1493 aa31.59■■■□□ 2.65
CCDC154-201ENST00000389176 MIA2Q96PC5 1412 aa31.58■■■□□ 2.65
CCDC154-201ENST00000389176 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CCDC154-201ENST00000389176 AKNAQ7Z591 1439 aa31.52■■■□□ 2.64
CCDC154-201ENST00000389176 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.51■■■□□ 2.63
CCDC154-201ENST00000389176 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
CCDC154-201ENST00000389176 BCL11AQ9H165 835 aa31.48■■■□□ 2.63
CCDC154-201ENST00000389176 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.46■■■□□ 2.63
CCDC154-201ENST00000389176 SYNJ2O15056 1496 aa31.45■■■□□ 2.62
CCDC154-201ENST00000389176 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
CCDC154-201ENST00000389176 MSH5O43196 834 aa31.44■■■□□ 2.62
CCDC154-201ENST00000389176 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms