RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269221.7

C18orf8-201, Transcript of Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C18orf8, Length 2,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8-201ENST00000269221 IGF1RP08069 1367 aa25.03■■□□□ 1.6
C18orf8-201ENST00000269221 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.99■■□□□ 1.59
C18orf8-201ENST00000269221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.97■■□□□ 1.59
C18orf8-201ENST00000269221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 31
C18orf8-201ENST00000269221 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.93■■□□□ 1.58
C18orf8-201ENST00000269221 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
C18orf8-201ENST00000269221 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.89■■□□□ 1.58
C18orf8-201ENST00000269221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.89■■□□□ 1.58
C18orf8-201ENST00000269221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.89■■□□□ 1.57
C18orf8-201ENST00000269221 WDR97A6NE52 1622 aa24.86■■□□□ 1.57
C18orf8-201ENST00000269221 CUL7Q14999 1698 aa24.86■■□□□ 1.57
C18orf8-201ENST00000269221 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.86■■□□□ 1.57
C18orf8-201ENST00000269221 CCER2I3L3R5 266 aa24.86■■□□□ 1.57
C18orf8-201ENST00000269221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.82■■□□□ 1.56
C18orf8-201ENST00000269221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.82■■□□□ 1.56
C18orf8-201ENST00000269221 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.81■■□□□ 1.56
C18orf8-201ENST00000269221 ITGAEP38570 1179 aa24.78■■□□□ 1.56
C18orf8-201ENST00000269221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.77■■□□□ 1.56
C18orf8-201ENST00000269221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.76■■□□□ 1.55
C18orf8-201ENST00000269221 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
C18orf8-201ENST00000269221 FMN1Q68DA7 1419 aa24.73■■□□□ 1.55
C18orf8-201ENST00000269221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
C18orf8-201ENST00000269221 NEFLP07196 543 aa24.69■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.67■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 ANP32CO43423 234 aa24.66■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.66■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.65■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 UACAQ9BZF9 1416 aa24.65■■□□□ 1.54
C18orf8-201ENST00000269221 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.64■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 HFM1A2PYH4 1435 aa24.64■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.61■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.61■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 TONSLQ96HA7 1378 aa24.6■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.59■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.59■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 SAMD9Q5K651 1589 aa24.59■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.59■■□□□ 1.53
C18orf8-201ENST00000269221 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
C18orf8-201ENST00000269221 TOPBP1Q92547 1522 aa24.55■■□□□ 1.52
C18orf8-201ENST00000269221 FKBP8Q14318 412 aa24.55■■□□□ 1.52
C18orf8-201ENST00000269221 KCNH8Q96L42 1107 aa24.55■■□□□ 1.52
C18orf8-201ENST00000269221 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.54■■□□□ 1.52
C18orf8-201ENST00000269221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
C18orf8-201ENST00000269221 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.49■■□□□ 1.51
C18orf8-201ENST00000269221 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.48■■□□□ 1.51
C18orf8-201ENST00000269221 AKNAQ7Z591 1439 aa24.48■■□□□ 1.51
C18orf8-201ENST00000269221 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.48■■□□□ 1.51
C18orf8-201ENST00000269221 HECW1Q76N89 1606 aa24.46■■□□□ 1.51
C18orf8-201ENST00000269221 GRIN2BQ13224 1484 aa24.45■■□□□ 1.51
C18orf8-201ENST00000269221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.44■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 NAIPQ13075 1403 aa24.44■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.43■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 NCOA2Q15596 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 ARHGEF11O15085 1522 aa24.43■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.42■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.42■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.41■■□□□ 1.5
C18orf8-201ENST00000269221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.39■■□□□ 1.49
C18orf8-201ENST00000269221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.39■■□□□ 1.49
C18orf8-201ENST00000269221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
C18orf8-201ENST00000269221 P3H3Q8IVL6 736 aa24.37■■□□□ 1.49
C18orf8-201ENST00000269221 PTPRKQ15262 1439 aa24.35■■□□□ 1.49
C18orf8-201ENST00000269221 BCANQ96GW7 911 aa24.34■■□□□ 1.49
C18orf8-201ENST00000269221 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
C18orf8-201ENST00000269221 MIA2Q96PC5 1412 aa24.27■■□□□ 1.48
C18orf8-201ENST00000269221 TRIM52Q96A61 297 aa24.27■■□□□ 1.48
C18orf8-201ENST00000269221 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.25■■□□□ 1.47
C18orf8-201ENST00000269221 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
C18orf8-201ENST00000269221 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.23■■□□□ 1.47
C18orf8-201ENST00000269221 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.22■■□□□ 1.47
C18orf8-201ENST00000269221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
C18orf8-201ENST00000269221 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
C18orf8-201ENST00000269221 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
C18orf8-201ENST00000269221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
C18orf8-201ENST00000269221 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
C18orf8-201ENST00000269221 NESP48681 1621 aa24.14■■□□□ 1.46
C18orf8-201ENST00000269221 ROCK1Q13464 1354 aa24.13■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.13■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 NCOA1Q15788 1441 aa24.13■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.12■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.11■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.1■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 IQGAP2Q13576 1575 aa24.1■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.09■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 PBRM1Q86U86 1689 aa24.09■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
C18orf8-201ENST00000269221 WDR62O43379 1518 aa24.06■■□□□ 1.44
C18orf8-201ENST00000269221 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
C18orf8-201ENST00000269221 CCDC7Q96M83 1385 aa24.05■■□□□ 1.44
C18orf8-201ENST00000269221 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
C18orf8-201ENST00000269221 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.04■■□□□ 1.44
C18orf8-201ENST00000269221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
C18orf8-201ENST00000269221 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.01■■□□□ 1.43
C18orf8-201ENST00000269221 KDM6BO15054 1643 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 201.3 ms