RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.5■■□□□ 1.19
PACS1-201ENST00000320580 MRS2Q9HD23 443 aa22.46■■□□□ 1.19
PACS1-201ENST00000320580 MSH5O43196 834 aa22.46■■□□□ 1.19
PACS1-201ENST00000320580 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PACS1-201ENST00000320580 SMARCA2P51531 1590 aa22.45■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 TONSLQ96HA7 1378 aa22.45■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 CLIP1P30622 1438 aa22.44■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.43■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 ARXQ96QS3 562 aa22.43■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 CCER2I3L3R5 266 aa22.41■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
PACS1-201ENST00000320580 ABCC8Q09428 1581 aa22.39■■□□□ 1.17
PACS1-201ENST00000320580 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.36■■□□□ 1.17
PACS1-201ENST00000320580 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.33■■□□□ 1.17
PACS1-201ENST00000320580 IL27Q8NEV9 243 aa22.32■■□□□ 1.16
PACS1-201ENST00000320580 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PACS1-201ENST00000320580 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA3Q08378 1498 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-201ENST00000320580 FBLN2P98095 1184 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-201ENST00000320580 P3H3Q8IVL6 736 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-201ENST00000320580 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-201ENST00000320580 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACS1-201ENST00000320580 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACS1-201ENST00000320580 SOGA1O94964 1423 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-201ENST00000320580 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS1-201ENST00000320580 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS1-201ENST00000320580 EEA1Q15075 1411 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-201ENST00000320580 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS1-201ENST00000320580 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-201ENST00000320580 NCAPD3P42695 1498 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-201ENST00000320580 TMC1Q8TDI8 760 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-201ENST00000320580 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-201ENST00000320580 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-201ENST00000320580 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PACS1-201ENST00000320580 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-201ENST00000320580 USP35Q9P2H5 1018 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-201ENST00000320580 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.02■■□□□ 1.12
PACS1-201ENST00000320580 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.01■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 VPS8Q8N3P4 1428 aa22■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 ARID3CA6NKF2 412 aa22■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 GSE1Q14687 1217 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.97■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.96■■□□□ 1.11
PACS1-201ENST00000320580 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.95■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 KIF27Q86VH2 1401 aa21.92■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 ERCC6Q03468 1493 aa21.91■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.9■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 CUX2O14529 1486 aa21.89■■□□□ 1.1
PACS1-201ENST00000320580 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 NESP48681 1621 aa21.85■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 BECN1Q14457 450 aa21.84■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.83■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC4A3P48751 1232 aa21.83■■□□□ 1.09
PACS1-201ENST00000320580 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 RGS3P49796 1198 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 PDE4AP27815 886 aa21.81■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.81■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.79■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 HMGXB3Q12766 1538 aa21.79■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 NUDCQ9Y266 331 aa21.77■■□□□ 1.08
PACS1-201ENST00000320580 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PACS1-201ENST00000320580 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-201ENST00000320580 CFTRP13569 1480 aa21.73■■□□□ 1.07
PACS1-201ENST00000320580 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PACS1-201ENST00000320580 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.71■■□□□ 1.07
PACS1-201ENST00000320580 NFKBIBQ15653 356 aa21.7■■□□□ 1.06
PACS1-201ENST00000320580 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.69■■□□□ 1.06
PACS1-201ENST00000320580 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.68■■□□□ 1.06
PACS1-201ENST00000320580 SYNJ1O43426 1573 aa21.67■■□□□ 1.06
PACS1-201ENST00000320580 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PACS1-201ENST00000320580 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PACS1-201ENST00000320580 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.63■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.62■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.62■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.62■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.62■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.6■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 ARID3AQ99856 593 aa21.58■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PACS1-201ENST00000320580 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.58■■□□□ 1.04
PACS1-201ENST00000320580 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms