RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313766.5

FAM20C-201, Transcript of FAM20C, golgi associated secretory pathway kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM20C, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20C-201ENST00000313766 MAPKBP1O60336 1514 aa30.1■■■□□ 2.41
FAM20C-201ENST00000313766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.09■■■□□ 2.41
FAM20C-201ENST00000313766 SETD5Q9C0A6 1442 aa30■■■□□ 2.39
FAM20C-201ENST00000313766 TIAM1Q13009 1591 aa30■■■□□ 2.39
FAM20C-201ENST00000313766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.99■■■□□ 2.39
FAM20C-201ENST00000313766 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.97■■■□□ 2.39
FAM20C-201ENST00000313766 WDR97A6NE52 1622 aa29.96■■■□□ 2.39
FAM20C-201ENST00000313766 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.93■■■□□ 2.38
FAM20C-201ENST00000313766 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.91■■■□□ 2.38
FAM20C-201ENST00000313766 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.91■■■□□ 2.38
FAM20C-201ENST00000313766 TRIM52Q96A61 297 aa29.86■■■□□ 2.37
FAM20C-201ENST00000313766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.84■■■□□ 2.37
FAM20C-201ENST00000313766 FKBP8Q14318 412 aa29.83■■■□□ 2.37
FAM20C-201ENST00000313766 MYT1Q01538 1121 aa29.83■■■□□ 2.37
FAM20C-201ENST00000313766 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
FAM20C-201ENST00000313766 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
FAM20C-201ENST00000313766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.73■■■□□ 2.35
FAM20C-201ENST00000313766 MAP3K1Q13233 1512 aa29.69■■■□□ 2.34
FAM20C-201ENST00000313766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.66■■■□□ 2.34
FAM20C-201ENST00000313766 NESP48681 1621 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM20C-201ENST00000313766 ANP32CO43423 234 aa29.6■■■□□ 2.33
FAM20C-201ENST00000313766 PTPRKQ15262 1439 aa29.59■■■□□ 2.33
FAM20C-201ENST00000313766 TONSLQ96HA7 1378 aa29.57■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 PRDM2Q13029 1718 aa29.57■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.56■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 ARID3CA6NKF2 412 aa29.54■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.54■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.54■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.52■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.52■■■□□ 2.32
FAM20C-201ENST00000313766 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.49■■■□□ 2.31
FAM20C-201ENST00000313766 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.49■■■□□ 2.31
FAM20C-201ENST00000313766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.47■■■□□ 2.31
FAM20C-201ENST00000313766 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.47■■■□□ 2.31
FAM20C-201ENST00000313766 TOPBP1Q92547 1522 aa29.46■■■□□ 2.31
FAM20C-201ENST00000313766 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
FAM20C-201ENST00000313766 NEFLP07196 543 aa29.45■■■□□ 2.3
FAM20C-201ENST00000313766 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.44■■■□□ 2.3
FAM20C-201ENST00000313766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.32e-6■■■□□ 18.8
FAM20C-201ENST00000313766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.42■■■□□ 2.3
FAM20C-201ENST00000313766 CCER2I3L3R5 266 aa29.39■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.38■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 FOXD1Q16676 465 aa29.37■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.36■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.36■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 FMN1Q68DA7 1419 aa29.35■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.35■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 NAIPQ13075 1403 aa29.33■■■□□ 2.29
FAM20C-201ENST00000313766 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.32■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 HFM1A2PYH4 1435 aa29.32■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 NCOA2Q15596 1464 aa29.32■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 UACAQ9BZF9 1416 aa29.32■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.282e-6■■■□□ 18.8
FAM20C-201ENST00000313766 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.27■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
FAM20C-201ENST00000313766 CCDC184Q52MB2 194 aa29.26■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.24■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.24■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.22■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.22■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
FAM20C-201ENST00000313766 CUL7Q14999 1698 aa29.17■■■□□ 2.26
FAM20C-201ENST00000313766 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.17■■■□□ 2.26
FAM20C-201ENST00000313766 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.16■■■□□ 2.26
FAM20C-201ENST00000313766 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
FAM20C-201ENST00000313766 GRIN2BQ13224 1484 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM20C-201ENST00000313766 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM20C-201ENST00000313766 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM20C-201ENST00000313766 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
FAM20C-201ENST00000313766 KDM6BO15054 1643 aa29.1■■■□□ 2.25
FAM20C-201ENST00000313766 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.09■■■□□ 2.25
FAM20C-201ENST00000313766 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.08■■■□□ 2.25
FAM20C-201ENST00000313766 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.08■■■□□ 2.25
FAM20C-201ENST00000313766 SAMD9Q5K651 1589 aa29.06■■■□□ 2.24
FAM20C-201ENST00000313766 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
FAM20C-201ENST00000313766 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FAM20C-201ENST00000313766 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
FAM20C-201ENST00000313766 MSH5O43196 834 aa29.01■■■□□ 2.23
FAM20C-201ENST00000313766 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29■■■□□ 2.23
FAM20C-201ENST00000313766 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.99■■■□□ 2.23
FAM20C-201ENST00000313766 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.98■■■□□ 2.23
FAM20C-201ENST00000313766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.97■■■□□ 2.23
FAM20C-201ENST00000313766 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.95■■■□□ 2.22
FAM20C-201ENST00000313766 MRS2Q9HD23 443 aa28.93■■■□□ 2.22
FAM20C-201ENST00000313766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.91■■■□□ 2.22
FAM20C-201ENST00000313766 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FAM20C-201ENST00000313766 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
FAM20C-201ENST00000313766 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
FAM20C-201ENST00000313766 ARHGEF11O15085 1522 aa28.87■■■□□ 2.21
FAM20C-201ENST00000313766 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.87■■■□□ 2.21
FAM20C-201ENST00000313766 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FAM20C-201ENST00000313766 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM20C-201ENST00000313766 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
FAM20C-201ENST00000313766 CCDC7Q96M83 1385 aa28.84■■■□□ 2.21
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