RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258062.9

REPS1-201, Transcript of RALBP1 associated Eps domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene REPS1, Length 3,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1-201ENST00000258062 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.75■■□□□ 1.39
REPS1-201ENST00000258062 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.73■■□□□ 1.39
REPS1-201ENST00000258062 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.71■■□□□ 1.39
REPS1-201ENST00000258062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.7■■□□□ 1.39
REPS1-201ENST00000258062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.69■■□□□ 1.38
REPS1-201ENST00000258062 MAPKBP1O60336 1514 aa23.67■■□□□ 1.38
REPS1-201ENST00000258062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.65■■□□□ 1.38
REPS1-201ENST00000258062 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.64■■□□□ 1.37
REPS1-201ENST00000258062 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.63■■□□□ 1.37
REPS1-201ENST00000258062 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
REPS1-201ENST00000258062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.54■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.54■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 KCNH8Q96L42 1107 aa23.53■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 TOPBP1Q92547 1522 aa23.53■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.52■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
REPS1-201ENST00000258062 NESP48681 1621 aa23.51■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.49■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 WDR97A6NE52 1622 aa23.48■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.46■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.45■■□□□ 1.35
REPS1-201ENST00000258062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.42■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 FMN1Q68DA7 1419 aa23.41■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.39■■□□□ 1.34
REPS1-201ENST00000258062 CUL7Q14999 1698 aa23.39■■□□□ 1.33
REPS1-201ENST00000258062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
REPS1-201ENST00000258062 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.38■■□□□ 1.33
REPS1-201ENST00000258062 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.33■■□□□ 1.33
REPS1-201ENST00000258062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.32■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 MYT1Q01538 1121 aa23.3■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 TONSLQ96HA7 1378 aa23.29■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 PTPRKQ15262 1439 aa23.28■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.27■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.27■■□□□ 1.32
REPS1-201ENST00000258062 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 ANP32CO43423 234 aa23.24■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 HFM1A2PYH4 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 NCOA2Q15596 1464 aa23.23■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 UACAQ9BZF9 1416 aa23.21■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.21■■□□□ 1.31
REPS1-201ENST00000258062 BCANQ96GW7 911 aa23.19■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 SAMD9Q5K651 1589 aa23.19■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 GRIN2BQ13224 1484 aa23.19■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.18■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.18■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 NAIPQ13075 1403 aa23.18■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.17■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 CCER2I3L3R5 266 aa23.17■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 FKBP8Q14318 412 aa23.16■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.15■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.15■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 TRIM52Q96A61 297 aa23.15■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.15■■□□□ 1.3
REPS1-201ENST00000258062 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.13■■□□□ 1.29
REPS1-201ENST00000258062 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.1■■□□□ 1.29
REPS1-201ENST00000258062 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
REPS1-201ENST00000258062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
REPS1-201ENST00000258062 ARID3CA6NKF2 412 aa23.07■■□□□ 1.28
REPS1-201ENST00000258062 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.05■■□□□ 1.28
REPS1-201ENST00000258062 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.05■■□□□ 1.28
REPS1-201ENST00000258062 NEFLP07196 543 aa23.04■■□□□ 1.28
REPS1-201ENST00000258062 ARHGEF11O15085 1522 aa23■■□□□ 1.27
REPS1-201ENST00000258062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
REPS1-201ENST00000258062 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
REPS1-201ENST00000258062 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.96■■□□□ 1.27
REPS1-201ENST00000258062 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
REPS1-201ENST00000258062 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.94■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 HECW1Q76N89 1606 aa22.93■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.92■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 FOXD1Q16676 465 aa22.92■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 IQGAP2Q13576 1575 aa22.91■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.91■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
REPS1-201ENST00000258062 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 KDM6BO15054 1643 aa22.88■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.88■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 MIA2Q96PC5 1412 aa22.88■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 AKNAQ7Z591 1439 aa22.86■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 PBRM1Q86U86 1689 aa22.85■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.85■■□□□ 1.25
REPS1-201ENST00000258062 ADAMTS12P58397 1594 aa22.83■■□□□ 1.24
REPS1-201ENST00000258062 WDR62O43379 1518 aa22.82■■□□□ 1.24
REPS1-201ENST00000258062 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
REPS1-201ENST00000258062 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 DAPK1P53355 1430 aa22.76■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.74■■□□□ 1.23
REPS1-201ENST00000258062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms