RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361530.10

CNKSR1-201, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR1, Length 2,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-201ENST00000361530 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.67■■□□□ 1.22
CNKSR1-201ENST00000361530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.65■■□□□ 1.22
CNKSR1-201ENST00000361530 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.65■■□□□ 1.22
CNKSR1-201ENST00000361530 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.59■■□□□ 1.21
CNKSR1-201ENST00000361530 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CNKSR1-201ENST00000361530 MAPKBP1O60336 1514 aa22.58■■□□□ 1.21
CNKSR1-201ENST00000361530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.57■■□□□ 1.2
CNKSR1-201ENST00000361530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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CNKSR1-201ENST00000361530 NESP48681 1621 aa22.57■■□□□ 1.2
CNKSR1-201ENST00000361530 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.56■■□□□ 1.2
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CNKSR1-201ENST00000361530 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.56■■□□□ 1.2
CNKSR1-201ENST00000361530 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.56■■□□□ 1.2
CNKSR1-201ENST00000361530 TOPBP1Q92547 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
CNKSR1-201ENST00000361530 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.52■■□□□ 1.2
CNKSR1-201ENST00000361530 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.46■■□□□ 1.19
CNKSR1-201ENST00000361530 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.44■■□□□ 1.18
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CNKSR1-201ENST00000361530 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
CNKSR1-201ENST00000361530 CUL7Q14999 1698 aa22.41■■□□□ 1.18
CNKSR1-201ENST00000361530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
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CNKSR1-201ENST00000361530 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.38■■□□□ 1.17
CNKSR1-201ENST00000361530 WDR97A6NE52 1622 aa22.37■■□□□ 1.17
CNKSR1-201ENST00000361530 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CNKSR1-201ENST00000361530 KCNH8Q96L42 1107 aa22.33■■□□□ 1.17
CNKSR1-201ENST00000361530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
CNKSR1-201ENST00000361530 FMN1Q68DA7 1419 aa22.33■■□□□ 1.17
CNKSR1-201ENST00000361530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.32■■□□□ 1.16
CNKSR1-201ENST00000361530 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.3■■□□□ 1.16
CNKSR1-201ENST00000361530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.3■■□□□ 1.16
CNKSR1-201ENST00000361530 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.28■■□□□ 1.16
CNKSR1-201ENST00000361530 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.27■■□□□ 1.16
CNKSR1-201ENST00000361530 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.26■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.26■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.26■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 PTPRKQ15262 1439 aa22.25■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 SAMD9Q5K651 1589 aa22.24■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.22■■□□□ 1.15
CNKSR1-201ENST00000361530 GRIN2BQ13224 1484 aa22.19■■□□□ 1.14
CNKSR1-201ENST00000361530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.18■■□□□ 1.14
CNKSR1-201ENST00000361530 NCOA2Q15596 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
CNKSR1-201ENST00000361530 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
CNKSR1-201ENST00000361530 HFM1A2PYH4 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
CNKSR1-201ENST00000361530 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
CNKSR1-201ENST00000361530 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNKSR1-201ENST00000361530 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-201ENST00000361530 NAIPQ13075 1403 aa22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-201ENST00000361530 UACAQ9BZF9 1416 aa22.12■■□□□ 1.13
CNKSR1-201ENST00000361530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.11■■□□□ 1.13
CNKSR1-201ENST00000361530 TONSLQ96HA7 1378 aa22.09■■□□□ 1.13
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CNKSR1-201ENST00000361530 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.08■■□□□ 1.13
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CNKSR1-201ENST00000361530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNKSR1-201ENST00000361530 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.06■■□□□ 1.12
CNKSR1-201ENST00000361530 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.04■■□□□ 1.12
CNKSR1-201ENST00000361530 ARHGEF11O15085 1522 aa22.03■■□□□ 1.12
CNKSR1-201ENST00000361530 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.02■■□□□ 1.12
CNKSR1-201ENST00000361530 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.01■■□□□ 1.11
CNKSR1-201ENST00000361530 BCL11AQ9H165 835 aa21.99■■□□□ 1.11
CNKSR1-201ENST00000361530 ANP32CO43423 234 aa21.97■■□□□ 1.11
CNKSR1-201ENST00000361530 CCER2I3L3R5 266 aa21.96■■□□□ 1.11
CNKSR1-201ENST00000361530 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.96■■□□□ 1.11
CNKSR1-201ENST00000361530 ARID3CA6NKF2 412 aa21.95■■□□□ 1.11
CNKSR1-201ENST00000361530 PBRM1Q86U86 1689 aa21.95■■□□□ 1.1
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CNKSR1-201ENST00000361530 IQGAP2Q13576 1575 aa21.94■■□□□ 1.1
CNKSR1-201ENST00000361530 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CNKSR1-201ENST00000361530 HECW1Q76N89 1606 aa21.92■■□□□ 1.1
CNKSR1-201ENST00000361530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CNKSR1-201ENST00000361530 TRIM52Q96A61 297 aa21.91■■□□□ 1.1
CNKSR1-201ENST00000361530 ADAMTS12P58397 1594 aa21.9■■□□□ 1.1
CNKSR1-201ENST00000361530 KDM6BO15054 1643 aa21.89■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 BCANQ96GW7 911 aa21.87■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 FKBP8Q14318 412 aa21.87■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.86■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 WDR62O43379 1518 aa21.86■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.85■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MIA2Q96PC5 1412 aa21.84■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.83■■□□□ 1.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.83■■□□□ 1.08
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CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CNKSR1-201ENST00000361530 FOXD1Q16676 465 aa21.81■■□□□ 1.08
CNKSR1-201ENST00000361530 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CNKSR1-201ENST00000361530 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.78■■□□□ 1.08
CNKSR1-201ENST00000361530 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.76■■□□□ 1.07
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DISP1Q96F81 1524 aa21.75■■□□□ 1.07
CNKSR1-201ENST00000361530 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.72■■□□□ 1.07
CNKSR1-201ENST00000361530 DAPK1P53355 1430 aa21.72■■□□□ 1.07
CNKSR1-201ENST00000361530 IFT140Q96RY7 1462 aa21.72■■□□□ 1.07
CNKSR1-201ENST00000361530 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
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