RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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SHQ1-201ENST00000325599 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.05■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 MAP3K1Q13233 1512 aa24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.02■■□□□ 1.44
SHQ1-201ENST00000325599 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-201ENST00000325599 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.01■■□□□ 1.43
SHQ1-201ENST00000325599 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SHQ1-201ENST00000325599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24■■□□□ 1.43
SHQ1-201ENST00000325599 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.96■■□□□ 1.43
SHQ1-201ENST00000325599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.96■■□□□ 1.43
SHQ1-201ENST00000325599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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SHQ1-201ENST00000325599 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SHQ1-201ENST00000325599 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.93■■□□□ 1.42
SHQ1-201ENST00000325599 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.91■■□□□ 1.42
SHQ1-201ENST00000325599 WDR97A6NE52 1622 aa23.9■■□□□ 1.42
SHQ1-201ENST00000325599 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.87■■□□□ 1.41
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SHQ1-201ENST00000325599 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.85■■□□□ 1.41
SHQ1-201ENST00000325599 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.85■■□□□ 1.41
SHQ1-201ENST00000325599 MAPKBP1O60336 1514 aa23.83■■□□□ 1.41
SHQ1-201ENST00000325599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.82■■□□□ 1.4
SHQ1-201ENST00000325599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.82■■□□□ 1.4
SHQ1-201ENST00000325599 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.82■■□□□ 1.4
SHQ1-201ENST00000325599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.81■■□□□ 1.4
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SHQ1-201ENST00000325599 SAMD9Q5K651 1589 aa23.7■■□□□ 1.38
SHQ1-201ENST00000325599 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.7■■□□□ 1.38
SHQ1-201ENST00000325599 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SHQ1-201ENST00000325599 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.67■■□□□ 1.38
SHQ1-201ENST00000325599 BCL11AQ9H165 835 aa23.66■■□□□ 1.38
SHQ1-201ENST00000325599 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.65■■□□□ 1.38
SHQ1-201ENST00000325599 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SHQ1-201ENST00000325599 GRIN2BQ13224 1484 aa23.61■■□□□ 1.37
SHQ1-201ENST00000325599 PTPRKQ15262 1439 aa23.58■■□□□ 1.37
SHQ1-201ENST00000325599 NCOA2Q15596 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
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SHQ1-201ENST00000325599 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.5■■□□□ 1.35
SHQ1-201ENST00000325599 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.49■■□□□ 1.35
SHQ1-201ENST00000325599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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SHQ1-201ENST00000325599 ARID3CA6NKF2 412 aa23.46■■□□□ 1.35
SHQ1-201ENST00000325599 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.46■■□□□ 1.35
SHQ1-201ENST00000325599 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTS12P58397 1594 aa23.45■■□□□ 1.35
SHQ1-201ENST00000325599 IQGAP2Q13576 1575 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-201ENST00000325599 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.45■■□□□ 1.34
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SHQ1-201ENST00000325599 KCNH8Q96L42 1107 aa23.44■■□□□ 1.34
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SHQ1-201ENST00000325599 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
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SHQ1-201ENST00000325599 NAIPQ13075 1403 aa23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF11O15085 1522 aa23.39■■□□□ 1.34
SHQ1-201ENST00000325599 UACAQ9BZF9 1416 aa23.39■■□□□ 1.34
SHQ1-201ENST00000325599 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.39■■□□□ 1.33
SHQ1-201ENST00000325599 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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SHQ1-201ENST00000325599 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-201ENST00000325599 HECW1Q76N89 1606 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-201ENST00000325599 TONSLQ96HA7 1378 aa23.34■■□□□ 1.33
SHQ1-201ENST00000325599 WDR62O43379 1518 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-201ENST00000325599 IFT140Q96RY7 1462 aa23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-201ENST00000325599 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SHQ1-201ENST00000325599 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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SHQ1-201ENST00000325599 TRIM52Q96A61 297 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-201ENST00000325599 DISP1Q96F81 1524 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.22■■□□□ 1.31
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA0556O60303 1618 aa23.2■■□□□ 1.3
SHQ1-201ENST00000325599 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.2■■□□□ 1.3
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SHQ1-201ENST00000325599 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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SHQ1-201ENST00000325599 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.18■■□□□ 1.3
SHQ1-201ENST00000325599 GRIN2AQ12879 1464 aa23.18■■□□□ 1.3
SHQ1-201ENST00000325599 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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SHQ1-201ENST00000325599 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SHQ1-201ENST00000325599 FOXD1Q16676 465 aa23.14■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 ERCC6Q03468 1493 aa23.13■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 AKNAQ7Z591 1439 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.11■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 FBLN2P98095 1184 aa23.11■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.11■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SHQ1-201ENST00000325599 ANP32CO43423 234 aa23.09■■□□□ 1.29
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