RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228918.8

LTBR-201, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBR, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-201ENST00000228918 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.82■■□□□ 1.4
LTBR-201ENST00000228918 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
LTBR-201ENST00000228918 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.81■■□□□ 1.4
LTBR-201ENST00000228918 TOPBP1Q92547 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
LTBR-201ENST00000228918 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.77■■□□□ 1.4
LTBR-201ENST00000228918 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
LTBR-201ENST00000228918 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.76■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 ITGAEP38570 1179 aa23.76■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 MAPKBP1O60336 1514 aa23.75■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 CUL7Q14999 1698 aa23.74■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.74■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.74■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.71■■□□□ 1.39
LTBR-201ENST00000228918 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.69■■□□□ 1.38
LTBR-201ENST00000228918 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.69■■□□□ 1.38
LTBR-201ENST00000228918 NESP48681 1621 aa23.68■■□□□ 1.38
LTBR-201ENST00000228918 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.68■■□□□ 1.38
LTBR-201ENST00000228918 WDR97A6NE52 1622 aa23.67■■□□□ 1.38
LTBR-201ENST00000228918 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.389e-7■■■■□ 24.8
LTBR-201ENST00000228918 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.64■■□□□ 1.37
LTBR-201ENST00000228918 P3H3Q8IVL6 736 aa23.63■■□□□ 1.37
LTBR-201ENST00000228918 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.6■■□□□ 1.37
LTBR-201ENST00000228918 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.55■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 FMN1Q68DA7 1419 aa23.54■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.53■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LTBR-201ENST00000228918 SAMD9Q5K651 1589 aa23.51■■□□□ 1.35
LTBR-201ENST00000228918 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.5■■□□□ 1.35
LTBR-201ENST00000228918 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.45■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.45■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.43■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.42■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.4■■□□□ 1.34
LTBR-201ENST00000228918 GRIN2BQ13224 1484 aa23.38■■□□□ 1.33
LTBR-201ENST00000228918 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.38■■□□□ 1.33
LTBR-201ENST00000228918 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.38■■□□□ 1.33
LTBR-201ENST00000228918 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.37■■□□□ 1.33
LTBR-201ENST00000228918 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.33■■□□□ 1.33
LTBR-201ENST00000228918 NCOA2Q15596 1464 aa23.33■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.33■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 HFM1A2PYH4 1435 aa23.32■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.32■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 PTPRKQ15262 1439 aa23.31■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.3■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 UACAQ9BZF9 1416 aa23.27■■□□□ 1.32
LTBR-201ENST00000228918 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 PBRM1Q86U86 1689 aa23.25■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 ARHGEF11O15085 1522 aa23.25■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.25■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 NAIPQ13075 1403 aa23.23■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.22■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 KCNH8Q96L42 1107 aa23.21■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LTBR-201ENST00000228918 HECW1Q76N89 1606 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-201ENST00000228918 TONSLQ96HA7 1378 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBR-201ENST00000228918 ADAMTS12P58397 1594 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-201ENST00000228918 IQGAP2Q13576 1575 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-201ENST00000228918 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LTBR-201ENST00000228918 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.14■■□□□ 1.29
LTBR-201ENST00000228918 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LTBR-201ENST00000228918 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBR-201ENST00000228918 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
LTBR-201ENST00000228918 WDR62O43379 1518 aa23.08■■□□□ 1.28
LTBR-201ENST00000228918 AKNAQ7Z591 1439 aa23.07■■□□□ 1.28
LTBR-201ENST00000228918 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
LTBR-201ENST00000228918 CCER2I3L3R5 266 aa23.05■■□□□ 1.28
LTBR-201ENST00000228918 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LTBR-201ENST00000228918 MIA2Q96PC5 1412 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-201ENST00000228918 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LTBR-201ENST00000228918 ANP32CO43423 234 aa23■■□□□ 1.27
LTBR-201ENST00000228918 KDM6BO15054 1643 aa22.99■■□□□ 1.27
LTBR-201ENST00000228918 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-201ENST00000228918 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.95■■□□□ 1.26
LTBR-201ENST00000228918 KIAA0556O60303 1618 aa22.93■■□□□ 1.26
LTBR-201ENST00000228918 IFT140Q96RY7 1462 aa22.93■■□□□ 1.26
LTBR-201ENST00000228918 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LTBR-201ENST00000228918 DISP1Q96F81 1524 aa22.89■■□□□ 1.26
LTBR-201ENST00000228918 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.89■■□□□ 1.26
LTBR-201ENST00000228918 TRIM52Q96A61 297 aa22.87■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.85■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 DAPK1P53355 1430 aa22.85■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 ROCK1Q13464 1354 aa22.85■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 ARID3CA6NKF2 412 aa22.84■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.84■■□□□ 1.25
LTBR-201ENST00000228918 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.82■■□□□ 1.24
LTBR-201ENST00000228918 GRIN2AQ12879 1464 aa22.81■■□□□ 1.24
LTBR-201ENST00000228918 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LTBR-201ENST00000228918 FKBP8Q14318 412 aa22.81■■□□□ 1.24
LTBR-201ENST00000228918 ABCC5O15440 1437 aa22.8■■□□□ 1.24
LTBR-201ENST00000228918 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms