RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.19■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 SMARCA4P51532 1647 aa21.18■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.17■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.16■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.15■□□□□ 0.98
FGD1-201ENST00000375135 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.14■□□□□ 0.97
FGD1-201ENST00000375135 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
FGD1-201ENST00000375135 SMARCA2P51531 1590 aa21.09■□□□□ 0.97
FGD1-201ENST00000375135 KCNH8Q96L42 1107 aa21.08■□□□□ 0.97
FGD1-201ENST00000375135 TSPY4P0CV99 314 aa21.07■□□□□ 0.96
FGD1-201ENST00000375135 TSPY10P0CW01 314 aa21.07■□□□□ 0.96
FGD1-201ENST00000375135 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
FGD1-201ENST00000375135 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.01■□□□□ 0.95
FGD1-201ENST00000375135 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
FGD1-201ENST00000375135 MRS2Q9HD23 443 aa21■□□□□ 0.95
FGD1-201ENST00000375135 RGL3Q3MIN7 710 aa20.99■□□□□ 0.95
FGD1-201ENST00000375135 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
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FGD1-201ENST00000375135 NBR1Q14596 966 aa20.98■□□□□ 0.95
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FGD1-201ENST00000375135 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.97■□□□□ 0.95
FGD1-201ENST00000375135 FOXD1Q16676 465 aa20.96■□□□□ 0.95
FGD1-201ENST00000375135 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.94■□□□□ 0.94
FGD1-201ENST00000375135 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
FGD1-201ENST00000375135 TMC1Q8TDI8 760 aa20.9■□□□□ 0.94
FGD1-201ENST00000375135 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.9■□□□□ 0.94
FGD1-201ENST00000375135 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.9■□□□□ 0.94
FGD1-201ENST00000375135 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.88■□□□□ 0.93
FGD1-201ENST00000375135 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
FGD1-201ENST00000375135 BCL11AQ9H165 835 aa20.87■□□□□ 0.93
FGD1-201ENST00000375135 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
FGD1-201ENST00000375135 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.83■□□□□ 0.93
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FGD1-201ENST00000375135 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.79■□□□□ 0.92
FGD1-201ENST00000375135 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.78■□□□□ 0.92
FGD1-201ENST00000375135 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
FGD1-201ENST00000375135 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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FGD1-201ENST00000375135 IGF1RP08069 1367 aa20.73■□□□□ 0.91
FGD1-201ENST00000375135 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.73■□□□□ 0.91
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FGD1-201ENST00000375135 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.68■□□□□ 0.9
FGD1-201ENST00000375135 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.67■□□□□ 0.9
FGD1-201ENST00000375135 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.67■□□□□ 0.9
FGD1-201ENST00000375135 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
FGD1-201ENST00000375135 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
FGD1-201ENST00000375135 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
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FGD1-201ENST00000375135 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.63■□□□□ 0.89
FGD1-201ENST00000375135 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.63■□□□□ 0.89
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FGD1-201ENST00000375135 FMN1Q68DA7 1419 aa20.61■□□□□ 0.89
FGD1-201ENST00000375135 PKD2Q13563 968 aa20.61■□□□□ 0.89
FGD1-201ENST00000375135 SLC24A1O60721 1099 aa20.58■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 KIF21BO75037 1637 aa20.58■□□□□ 0.88
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FGD1-201ENST00000375135 NCAPD3P42695 1498 aa20.57■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.57■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 CCER2I3L3R5 266 aa20.56■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.55■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 ARAP1Q96P48 1450 aa20.53■□□□□ 0.88
FGD1-201ENST00000375135 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.51■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.5■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
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FGD1-201ENST00000375135 NESP48681 1621 aa20.47■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FGD1-201ENST00000375135 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FGD1-201ENST00000375135 NEFMP07197 916 aa20.45■□□□□ 0.86
FGD1-201ENST00000375135 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FGD1-201ENST00000375135 NUP155O75694 1391 aa20.43■□□□□ 0.86
FGD1-201ENST00000375135 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
FGD1-201ENST00000375135 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FGD1-201ENST00000375135 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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FGD1-201ENST00000375135 NEUROD2Q15784 382 aa20.41■□□□□ 0.86
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FGD1-201ENST00000375135 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.37■□□□□ 0.85
FGD1-201ENST00000375135 PRXQ9BXM0 1461 aa20.36■□□□□ 0.85
FGD1-201ENST00000375135 ARXQ96QS3 562 aa20.35■□□□□ 0.85
FGD1-201ENST00000375135 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.35■□□□□ 0.85
FGD1-201ENST00000375135 PLEKHG5O94827 1062 aa20.33■□□□□ 0.85
FGD1-201ENST00000375135 GGT6Q6P531 493 aa20.31■□□□□ 0.84
FGD1-201ENST00000375135 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.3■□□□□ 0.84
FGD1-201ENST00000375135 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
FGD1-201ENST00000375135 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FGD1-201ENST00000375135 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.28■□□□□ 0.84
FGD1-201ENST00000375135 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.27■□□□□ 0.83
FGD1-201ENST00000375135 TOP2BQ02880 1626 aa20.26■□□□□ 0.83
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