RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284551.10

TRIM11-201, Transcript of tripartite motif containing 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM11, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11-201ENST00000284551 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.5■■□□□ 1.51
TRIM11-201ENST00000284551 TIAM1Q13009 1591 aa24.49■■□□□ 1.51
TRIM11-201ENST00000284551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.48■■□□□ 1.51
TRIM11-201ENST00000284551 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.47■■□□□ 1.51
TRIM11-201ENST00000284551 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.43■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.42■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.4■■□□□ 1.5
TRIM11-201ENST00000284551 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.33■■□□□ 1.48
TRIM11-201ENST00000284551 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM11-201ENST00000284551 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.28■■□□□ 1.48
TRIM11-201ENST00000284551 MAPKBP1O60336 1514 aa24.27■■□□□ 1.48
TRIM11-201ENST00000284551 MAP3K1Q13233 1512 aa24.27■■□□□ 1.48
TRIM11-201ENST00000284551 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.25■■□□□ 1.47
TRIM11-201ENST00000284551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM11-201ENST00000284551 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM11-201ENST00000284551 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.21■■□□□ 1.47
TRIM11-201ENST00000284551 WDR97A6NE52 1622 aa24.21■■□□□ 1.47
TRIM11-201ENST00000284551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM11-201ENST00000284551 CUL7Q14999 1698 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM11-201ENST00000284551 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.19■■□□□ 1.46
TRIM11-201ENST00000284551 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM11-201ENST00000284551 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM11-201ENST00000284551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM11-201ENST00000284551 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.13■■□□□ 1.45
TRIM11-201ENST00000284551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.13■■□□□ 1.45
TRIM11-201ENST00000284551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.12■■□□□ 1.45
TRIM11-201ENST00000284551 ARID3CA6NKF2 412 aa24.12■■□□□ 1.45
TRIM11-201ENST00000284551 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.11■■□□□ 1.45
TRIM11-201ENST00000284551 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TRIM11-201ENST00000284551 KCNH8Q96L42 1107 aa24.07■■□□□ 1.44
TRIM11-201ENST00000284551 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.07■■□□□ 1.44
TRIM11-201ENST00000284551 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 34.8
TRIM11-201ENST00000284551 PTPRKQ15262 1439 aa24.06■■□□□ 1.44
TRIM11-201ENST00000284551 FMN1Q68DA7 1419 aa24.06■■□□□ 1.44
TRIM11-201ENST00000284551 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.03■■□□□ 1.44
TRIM11-201ENST00000284551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TRIM11-201ENST00000284551 SAMD9Q5K651 1589 aa24.01■■□□□ 1.43
TRIM11-201ENST00000284551 GRIN2BQ13224 1484 aa23.97■■□□□ 1.43
TRIM11-201ENST00000284551 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.96■■□□□ 1.43
TRIM11-201ENST00000284551 NCOA2Q15596 1464 aa23.96■■□□□ 1.43
TRIM11-201ENST00000284551 MYT1Q01538 1121 aa23.93■■□□□ 1.42
TRIM11-201ENST00000284551 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TRIM11-201ENST00000284551 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.93■■□□□ 1.42
TRIM11-201ENST00000284551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.89■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.88■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 PBRM1Q86U86 1689 aa23.88■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.86■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.413e-6■□□□□ 10.3
TRIM11-201ENST00000284551 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TRIM11-201ENST00000284551 NAIPQ13075 1403 aa23.82■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.81■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 HFM1A2PYH4 1435 aa23.8■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.79■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 ADAMTS12P58397 1594 aa23.79■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 IQGAP2Q13576 1575 aa23.78■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.77■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.77■■□□□ 1.4
TRIM11-201ENST00000284551 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 UACAQ9BZF9 1416 aa23.73■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 TONSLQ96HA7 1378 aa23.73■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 KDM6BO15054 1643 aa23.73■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 FOXD1Q16676 465 aa23.72■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 ARHGEF11O15085 1522 aa23.71■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 ERCC6Q03468 1493 aa23.71■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TRIM11-201ENST00000284551 TRIM52Q96A61 297 aa23.69■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 HECW1Q76N89 1606 aa23.67■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 WDR62O43379 1518 aa23.66■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.64■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
TRIM11-201ENST00000284551 FBLN2P98095 1184 aa23.62■■□□□ 1.37
TRIM11-201ENST00000284551 DISP1Q96F81 1524 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM11-201ENST00000284551 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM11-201ENST00000284551 IFT140Q96RY7 1462 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM11-201ENST00000284551 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TRIM11-201ENST00000284551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TRIM11-201ENST00000284551 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRIM11-201ENST00000284551 KIAA0556O60303 1618 aa23.54■■□□□ 1.36
TRIM11-201ENST00000284551 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.53■■□□□ 1.36
TRIM11-201ENST00000284551 GRIN2AQ12879 1464 aa23.53■■□□□ 1.36
TRIM11-201ENST00000284551 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.53■■□□□ 1.36
TRIM11-201ENST00000284551 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.5■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 BCANQ96GW7 911 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 ANP32CO43423 234 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 MIA2Q96PC5 1412 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM11-201ENST00000284551 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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