RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.55■■■■□ 3.44
CTBP1-201ENST00000290921 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.49■■■■□ 3.43
CTBP1-201ENST00000290921 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.48■■■■□ 3.43
CTBP1-201ENST00000290921 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.47■■■■□ 3.43
CTBP1-201ENST00000290921 MAPKBP1O60336 1514 aa36.47■■■■□ 3.43
CTBP1-201ENST00000290921 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CTBP1-201ENST00000290921 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.44■■■■□ 3.42
CTBP1-201ENST00000290921 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CTBP1-201ENST00000290921 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.42■■■■□ 3.42
CTBP1-201ENST00000290921 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.4■■■■□ 3.42
CTBP1-201ENST00000290921 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CTBP1-201ENST00000290921 TOPBP1Q92547 1522 aa36.37■■■■□ 3.41
CTBP1-201ENST00000290921 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.34■■■■□ 3.41
CTBP1-201ENST00000290921 P3H3Q8IVL6 736 aa36.33■■■■□ 3.41
CTBP1-201ENST00000290921 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.32■■■■□ 3.41
CTBP1-201ENST00000290921 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.31■■■■□ 3.4
CTBP1-201ENST00000290921 CUL7Q14999 1698 aa36.3■■■■□ 3.4
CTBP1-201ENST00000290921 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CTBP1-201ENST00000290921 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.393e-7■■■■□ 20.1
CTBP1-201ENST00000290921 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.25■■■■□ 3.39
CTBP1-201ENST00000290921 NESP48681 1621 aa36.22■■■■□ 3.39
CTBP1-201ENST00000290921 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.21■■■■□ 3.39
CTBP1-201ENST00000290921 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CTBP1-201ENST00000290921 KCNH8Q96L42 1107 aa36.15■■■■□ 3.38
CTBP1-201ENST00000290921 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.388e-7■■■■□ 23.2
CTBP1-201ENST00000290921 WDR97A6NE52 1622 aa36.13■■■■□ 3.37
CTBP1-201ENST00000290921 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.1■■■■□ 3.37
CTBP1-201ENST00000290921 FMN1Q68DA7 1419 aa36.09■■■■□ 3.37
CTBP1-201ENST00000290921 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.05■■■■□ 3.36
CTBP1-201ENST00000290921 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CTBP1-201ENST00000290921 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.03■■■■□ 3.36
CTBP1-201ENST00000290921 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
CTBP1-201ENST00000290921 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.01■■■■□ 3.36
CTBP1-201ENST00000290921 FGD6Q6ZV73 1430 aa36■■■■□ 3.35
CTBP1-201ENST00000290921 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.98■■■■□ 3.35
CTBP1-201ENST00000290921 SAMD9Q5K651 1589 aa35.96■■■■□ 3.35
CTBP1-201ENST00000290921 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.94■■■■□ 3.34
CTBP1-201ENST00000290921 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CTBP1-201ENST00000290921 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.9■■■■□ 3.34
CTBP1-201ENST00000290921 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CTBP1-201ENST00000290921 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.88■■■■□ 3.33
CTBP1-201ENST00000290921 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.84■■■■□ 3.33
CTBP1-201ENST00000290921 GRIN2BQ13224 1484 aa35.83■■■■□ 3.33
CTBP1-201ENST00000290921 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.82■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 HFM1A2PYH4 1435 aa35.81■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 PTPRKQ15262 1439 aa35.79■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 NCOA2Q15596 1464 aa35.78■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.77■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CTBP1-201ENST00000290921 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.76■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.76■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 UACAQ9BZF9 1416 aa35.74■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.72■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 FKBP8Q14318 412 aa35.72■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 BCANQ96GW7 911 aa35.71■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 CCER2I3L3R5 266 aa35.71■■■■□ 3.31
CTBP1-201ENST00000290921 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.67■■■■□ 3.3
CTBP1-201ENST00000290921 ANP32CO43423 234 aa35.67■■■■□ 3.3
CTBP1-201ENST00000290921 TONSLQ96HA7 1378 aa35.67■■■■□ 3.3
CTBP1-201ENST00000290921 NAIPQ13075 1403 aa35.67■■■■□ 3.3
CTBP1-201ENST00000290921 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CTBP1-201ENST00000290921 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.62■■■■□ 3.29
CTBP1-201ENST00000290921 ARHGEF11O15085 1522 aa35.62■■■■□ 3.29
CTBP1-201ENST00000290921 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.57■■■■□ 3.29
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM52Q96A61 297 aa35.54■■■■□ 3.28
CTBP1-201ENST00000290921 NEFLP07196 543 aa35.53■■■■□ 3.28
CTBP1-201ENST00000290921 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CTBP1-201ENST00000290921 HECW1Q76N89 1606 aa35.5■■■■□ 3.27
CTBP1-201ENST00000290921 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.49■■■■□ 3.27
CTBP1-201ENST00000290921 PBRM1Q86U86 1689 aa35.47■■■■□ 3.27
CTBP1-201ENST00000290921 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.45■■■■□ 3.27
CTBP1-201ENST00000290921 IQGAP2Q13576 1575 aa35.44■■■■□ 3.26
CTBP1-201ENST00000290921 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.44■■■■□ 3.26
CTBP1-201ENST00000290921 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.41■■■■□ 3.26
CTBP1-201ENST00000290921 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
CTBP1-201ENST00000290921 ADAMTS12P58397 1594 aa35.4■■■■□ 3.26
CTBP1-201ENST00000290921 AKNAQ7Z591 1439 aa35.38■■■■□ 3.25
CTBP1-201ENST00000290921 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.35■■■■□ 3.25
CTBP1-201ENST00000290921 MIA2Q96PC5 1412 aa35.32■■■■□ 3.24
CTBP1-201ENST00000290921 WDR62O43379 1518 aa35.32■■■■□ 3.24
CTBP1-201ENST00000290921 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CTBP1-201ENST00000290921 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.31■■■■□ 3.24
CTBP1-201ENST00000290921 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CTBP1-201ENST00000290921 KDM6BO15054 1643 aa35.25■■■■□ 3.23
CTBP1-201ENST00000290921 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.23■■■■□ 3.23
CTBP1-201ENST00000290921 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CTBP1-201ENST00000290921 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CTBP1-201ENST00000290921 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
CTBP1-201ENST00000290921 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.12■■■■□ 3.21
CTBP1-201ENST00000290921 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.12■■■■□ 3.21
CTBP1-201ENST00000290921 ARID3CA6NKF2 412 aa35.11■■■■□ 3.21
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA0556O60303 1618 aa35.07■■■■□ 3.2
CTBP1-201ENST00000290921 IFT140Q96RY7 1462 aa35.06■■■■□ 3.2
CTBP1-201ENST00000290921 ROCK1Q13464 1354 aa35.06■■■■□ 3.2
CTBP1-201ENST00000290921 DAPK1P53355 1430 aa35.06■■■■□ 3.2
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.05■■■■□ 3.2
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CTBP1-201ENST00000290921 DISP1Q96F81 1524 aa35.04■■■■□ 3.2
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