RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TTC13-202ENST00000366662 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC13-202ENST00000366662 NEUROD1Q13562 356 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC13-202ENST00000366662 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTC13-202ENST00000366662 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.18■■□□□ 1.62
TTC13-202ENST00000366662 MIER1Q8N108 512 aa25.16■■□□□ 1.62
TTC13-202ENST00000366662 ARID3CA6NKF2 412 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC13-202ENST00000366662 TIAM1Q13009 1591 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC13-202ENST00000366662 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC13-202ENST00000366662 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC13-202ENST00000366662 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC13-202ENST00000366662 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TTC13-202ENST00000366662 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.08■■□□□ 1.6
TTC13-202ENST00000366662 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC13-202ENST00000366662 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.06■■□□□ 1.6
TTC13-202ENST00000366662 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TTC13-202ENST00000366662 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.05■■□□□ 1.6
TTC13-202ENST00000366662 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.65e-11■■■■■ 39.3
TTC13-202ENST00000366662 SIN3AQ96ST3 1273 aa25■■□□□ 1.59
TTC13-202ENST00000366662 CUL7Q14999 1698 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 WDR97A6NE52 1622 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC13-202ENST00000366662 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.89■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.89■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 MAP3K1Q13233 1512 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 FMN1Q68DA7 1419 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TTC13-202ENST00000366662 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 MAPKBP1O60336 1514 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 FBLN2P98095 1184 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC13-202ENST00000366662 PTPRKQ15262 1439 aa24.73■■□□□ 1.55
TTC13-202ENST00000366662 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.73■■□□□ 1.55
TTC13-202ENST00000366662 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC13-202ENST00000366662 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC13-202ENST00000366662 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC13-202ENST00000366662 SAMD9Q5K651 1589 aa24.68■■□□□ 1.54
TTC13-202ENST00000366662 NCOA2Q15596 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
TTC13-202ENST00000366662 GRIN2BQ13224 1484 aa24.66■■□□□ 1.54
TTC13-202ENST00000366662 PBRM1Q86U86 1689 aa24.64■■□□□ 1.54
TTC13-202ENST00000366662 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.64■■□□□ 1.53
TTC13-202ENST00000366662 ERCC6Q03468 1493 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC13-202ENST00000366662 KCNH8Q96L42 1107 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC13-202ENST00000366662 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TTC13-202ENST00000366662 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TTC13-202ENST00000366662 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 IQGAP2Q13576 1575 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 ADAMTS12P58397 1594 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 TRIM52Q96A61 297 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 FOXD1Q16676 465 aa24.52■■□□□ 1.52
TTC13-202ENST00000366662 IFT140Q96RY7 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
TTC13-202ENST00000366662 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TTC13-202ENST00000366662 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TTC13-202ENST00000366662 NAIPQ13075 1403 aa24.47■■□□□ 1.51
TTC13-202ENST00000366662 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TTC13-202ENST00000366662 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
TTC13-202ENST00000366662 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.44■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 HFM1A2PYH4 1435 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 TONSLQ96HA7 1378 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 WDR62O43379 1518 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TTC13-202ENST00000366662 DISP1Q96F81 1524 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 GRIN2AQ12879 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 HECW1Q76N89 1606 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 UACAQ9BZF9 1416 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 JPH4Q96JJ6 628 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 KDM6BO15054 1643 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC13-202ENST00000366662 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC13-202ENST00000366662 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TTC13-202ENST00000366662 ARHGEF11O15085 1522 aa24.31■■□□□ 1.48
TTC13-202ENST00000366662 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TTC13-202ENST00000366662 KIAA0556O60303 1618 aa24.29■■□□□ 1.48
TTC13-202ENST00000366662 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.28■■□□□ 1.48
TTC13-202ENST00000366662 CEP170Q5SW79 1584 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC13-202ENST00000366662 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TTC13-202ENST00000366662 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC13-202ENST00000366662 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TTC13-202ENST00000366662 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TTC13-202ENST00000366662 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 SYNJ2O15056 1496 aa24.19■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.17■■□□□ 1.46
TTC13-202ENST00000366662 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.17■■□□□ 1.46
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