RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296257.9

SENP2-201, Transcript of SUMO specific peptidase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP2, Length 5,717 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP2-201ENST00000296257 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SENP2-201ENST00000296257 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP2-201ENST00000296257 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP2-201ENST00000296257 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.12■■□□□ 1.45
SENP2-201ENST00000296257 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SENP2-201ENST00000296257 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.09■■□□□ 1.45
SENP2-201ENST00000296257 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 TMC1Q8TDI8 760 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 BCL11AQ9H165 835 aa24.03■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 FKBP8Q14318 412 aa24.02■■□□□ 1.44
SENP2-201ENST00000296257 C14orf37Q86TY3 774 aa24■■□□□ 1.43
SENP2-201ENST00000296257 SOGA1O94964 1423 aa24■■□□□ 1.43
SENP2-201ENST00000296257 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SENP2-201ENST00000296257 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SENP2-201ENST00000296257 CDCA8Q53HL2 280 aa23.97■■□□□ 1.43
SENP2-201ENST00000296257 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.96■■□□□ 1.43
SENP2-201ENST00000296257 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
SENP2-201ENST00000296257 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SENP2-201ENST00000296257 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.93■■□□□ 1.42
SENP2-201ENST00000296257 KANK1Q14678 1352 aa23.91■■□□□ 1.42
SENP2-201ENST00000296257 RGL3Q3MIN7 710 aa23.9■■□□□ 1.42
SENP2-201ENST00000296257 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SENP2-201ENST00000296257 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SENP2-201ENST00000296257 MRS2Q9HD23 443 aa23.85■■□□□ 1.41
SENP2-201ENST00000296257 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.82■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 CFAP53Q96M91 514 aa23.79■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 WIZO95785 1651 aa23.78■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 FMN1Q68DA7 1419 aa23.78■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 ABCC8Q09428 1581 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP2-201ENST00000296257 SMARCA4P51532 1647 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 POGKQ9P215 609 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.72■■□□□ 1.39
SENP2-201ENST00000296257 A0A0G2JS52 829 aa23.7■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.65■■□□□ 1.38
SENP2-201ENST00000296257 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 MIER1Q8N108 512 aa23.62■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.61■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 PLEKHG5O94827 1062 aa23.61■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.61■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 MLECQ14165 292 aa23.6■■□□□ 1.37
SENP2-201ENST00000296257 NUDCQ9Y266 331 aa23.57■■□□□ 1.36
SENP2-201ENST00000296257 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.56■■□□□ 1.36
SENP2-201ENST00000296257 GGT6Q6P531 493 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP2-201ENST00000296257 NBR1Q14596 966 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP2-201ENST00000296257 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.51■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.51■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 TMF1P82094 1093 aa23.5■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.5■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.5■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.49■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.49■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 JPH4Q96JJ6 628 aa23.49■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.48■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.46■■□□□ 1.35
SENP2-201ENST00000296257 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.44■■□□□ 1.34
SENP2-201ENST00000296257 PKD2Q13563 968 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP2-201ENST00000296257 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP2-201ENST00000296257 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 OSCARQ8IYS5 282 aa23.35■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 NUP155O75694 1391 aa23.35■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 NCAPD3P42695 1498 aa23.35■■□□□ 1.33
SENP2-201ENST00000296257 PTPRGP23470 1445 aa23.32■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 KIF3BO15066 747 aa23.3■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 ARXQ96QS3 562 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SENP2-201ENST00000296257 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 EID1Q9Y6B2 187 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms