RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323699.8

DEGS1-201, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DEGS1, Length 2,101 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-201ENST00000323699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.55■■□□□ 1.2
DEGS1-201ENST00000323699 ITGAEP38570 1179 aa22.54■■□□□ 1.2
DEGS1-201ENST00000323699 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.53■■□□□ 1.2
DEGS1-201ENST00000323699 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.5■■□□□ 1.19
DEGS1-201ENST00000323699 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
DEGS1-201ENST00000323699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.46■■□□□ 1.19
DEGS1-201ENST00000323699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.44■■□□□ 1.18
DEGS1-201ENST00000323699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.43■■□□□ 1.18
DEGS1-201ENST00000323699 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.42■■□□□ 1.18
DEGS1-201ENST00000323699 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.41■■□□□ 1.18
DEGS1-201ENST00000323699 MYT1Q01538 1121 aa22.4■■□□□ 1.18
DEGS1-201ENST00000323699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.182e-6■■■□□ 15.2
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DEGS1-201ENST00000323699 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.37■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.36■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 TOPBP1Q92547 1522 aa22.36■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 WDR97A6NE52 1622 aa22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-201ENST00000323699 P3H3Q8IVL6 736 aa22.33■■□□□ 1.16
DEGS1-201ENST00000323699 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
DEGS1-201ENST00000323699 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.28■■□□□ 1.16
DEGS1-201ENST00000323699 FMN1Q68DA7 1419 aa22.26■■□□□ 1.15
DEGS1-201ENST00000323699 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
DEGS1-201ENST00000323699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.23■■□□□ 1.15
DEGS1-201ENST00000323699 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.21■■□□□ 1.15
DEGS1-201ENST00000323699 NESP48681 1621 aa22.2■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 KCNH8Q96L42 1107 aa22.2■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 SAMD9Q5K651 1589 aa22.19■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.15■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.15■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.15■■□□□ 1.14
DEGS1-201ENST00000323699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 HFM1A2PYH4 1435 aa22.13■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.12■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.12■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.11■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 UACAQ9BZF9 1416 aa22.1■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 GRIN2BQ13224 1484 aa22.1■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 PTPRKQ15262 1439 aa22.09■■□□□ 1.13
DEGS1-201ENST00000323699 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.06■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 NCOA2Q15596 1464 aa22.06■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.06■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 CCER2I3L3R5 266 aa22.06■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.05■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.04■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 TONSLQ96HA7 1378 aa22.04■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 NAIPQ13075 1403 aa22.04■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
DEGS1-201ENST00000323699 ARHGEF11O15085 1522 aa22■■□□□ 1.11
DEGS1-201ENST00000323699 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.99■■□□□ 1.11
DEGS1-201ENST00000323699 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.99■■□□□ 1.11
DEGS1-201ENST00000323699 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
DEGS1-201ENST00000323699 ANP32CO43423 234 aa21.98■■□□□ 1.11
DEGS1-201ENST00000323699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.95■■□□□ 1.1
DEGS1-201ENST00000323699 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.95■■□□□ 1.1
DEGS1-201ENST00000323699 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.93■■□□□ 1.1
DEGS1-201ENST00000323699 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
DEGS1-201ENST00000323699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
DEGS1-201ENST00000323699 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.92■■□□□ 1.1
DEGS1-201ENST00000323699 FKBP8Q14318 412 aa21.89■■□□□ 1.09
DEGS1-201ENST00000323699 ERCC6Q03468 1493 aa21.89■■□□□ 1.09
DEGS1-201ENST00000323699 HECW1Q76N89 1606 aa21.89■■□□□ 1.09
DEGS1-201ENST00000323699 AKNAQ7Z591 1439 aa21.88■■□□□ 1.09
DEGS1-201ENST00000323699 PBRM1Q86U86 1689 aa21.85■■□□□ 1.09
DEGS1-201ENST00000323699 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
DEGS1-201ENST00000323699 IQGAP2Q13576 1575 aa21.82■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 TRIM52Q96A61 297 aa21.82■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 MIA2Q96PC5 1412 aa21.81■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 BCANQ96GW7 911 aa21.8■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 NEFLP07196 543 aa21.79■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.78■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 KDM6BO15054 1643 aa21.77■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 ADAMTS12P58397 1594 aa21.77■■□□□ 1.08
DEGS1-201ENST00000323699 WDR62O43379 1518 aa21.76■■□□□ 1.07
DEGS1-201ENST00000323699 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.73■■□□□ 1.07
DEGS1-201ENST00000323699 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
DEGS1-201ENST00000323699 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.71■■□□□ 1.07
DEGS1-201ENST00000323699 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
DEGS1-201ENST00000323699 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.69■■□□□ 1.06
DEGS1-201ENST00000323699 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
DEGS1-201ENST00000323699 ROCK1Q13464 1354 aa21.66■■□□□ 1.06
DEGS1-201ENST00000323699 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.63■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 DAPK1P53355 1430 aa21.62■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.62■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.62■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.61■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.6■■□□□ 1.05
DEGS1-201ENST00000323699 NCOA1Q15788 1441 aa21.6■■□□□ 1.05
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