RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.25■■■□□ 2.27
PAN3-201ENST00000380958 CUL7Q14999 1698 aa29.25■■■□□ 2.27
PAN3-201ENST00000380958 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.25■■■□□ 2.27
PAN3-201ENST00000380958 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PAN3-201ENST00000380958 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PAN3-201ENST00000380958 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.18■■■□□ 2.26
PAN3-201ENST00000380958 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.16■■■□□ 2.26
PAN3-201ENST00000380958 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.13■■■□□ 2.25
PAN3-201ENST00000380958 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.13■■■□□ 2.25
PAN3-201ENST00000380958 WDR97A6NE52 1622 aa29.12■■■□□ 2.25
PAN3-201ENST00000380958 NESP48681 1621 aa29.11■■■□□ 2.25
PAN3-201ENST00000380958 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.1■■■□□ 2.25
PAN3-201ENST00000380958 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
PAN3-201ENST00000380958 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PAN3-201ENST00000380958 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.05■■■□□ 2.24
PAN3-201ENST00000380958 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PAN3-201ENST00000380958 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PAN3-201ENST00000380958 ITGAEP38570 1179 aa29.01■■■□□ 2.23
PAN3-201ENST00000380958 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29■■■□□ 2.23
PAN3-201ENST00000380958 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.99■■■□□ 2.23
PAN3-201ENST00000380958 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.98■■■□□ 2.23
PAN3-201ENST00000380958 FMN1Q68DA7 1419 aa28.92■■■□□ 2.22
PAN3-201ENST00000380958 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.91■■■□□ 2.22
PAN3-201ENST00000380958 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.91■■■□□ 2.22
PAN3-201ENST00000380958 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.228e-6■■□□□ 11.9
PAN3-201ENST00000380958 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.88■■■□□ 2.21
PAN3-201ENST00000380958 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.87■■■□□ 2.21
PAN3-201ENST00000380958 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.86■■■□□ 2.21
PAN3-201ENST00000380958 SAMD9Q5K651 1589 aa28.86■■■□□ 2.21
PAN3-201ENST00000380958 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.8■■■□□ 2.2
PAN3-201ENST00000380958 MAPKBP1O60336 1514 aa28.79■■■□□ 2.2
PAN3-201ENST00000380958 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PAN3-201ENST00000380958 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.79■■■□□ 2.2
PAN3-201ENST00000380958 P3H3Q8IVL6 736 aa28.79■■■□□ 2.2
PAN3-201ENST00000380958 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PAN3-201ENST00000380958 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PAN3-201ENST00000380958 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PAN3-201ENST00000380958 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PAN3-201ENST00000380958 GRIN2BQ13224 1484 aa28.66■■■□□ 2.18
PAN3-201ENST00000380958 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.65■■■□□ 2.18
PAN3-201ENST00000380958 PBRM1Q86U86 1689 aa28.62■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.62■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 KCNH8Q96L42 1107 aa28.61■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.61■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.59■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.59■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.58■■■□□ 2.17
PAN3-201ENST00000380958 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PAN3-201ENST00000380958 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.56■■■□□ 2.16
PAN3-201ENST00000380958 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.54■■■□□ 2.16
PAN3-201ENST00000380958 ADAMTS12P58397 1594 aa28.53■■■□□ 2.16
PAN3-201ENST00000380958 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.51■■■□□ 2.16
PAN3-201ENST00000380958 NCOA2Q15596 1464 aa28.51■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 IQGAP2Q13576 1575 aa28.5■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 HFM1A2PYH4 1435 aa28.49■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.49■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 HECW1Q76N89 1606 aa28.49■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 ARHGEF11O15085 1522 aa28.48■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.46■■■□□ 2.15
PAN3-201ENST00000380958 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.43■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.42■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 BCANQ96GW7 911 aa28.41■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 UACAQ9BZF9 1416 aa28.4■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 IFT140Q96RY7 1462 aa28.39■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PAN3-201ENST00000380958 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PAN3-201ENST00000380958 WDR62O43379 1518 aa28.35■■■□□ 2.13
PAN3-201ENST00000380958 PTPRKQ15262 1439 aa28.34■■■□□ 2.13
PAN3-201ENST00000380958 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.33■■■□□ 2.13
PAN3-201ENST00000380958 NAIPQ13075 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
PAN3-201ENST00000380958 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PAN3-201ENST00000380958 AKNAQ7Z591 1439 aa28.3■■■□□ 2.12
PAN3-201ENST00000380958 MIA2Q96PC5 1412 aa28.28■■■□□ 2.12
PAN3-201ENST00000380958 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.27■■■□□ 2.12
PAN3-201ENST00000380958 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PAN3-201ENST00000380958 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.24■■■□□ 2.11
PAN3-201ENST00000380958 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.23■■■□□ 2.11
PAN3-201ENST00000380958 TONSLQ96HA7 1378 aa28.2■■■□□ 2.11
PAN3-201ENST00000380958 KIAA0556O60303 1618 aa28.19■■■□□ 2.1
PAN3-201ENST00000380958 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PAN3-201ENST00000380958 FKBP8Q14318 412 aa28.17■■■□□ 2.1
PAN3-201ENST00000380958 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PAN3-201ENST00000380958 TRIM52Q96A61 297 aa28.13■■■□□ 2.09
PAN3-201ENST00000380958 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PAN3-201ENST00000380958 GRIN2AQ12879 1464 aa28.12■■■□□ 2.09
PAN3-201ENST00000380958 DISP1Q96F81 1524 aa28.12■■■□□ 2.09
PAN3-201ENST00000380958 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PAN3-201ENST00000380958 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.07■■■□□ 2.08
PAN3-201ENST00000380958 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.03■■■□□ 2.08
PAN3-201ENST00000380958 ROCK1Q13464 1354 aa28.03■■■□□ 2.08
PAN3-201ENST00000380958 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PAN3-201ENST00000380958 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.01■■■□□ 2.07
PAN3-201ENST00000380958 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PAN3-201ENST00000380958 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PAN3-201ENST00000380958 SYNJ2O15056 1496 aa27.96■■■□□ 2.07
PAN3-201ENST00000380958 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.96■■■□□ 2.07
PAN3-201ENST00000380958 ERCC6Q03468 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
PAN3-201ENST00000380958 DAPK1P53355 1430 aa27.95■■■□□ 2.07
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