RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262346.6

ANKRD13C-201, Transcript of ankyrin repeat domain 13C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD13C, Length 3,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13C-201ENST00000262346 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ANKRD13C-201ENST00000262346 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD13C-201ENST00000262346 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD13C-201ENST00000262346 NESP48681 1621 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD13C-201ENST00000262346 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ANKRD13C-201ENST00000262346 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD13C-201ENST00000262346 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD13C-201ENST00000262346 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ANKRD13C-201ENST00000262346 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.94■□□□□ 0.14
ANKRD13C-201ENST00000262346 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.92■□□□□ 0.14
ANKRD13C-201ENST00000262346 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.91■□□□□ 0.14
ANKRD13C-201ENST00000262346 BCANQ96GW7 911 aa15.91■□□□□ 0.14
ANKRD13C-201ENST00000262346 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.91■□□□□ 0.14
ANKRD13C-201ENST00000262346 TIAM1Q13009 1591 aa15.88■□□□□ 0.13
ANKRD13C-201ENST00000262346 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.86■□□□□ 0.13
ANKRD13C-201ENST00000262346 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.86■□□□□ 0.13
ANKRD13C-201ENST00000262346 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ANKRD13C-201ENST00000262346 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.84■□□□□ 0.13
ANKRD13C-201ENST00000262346 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
ANKRD13C-201ENST00000262346 TRIM52Q96A61 297 aa15.82■□□□□ 0.12
ANKRD13C-201ENST00000262346 MAPKBP1O60336 1514 aa15.82■□□□□ 0.12
ANKRD13C-201ENST00000262346 TOPBP1Q92547 1522 aa15.82■□□□□ 0.12
ANKRD13C-201ENST00000262346 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
ANKRD13C-201ENST00000262346 WDR97A6NE52 1622 aa15.78■□□□□ 0.12
ANKRD13C-201ENST00000262346 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 TONSLQ96HA7 1378 aa15.75■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 FOXD1Q16676 465 aa15.74■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.73■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.72■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 FKBP8Q14318 412 aa15.71■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
ANKRD13C-201ENST00000262346 PTPRKQ15262 1439 aa15.71■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.71■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 ANP32CO43423 234 aa15.7■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.7■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 FMN1Q68DA7 1419 aa15.68■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 PRDM2Q13029 1718 aa15.68■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.68■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 MAP3K1Q13233 1512 aa15.66■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.66■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 FBLN2P98095 1184 aa15.65■□□□□ 0.1
ANKRD13C-201ENST00000262346 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.16e-9■■■■■ 37.6
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.64■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 NCOA2Q15596 1464 aa15.62■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.6■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.59■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ANKRD13C-201ENST00000262346 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.58■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.58■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.57■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.57■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.57■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 NEFLP07196 543 aa15.56■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 NAIPQ13075 1403 aa15.56■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.56■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.56■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 HFM1A2PYH4 1435 aa15.53■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 UACAQ9BZF9 1416 aa15.53■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.53■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.53■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 CUL7Q14999 1698 aa15.52■□□□□ 0.08
ANKRD13C-201ENST00000262346 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.51■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.49■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 GRIN2BQ13224 1484 aa15.49■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC184Q52MB2 194 aa15.48■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.48■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.48■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.48■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.46■□□□□ 0.07
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCER2I3L3R5 266 aa15.45■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.44■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.44■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.43■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.42■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 SAMD9Q5K651 1589 aa15.4■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
ANKRD13C-201ENST00000262346 KDM6BO15054 1643 aa15.39■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.39■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.38■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 MRS2Q9HD23 443 aa15.38■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.36■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 IQGAP2Q13576 1575 aa15.35■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms