RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266068.5

GMEB2-201, Transcript of glucocorticoid modulatory element binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GMEB2, Length 4,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2-201ENST00000266068 TRIM52Q96A61 297 aa18.4■□□□□ 0.54
GMEB2-201ENST00000266068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.38■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 FMN1Q68DA7 1419 aa18.37■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 ARID3CA6NKF2 412 aa18.37■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 ARAP1Q96P48 1450 aa18.34■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.34■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 NESP48681 1621 aa18.34■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 TOPBP1Q92547 1522 aa18.33■□□□□ 0.53
GMEB2-201ENST00000266068 ERCC6Q03468 1493 aa18.33■□□□□ 0.52
GMEB2-201ENST00000266068 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.32■□□□□ 0.52
GMEB2-201ENST00000266068 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.32■□□□□ 0.52
GMEB2-201ENST00000266068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
GMEB2-201ENST00000266068 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.28■□□□□ 0.52
GMEB2-201ENST00000266068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.27■□□□□ 0.52
GMEB2-201ENST00000266068 TONSLQ96HA7 1378 aa18.25■□□□□ 0.51
GMEB2-201ENST00000266068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.24■□□□□ 0.51
GMEB2-201ENST00000266068 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.24■□□□□ 0.51
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GMEB2-201ENST00000266068 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
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GMEB2-201ENST00000266068 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.18■□□□□ 0.5
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GMEB2-201ENST00000266068 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
GMEB2-201ENST00000266068 BCANQ96GW7 911 aa18.16■□□□□ 0.5
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GMEB2-201ENST00000266068 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
GMEB2-201ENST00000266068 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.15■□□□□ 0.5
GMEB2-201ENST00000266068 MIER1Q8N108 512 aa18.15■□□□□ 0.5
GMEB2-201ENST00000266068 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.13■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 ANP32CO43423 234 aa18.12■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 CUL7Q14999 1698 aa18.12■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.11■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.11■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.11■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 TIAM1Q13009 1591 aa18.1■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.09■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.09■□□□□ 0.49
GMEB2-201ENST00000266068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 MAP3K1Q13233 1512 aa18.06■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.06■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.05■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.05■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 GRIN2BQ13224 1484 aa18.05■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 40.7
GMEB2-201ENST00000266068 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.03■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.02■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GMEB2-201ENST00000266068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 IFT140Q96RY7 1462 aa17.99■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 TSPY4P0CV99 314 aa17.99■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 TSPY10P0CW01 314 aa17.99■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.98■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.98■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
GMEB2-201ENST00000266068 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
GMEB2-201ENST00000266068 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
GMEB2-201ENST00000266068 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.94■□□□□ 0.46
GMEB2-201ENST00000266068 NCOA2Q15596 1464 aa17.9■□□□□ 0.46
GMEB2-201ENST00000266068 JPH4Q96JJ6 628 aa17.89■□□□□ 0.45
GMEB2-201ENST00000266068 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 122.8
GMEB2-201ENST00000266068 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.87■□□□□ 0.45
GMEB2-201ENST00000266068 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 29.1
GMEB2-201ENST00000266068 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
GMEB2-201ENST00000266068 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GMEB2-201ENST00000266068 IQGAP2Q13576 1575 aa17.84■□□□□ 0.45
GMEB2-201ENST00000266068 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.83■□□□□ 0.45
GMEB2-201ENST00000266068 HECW1Q76N89 1606 aa17.83■□□□□ 0.44
GMEB2-201ENST00000266068 FKBP8Q14318 412 aa17.82■□□□□ 0.44
GMEB2-201ENST00000266068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.81■□□□□ 0.44
GMEB2-201ENST00000266068 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.8■□□□□ 0.44
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GMEB2-201ENST00000266068 KCNH8Q96L42 1107 aa17.74■□□□□ 0.43
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GMEB2-201ENST00000266068 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.74■□□□□ 0.43
GMEB2-201ENST00000266068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GMEB2-201ENST00000266068 HFM1A2PYH4 1435 aa17.74■□□□□ 0.43
GMEB2-201ENST00000266068 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
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GMEB2-201ENST00000266068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 GRIN2AQ12879 1464 aa17.7■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 PTPRGP23470 1445 aa17.69■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 SYNJ2O15056 1496 aa17.67■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 ADAMTS12P58397 1594 aa17.66■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 FOXD1Q16676 465 aa17.66■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.65■□□□□ 0.42
GMEB2-201ENST00000266068 CCER2I3L3R5 266 aa17.65■□□□□ 0.42
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