RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299295.6

CHODL-201, Transcript of chondrolectin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHODL, Length 2,548 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHODL-201ENST00000299295 MYT1Q01538 1121 aa31.79■■■□□ 2.68
CHODL-201ENST00000299295 MAPKBP1O60336 1514 aa31.76■■■□□ 2.67
CHODL-201ENST00000299295 P3H3Q8IVL6 736 aa31.76■■■□□ 2.67
CHODL-201ENST00000299295 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.74■■■□□ 2.67
CHODL-201ENST00000299295 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
CHODL-201ENST00000299295 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
CHODL-201ENST00000299295 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.7■■■□□ 2.67
CHODL-201ENST00000299295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.69■■■□□ 2.66
CHODL-201ENST00000299295 TIAM1Q13009 1591 aa31.69■■■□□ 2.66
CHODL-201ENST00000299295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.68■■■□□ 2.66
CHODL-201ENST00000299295 TOPBP1Q92547 1522 aa31.68■■■□□ 2.66
CHODL-201ENST00000299295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.65■■■□□ 2.66
CHODL-201ENST00000299295 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.65■■■□□ 2.66
CHODL-201ENST00000299295 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CHODL-201ENST00000299295 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.63■■■□□ 2.65
CHODL-201ENST00000299295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.61■■■□□ 2.65
CHODL-201ENST00000299295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CHODL-201ENST00000299295 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
CHODL-201ENST00000299295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CHODL-201ENST00000299295 WDR97A6NE52 1622 aa31.56■■■□□ 2.64
CHODL-201ENST00000299295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.53■■■□□ 2.64
CHODL-201ENST00000299295 MAP3K1Q13233 1512 aa31.51■■■□□ 2.63
CHODL-201ENST00000299295 BCANQ96GW7 911 aa31.51■■■□□ 2.63
CHODL-201ENST00000299295 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.5■■■□□ 2.63
CHODL-201ENST00000299295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.46■■■□□ 2.63
CHODL-201ENST00000299295 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CHODL-201ENST00000299295 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.44■■■□□ 2.62
CHODL-201ENST00000299295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.41■■■□□ 2.62
CHODL-201ENST00000299295 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CHODL-201ENST00000299295 FKBP8Q14318 412 aa31.35■■■□□ 2.61
CHODL-201ENST00000299295 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.31■■■□□ 2.6
CHODL-201ENST00000299295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CHODL-201ENST00000299295 TRIM52Q96A61 297 aa31.29■■■□□ 2.6
CHODL-201ENST00000299295 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.2■■■□□ 2.59
CHODL-201ENST00000299295 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.2■■■□□ 2.58
CHODL-201ENST00000299295 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.18■■■□□ 2.58
CHODL-201ENST00000299295 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.18■■■□□ 2.58
CHODL-201ENST00000299295 ANP32CO43423 234 aa31.17■■■□□ 2.58
CHODL-201ENST00000299295 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.16■■■□□ 2.58
CHODL-201ENST00000299295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.13■■■□□ 2.57
CHODL-201ENST00000299295 PTPRKQ15262 1439 aa31.13■■■□□ 2.57
CHODL-201ENST00000299295 TONSLQ96HA7 1378 aa31.12■■■□□ 2.57
CHODL-201ENST00000299295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CHODL-201ENST00000299295 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.12■■■□□ 2.57
CHODL-201ENST00000299295 CUL7Q14999 1698 aa31.1■■■□□ 2.57
CHODL-201ENST00000299295 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.07■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 CCER2I3L3R5 266 aa31.07■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.07■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.06■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 ERCC6Q03468 1493 aa31.06■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.05■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 NEFLP07196 543 aa31.02■■■□□ 2.56
CHODL-201ENST00000299295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.99■■■□□ 2.55
CHODL-201ENST00000299295 FMN1Q68DA7 1419 aa30.99■■■□□ 2.55
CHODL-201ENST00000299295 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.99■■■□□ 2.55
CHODL-201ENST00000299295 WDR62O43379 1518 aa30.98■■■□□ 2.55
CHODL-201ENST00000299295 HFM1A2PYH4 1435 aa30.96■■■□□ 2.55
CHODL-201ENST00000299295 UACAQ9BZF9 1416 aa30.96■■■□□ 2.55
CHODL-201ENST00000299295 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.94■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.92■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 NAIPQ13075 1403 aa30.92■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.91■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.91■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 NCOA2Q15596 1464 aa30.9■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CHODL-201ENST00000299295 IFT140Q96RY7 1462 aa30.87■■■□□ 2.53
CHODL-201ENST00000299295 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CHODL-201ENST00000299295 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.86■■■□□ 2.53
CHODL-201ENST00000299295 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.85■■■□□ 2.53
CHODL-201ENST00000299295 PBRM1Q86U86 1689 aa30.84■■■□□ 2.53
CHODL-201ENST00000299295 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.8■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 GRIN2BQ13224 1484 aa30.79■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.76■■■□□ 2.52
CHODL-201ENST00000299295 ARID3CA6NKF2 412 aa30.76■■■□□ 2.51
CHODL-201ENST00000299295 SAMD9Q5K651 1589 aa30.75■■■□□ 2.51
CHODL-201ENST00000299295 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.72■■■□□ 2.51
CHODL-201ENST00000299295 FOXD1Q16676 465 aa30.72■■■□□ 2.51
CHODL-201ENST00000299295 ADAMTS12P58397 1594 aa30.71■■■□□ 2.51
CHODL-201ENST00000299295 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CHODL-201ENST00000299295 CCDC184Q52MB2 194 aa30.68■■■□□ 2.5
CHODL-201ENST00000299295 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CHODL-201ENST00000299295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CHODL-201ENST00000299295 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.65■■■□□ 2.5
CHODL-201ENST00000299295 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.65■■■□□ 2.5
CHODL-201ENST00000299295 KDM6BO15054 1643 aa30.63■■■□□ 2.49
CHODL-201ENST00000299295 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CHODL-201ENST00000299295 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.59■■■□□ 2.49
CHODL-201ENST00000299295 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
CHODL-201ENST00000299295 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.59■■■□□ 2.49
CHODL-201ENST00000299295 ARHGEF11O15085 1522 aa30.57■■■□□ 2.48
CHODL-201ENST00000299295 MSH5O43196 834 aa30.52■■■□□ 2.48
CHODL-201ENST00000299295 IQGAP2Q13576 1575 aa30.51■■■□□ 2.47
CHODL-201ENST00000299295 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.51■■■□□ 2.47
CHODL-201ENST00000299295 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CHODL-201ENST00000299295 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms