RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 NEUROD1Q13562 356 aa28.64■■■□□ 2.18
TM7SF3-201ENST00000343028 TIAM1Q13009 1591 aa28.62■■■□□ 2.17
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TM7SF3-201ENST00000343028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 MIER1Q8N108 512 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.45■■■□□ 2.15
TM7SF3-201ENST00000343028 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.44■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CUL7Q14999 1698 aa28.44■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.43■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 MAP3K1Q13233 1512 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR97A6NE52 1622 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-201ENST00000343028 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 FMN1Q68DA7 1419 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 ARID3CA6NKF2 412 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 MAPKBP1O60336 1514 aa28.2■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-201ENST00000343028 SAMD9Q5K651 1589 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.12■■■□□ 2.09
TM7SF3-201ENST00000343028 MYT1Q01538 1121 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-201ENST00000343028 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-201ENST00000343028 PBRM1Q86U86 1689 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 GRIN2BQ13224 1484 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 NCOA2Q15596 1464 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPRKQ15262 1439 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
TM7SF3-201ENST00000343028 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.98■■■□□ 2.07
TM7SF3-201ENST00000343028 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.95■■■□□ 2.07
TM7SF3-201ENST00000343028 ADAMTS12P58397 1594 aa27.93■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 IQGAP2Q13576 1575 aa27.93■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.93■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.91■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.89■■■□□ 2.06
TM7SF3-201ENST00000343028 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3-201ENST00000343028 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FBLN2P98095 1184 aa27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 ERCC6Q03468 1493 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 IFT140Q96RY7 1462 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNH8Q96L42 1107 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 HFM1A2PYH4 1435 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 NAIPQ13075 1403 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 HECW1Q76N89 1606 aa27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR62O43379 1518 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM52Q96A61 297 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 TONSLQ96HA7 1378 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 UACAQ9BZF9 1416 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF11O15085 1522 aa27.7■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 DISP1Q96F81 1524 aa27.67■■■□□ 2.02
TM7SF3-201ENST00000343028 GRIN2AQ12879 1464 aa27.67■■■□□ 2.02
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
TM7SF3-201ENST00000343028 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.66■■■□□ 2.02
TM7SF3-201ENST00000343028 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.65■■■□□ 2.02
TM7SF3-201ENST00000343028 FOXD1Q16676 465 aa27.64■■■□□ 2.02
TM7SF3-201ENST00000343028 KIAA0556O60303 1618 aa27.63■■■□□ 2.01
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM6BO15054 1643 aa27.61■■■□□ 2.01
TM7SF3-201ENST00000343028 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-201ENST00000343028 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2
TM7SF3-201ENST00000343028 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TM7SF3-201ENST00000343028 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 MIA2Q96PC5 1412 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP170Q5SW79 1584 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 JPH4Q96JJ6 628 aa27.48■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 SYNJ2O15056 1496 aa27.46■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms